RAF1

RAF1 („RAF proto-onkogen serin/threonin-proteinkináza“; RAF  proto-onkogen serin/threonin-proteinkináza ; EC : 2.7.11.25), nebo c-RAF („proto-onkogen c-RAF“; anglicky  proto - onkogen c-RAF ) je cytosolická serin/threonin proteinkináza z rodiny MAP3K [1] . Produkt genu RAF1 [2] [3] . Je součástí signální dráhy ERK1/2 jako mitogenem aktivovaná proteinkináza MAP3K, která působí downstream od rodiny Ras membránově vázaných GTPáz [ 4] . Raf1 je členem rodiny Raf serin/threonin protein kináz.

Objev

První gen Raf, v-Raf , byl objeven v roce 1983. Byl izolován z myšího retroviru 3611. Brzy se ukázalo, že tento protein je schopen transformovat fibroblasty na rakovinnou buněčnou linii, a tak dostal název virem indukovaný rychle se šířící fibrosarkom neboli v-Raf (Virus-induced Rapidly Accelerated Fibrosarkom; V-RAF) [2] . O rok později, v roce 1984, byl objeven další transformující gen v ptačím retroviru MH2 a pojmenován v-Mil. Ukázalo se, že je extrémně podobný v-Raf [5] . Ukázalo se, že oba otevřené geny kódují produkt s aktivitou serin-threonin kinázy [6] . Homology v-Raf a v-Mil byly brzy nalezeny v myších a kuřecích genomech, které byly pojmenovány c-Raf z Raf buněčného ( buněčného ) genu . Ukázalo se, že c-Raf hraje roli v regulaci buněčného růstu a dělení [7] [8] . Nyní je známo, že c-Raf je základem signální dráhy ERK1/2 , první popsané signální dráhy pro mitogenem aktivované MAPK kinázy [9] . Působí jako mitogenem aktivovaná kináza, která spouští celou následnou kinázovou kaskádu. Normální buněčné c-Raf geny mohou mutovat a přeměnit se na onkogeny zvýšením aktivit MEK1/2 a ERK1/2 [10] .

Struktura

Lidský gen RAF1 se nachází na 3. chromozomu . Alternativní sestřih vede k vytvoření dvou proteinových izoforem s pouze malým rozdílem mezi variantami. Hlavní varianta proteinkinázy je kratší a skládá se z 648 aminokyselin [11] .

Stejně jako mnoho jiných proteinkináz MAP3K je c-Raf vícedoménový protein s několika dalšími doménami, které jsou zodpovědné za regulaci jeho katalytické aktivity. Na N -konci proteinu jsou vedle sebe Ras - vazebná doména ( RBD ) a homolog 1 C- kinázové domény ( C1 ). Byla studována struktura obou domén a ukázal se mechanismus regulace c-Raf .

Doména vázající Ras obsahuje oblast podobnou ubikvitinu jako mnoho jiných domén vázající G protein . Specificky se váže pouze na proteiny Ras asociované s GTP [12] [13] [14] .

Doména C1 proteinu c-Raf se nachází bezprostředně za RBD a je to zinkový prst obohacený cysteinem stabilizovaný 2 ionty zinku . Je podobný diacylglycerol -vazebným C1 doménám proteinů rodiny proteinkinázy C ( PKC ) [15] [16] . Na rozdíl od PKC však doména C1 v c-Raf neváže diacylglycerol [17] . Vážou další lipidy jako ceramid [17] nebo kyselinu fosfatidovou [18] a navíc usnadňují rozpoznání aktivovaného GTP vázaného Ras (GTP-Ras) [16] [19] .

Těsná blízkost dvou regulačních domén a experimentální data naznačují, že působí koordinovaně jako jediný prvek, který negativně reguluje aktivitu c-Raf kinázové domény prostřednictvím fyzické interakce [20] . Historicky je autoinhibiční blok označován jako oblast CR1 , spojovací místo je CR2 a kinázová doména je CR3 .

Mezi autoinhibiční doménou a doménou katalytické kinázy je dlouhý segment obohacený o serin , jehož aminokyselinová sekvence se mezi geny Raf velmi liší. Tento region je vnitřně nestrukturovaný a velmi mobilní. Zjevně slouží jako „závěs“ mezi dvěma rigidními strukturálními doménami, což umožňuje významné konformační přeuspořádání v molekule kinázy [21] . Tato pantová oblast však obsahuje jeden malý, konzervovaný motiv, který je zodpovědný za rozpoznání regulačního proteinu 14-3-3 , když je fosforylován kritický serinový zbytek (u lidí serin-259) v molekule c-Raf. Kromě toho je druhý podobný motiv v c-Raf umístěn na C-konci za kinázovou doménou.

C-koncová polovina c-Raf je obsazena katalytickou doménou. Struktura těchto domén byla dobře studována jak u c-Raf [22] , tak u B-Raf [23] . Kinázová doména c-Raf je podobná jako u jiných Raf kináz a KSR proteinů a podobá se katalytické doméně několika dalších MAP3K kináz, včetně rodiny kináz MLK . Společně tyto enzymy tvoří skupinu TKL kináz (proteiny podobné tyrosinkináze). Ačkoli tyto proteiny sdílejí některé z charakteristik tyrosinkináz , aktivita TKL proteinů je omezena na fosforylaci serinu a threoninu pouze určitých cílových proteinů. Nejdůležitějšími substráty pro Raf  kinázy jsou MKK1 a MKK2 kinázy , jejichž aktivita je přísně regulována touto fosforylací proteiny Raf .

Evoluce Raf kináz

Lidský protein c-Raf patří do rodiny příbuzných proteinkináz. Dva další členové skupiny nalezené u většiny obratlovců jsou B-Raf a A-Raf . Všechny tři proteiny jsou podobné ve své doménové architektuře, struktuře a regulaci. Na rozdíl od dobře prostudovaných c-Raf a B-Raf nejsou přesné funkce druhého člena skupiny A-Raf známy, i když se očekává, že budou podobné. Všechny tři geny této skupiny se zdají být produkty duplikace prekurzorového genu Raf nebo celého genomu na úsvitu evoluce obratlovců. Většina ostatních organismů má jediný gen Raf . Například u ovocné mušky Drosophila je to gen Phl nebo Draf [24] , zatímco u C. elegans je to  gen Lin-45 [25] .

Mnohobuněčné organismy mají typ kinázy blízce příbuzné Raf ,  supresoru kinázy Ras ( KSR ). Obratlovci mají dva paralogy genu KSR : KSR1 a KSR2 . Jejich C-terminální kinázová doména je podobná jako Raf , ale jejich N-terminální regulační doména je odlišná. Ačkoli KSR má také pantovou oblast , postrádá doménu vázající Ras . Místo posledně jmenovaného existuje jedinečná regulační doména CA1 . Struktura byla odhalena v roce 2012 a obsahuje doménu motivu SAM s další dvouvláknovou oblastí ( coiled coil ), tzv. CC-SAM , který pomáhá proteinům KSR při vazbě na membránu [26] . KSR , jako Rafs , obsahují duální 14-3-3 protein vázající motiv vyžadující fosforylaci, ale také obsahují další MAPK - vazebné motivy na pantu. Typická sekvence posledně jmenovaného, ​​-FxFP-, hraje důležitou roli v regulaci Raf kináz v signálních drahách ERK1/2. KSR jsou zapojeny do stejných signálních drah jako Raf kinázy , ale hrají pouze vedlejší roli. Jejich vnitřní kinázová aktivita je tak nízká, že byly dlouhou dobu považovány za neaktivní [27] [28] . Jejich role ve fosforylaci je nevýznamná a KSR jsou zjevně hlavně partnery v heterodimerizaci s Raf kinázami , které je významně aktivují díky alosterickému účinku. Podobné účinky byly popsány pro další MAP3K kinázy. Například ASK2 má sám o sobě nízkou enzymatickou aktivitu a jeho působení je spojeno s tvorbou heterodimeru ASK1 /ASK2 [29] .

Kinasy podobné Raf v houbách zcela chybí. Nicméně u jiných zadních bičíků (zejména v Capsaspora owczarzaki ) byly nalezeny geny kinázy Raf , což potvrzuje jejich přítomnost v jednobuněčných eukaryotech. To naznačuje, že proteiny Raf mají prastarou evoluční historii a houby mohly později gen Raf ztratit. U hub jsou signální dráhy podobné ERK1/2 zprostředkovány jinými kinázami podobnými MEKK ( Ste11 v kvasinkách).

Naopak virové Raf kinázy ( v-Raf ) jsou sekundární výpůjčky genů obratlovců od jejich hostitelských organismů. Tyto geny jsou významně zkrácené verze, které postrádají autoinhibiční N-terminální doménu a 14-3-3-vazebné motivy, což vede k nekontrolované aktivitě virové Raf kinázy, která je nezbytná pro účinnou reprodukci viru.

Regulace činnosti

Aktivita c-Raf je vysoce regulována. Jako hlavní spouštěcí signál signální dráhy ERK1/2  je aktivace c-Raf chráněna mnoha inhibičními mechanismy a za normálních okolností nemůže být protein aktivován pouze v důsledku jediného kroku. Nejdůležitějším regulačním mechanismem je přímá fyzikální interakce N-terminálního c-Raf autoinhibičního bloku s jeho kinázovou doménou. V důsledku toho je katalytické místo proteinu fyzicky uzavřeno a enzymatická aktivita kinázy je zcela zablokována [20] . Tato "uzavřená" forma může být změněna pouze v případě, že autoinhibiční blok proteinu interaguje s partnerským proteinem, který soutěží s jeho vlastní kinázovou doménou, hlavně GTP-vázaným Ras . Takto aktivované G-proteiny mohou narušit intramolekulární interakci, která v důsledku změní konformaci c-Raf a přemění ji na „otevřenou“ formu [32] nezbytnou pro aktivaci kinázy a vazbu substrátu.

Protein 14-3-3 také přispívá k autoinhibici c-Raf . Je známo, že 14-3-3 proteiny tvoří dimery a mají tedy dvě vazebná místa [33] . Díky tomu působí dimer 14-3-3 jako "molekulární zámek" a udržuje proteiny potenciálního vazebného partnera v bezpečné vzdálenosti a orientaci od c-Raf . Dimer 14-3-3 (zejména 14-3-3ζ ), který je zapojen do interakce s c-Raf , uzamkne kinázu v „uzavřeném“ stavu a neumožňuje oddělení autoinhibičních a katalytických domén. proteinu [34] . Toto "uzamčení" c-Raf , stejně jako ostatní zástupci Raf a KSR , je řízeno fosforylací 14-3-3-vazebného motivu v "pantové" oblasti proteinu. Je nemožné bez předchozí fosforylace určitých serinů (u lidského c-Raf jsou to seriny 259 a 621) jinými proteinkinázami. Nejdůležitější z těchto kináz je MAP3K7/TAK1 a enzymy odpovědné za defosforylaci těchto aminokyselin jsou fosfatáza PP1 a komplex fosfatázy PP2A [35] [36] .

Samotná vazba 14-3-3 na Raf není nutně inhibičním faktorem. Když je Raf ve své otevřené formě a tvoří dimer, 14-3-3 se může vázat na Raf v trans konfiguraci a tak uzamknout kinázu do její dimerní formy místo toho, aby této interakci bránilo jejich vzájemným oddělením [37] . Existují také některé další formy interakce 14-3-3 s Raf, ale jejich role není známa [38] .

Dimerizace c-Raf je dalším důležitým mechanismem pro regulaci aktivity kinázy a vyžaduje fosforylaci aktivační smyčky proteinu. Normálně se dimerizace účastní pouze otevřené kinázové domény. Na rozdíl od B-Raf, který tvoří homodimer, c-Raf přednostně tvoří heterodimer s B-Raf nebo KSR1. Nicméně homo- a heterodimery fungují podobným způsobem [28] .

Fosforylace aktivační smyčky c-Raf je nezbytným krokem k dosažení plné aktivity a stabilizaci aktivní konformace. Jediné známé kinázy, které to dokážou, jsou samotné kinázy rodiny Raf. Ačkoli některé další kinázy, jako je PAK1, jsou schopny fosforylovat aminokyselinové zbytky umístěné v blízkosti c-Raf kinázové domény, role těchto udržovačů není známa. Aktivační smyčka c-Raf může být transfosforylována buď jinou molekulou c-Raf nebo KSR1. Kvůli strukturním rysům dimerů se taková fosforylace může vyskytovat výhradně v trans konfiguraci (to znamená, že kinázy jednoho dimeru mohou fosforylovat pouze zbytky jiného dimeru, když tvoří intermediární čtyřmolekulární komplex) [39] . Po interakci s argininovými a lysinovými zbytky kinázové domény změní fosforylovaná aktivační smyčka svou konformaci na přísně uspořádanou formu a uzavře kinázovou doménu v plně aktivované formě, dokud není smyčka defosforylována. V tomto případě se kinázová doména stává necitlivou k autoinhibiční doméně [40] . KSR postrádají fosforylační místa v aktivační smyčce, takže těmto proteinům chybí poslední krok aktivace, ale to již není podstatné, protože aktivovaná Raf kináza je již schopna rozpoznat svůj substrát [41] . Jako většina proteinkináz má c-Raf několik možných substrátů. c-Raf přímo fosforyluje BAD [42] , několik typů adenylát cykláz [43] , fosfatázu lehkého řetězce myosinu (MYPT) [44] , troponin (TnTc) [45] a několik dalších, včetně retinoblastomového proteinu (pRb) a Cdc25 fosfatázy [46] .

Nejdůležitějšími cíli Raf kinázy jsou MKK1(MEK1) a MKK2(MEK2) . Přestože struktura komplexu enzym-substrát c-Raf:MKK1 není známa, lze ji modelovat pomocí komplexu KSR2:MKK1 [28] . Ačkoli je samotný komplex KSR2:MKK1 neaktivní, předpokládá se, že je velmi blízko tomu, jak Raf váže substrát. Hlavní interakční interfáze je tvořena C-koncovými oblastmi obou kinázových domén. Velká neuspořádaná smyčka bohatá na prolin , jedinečná pro MKK1 a MKK2 , také hraje důležitou roli ve správné orientaci Raf (nebo KSR) [47] . V důsledku reakce, po navázání na Raf, jsou MKK1 nebo MKK2 fosforylovány ve dvou polohách v jejich aktivační smyčce a samy se stávají aktivními. Cíle těchto MKK1 nebo MKK2 kináz v následné kinázové kaskádě jsou ERK1 a ERK2, v daném pořadí. ERK kinázy jsou schopny působit na četné substráty v buňce. Navíc po translokaci do jádra jsou schopny stimulovat jaderné transkripční faktory . Aktivované ERK jsou pleiotropní efektory buněčné fyziologie a hrají důležitou roli při kontrole exprese genů zapojených do buněčného dělení, migrace, inhibice apoptózy a diferenciace.

Patologie

Mutace se zvýšenou aktivitou

Dědičné mutace se zvýšenou aktivitou c-Raf jsou poměrně vzácné, ale vedou k vážným syndromům. Nejčastěji jsou takové poruchy způsobeny bodovými mutacemi v jednom ze dvou vazebných míst 14-3-3 [48] [49] . Mutace c-Raf jsou jednou z příčin Noonanova syndromu , jehož charakteristické rysy jsou: vrozené srdeční vady , malý vzrůst, dysmorfismus a další poruchy. Podobná porušení mohou způsobit i tzv. LEOPARDNÍ syndrom s komplexem defektů.

Role v rakovině

Ačkoli c-Raf může za experimentálních podmínek mutovat a příležitostně se vyskytuje v lidských nádorech [50] [51] , hraje B-Raf kináza hlavní roli v lidské tumorigenezi [52] .

Asi 20 % lidských nádorů obsahuje mutovaný gen B-Raf [53] . Nejběžnější mutace zahrnuje nahrazení valinu-600 kyselinou glutamovou, jejíž produkt (BRAF-V600E) lze zobrazit pomocí histochemické analýzy pro molekulárně klinickou diagnostiku [54] [55] . Tato změna je strukturně podobná fosforylované formě aktivační smyčky proteinu a odstraněním jednoho z inhibičních mechanismů vede k rychlé úplné aktivaci kinázy [56] . Vzhledem k tomu, že B-Raf může být aktivován po vytvoření homodimeru nebo heterodimeru s c-Raf, vede taková mutace ke katastrofickým následkům, čímž se signální dráha ERK1/2 stává trvale aktivní a vede k nekontrolovanému procesu dělení buněk [57] .

Terapeutický cíl

Důležitá role mutací v genech Ras a B-Raf v onkogenezi vysvětluje jejich roli jako potenciálních cílů protinádorové terapie, konkrétně mutace B-Raf V600E takovým cílem je. Specifický inhibitor Sorafenib byl prvním takovým klinicky užitečným prostředkem, který se stal farmakologickou alternativou pro léčbu dříve obecně neléčitelných rakovin, jako je karcinom ledviny a melanom [58] . Další taková činidla zahrnují Vemurafenib , Regorafenib , Dabrafenib a další.

Tyto inhibitory B-Raf však mohou mít nepříznivý účinek na nádory závislé na K-Ras, protože jsou příliš selektivní na to, aby působily pouze na B-Raf. Účinně inhibují aktivitu B-Raf, když je mutace B-Raf hlavní příčinou nádoru. Ale také zvyšují homodimerizaci B-Raf a její heterodimerizaci s c-Raf, což má za následek zvýšenou aktivaci c-Raf, pokud nejsou žádné mutace v genech Raf, ale existuje mutace v genu jejich aktivátoru K-Ras [22 ] . Tato paradoxní aktivace vyžaduje před zahájením terapie inhibitory B-Raf předběžnou genetickou diagnózu [59] .

Interakce

C-Raf interaguje s řadou buněčných proteinů, včetně následujících:

• AKT1 [60] ,
• ASK1 [61] ,
• BAG1 [62] ,
• BRAF [63] ,
• Bcl-2 [64] ,
• CDC25A [65] [66] ,
• CFLAR [67] ,
• FYN [68] ,
• GRB10 [69] [70] ,
• HRAS [71] [72] [73] [74] [75] [76] [77] [78] [79] [80] [81] [82] [83] [84] [85] [86] [ 87] ,
• HSP90AA1 [88] [89] ,
• KRAS [76] [77] ,
• MAP2K1 [90] ,
• MAP3K1 [91] ,
• MAPK7 [92] ,
• MAPK8IP3 [93] [94] ,
• PAK1 [95] ,
• PEBP1 [90] ,
• PHB [96] ,
• PRKCZ [97] ,
• RAP1A [12] [81] [98] [99 ]
• RHEB [100] [101] [102] ,
• RRAS2 [76] [103] ,
• rb1 [96] [104] ,
• RBL2 [104] ,
• SHOC2 [76] ,
• STUB1 [88] ,
• Src [68] ,
• TSC22D3 [105] ,
• YWHAB [75] [97] [106] [107] [108] [109] ,
• YWHAE [108] [109] ,
• YWHAG [97] [110] [111] ,
• YWHAH [97] [108] [112] ,
• YWHAQ [90] [97] [110] [113] ,
• YWHAZ [97] [114] [115] [116] [117] .

Literatura

• Reed JC, Zha H., Aime-Sempe C., Takayama S., Wang HG Strukturně-funkční analýza proteinů rodiny Bcl-2. Regulátory programované buněčné smrti  //  Pokroky v experimentální medicíně a biologii : deník. - Springer Nature , 1997. - Sv. 406 . - str. 99-112 . - doi : 10.1007/978-1-4899-0274-0_10 . — PMID 8910675 .
• Geyer M., Fackler OT, Peterlin BM Vztahy mezi strukturou a funkcí u HIV-1 Nef  // EMBO Rep  . : deník. - 2001. - Sv. 2 , ne. 7 . - str. 580-585 . - doi : 10.1093/embo-reports/kve141 . — PMID 11463741 .
• Dhillon AS, Kolch W. Untying  the Regulation of the Raf-1 kinase  // Archives of Biochemistry and Biophysics : deník. - Elsevier , 2002. - Sv. 404 , č.p. 1 . - str. 3-9 . - doi : 10.1016/S0003-9861(02)00244-8 . — PMID 12127063 .
• Greenway AL, Holloway G., McPhee DA, Ellis P., Cornall A., Lidman M. HIV-1 Nef kontrola buněčných signálních molekul: více strategií na podporu replikace viru  // J. Biosci  . : deník. - 2004. - Sv. 28 , č. 3 . - str. 323-335 . - doi : 10.1007/BF02970151 . — PMID 12734410 .
• Chen H., Kunnimalaiyaan M., Van Gompel JJ Medulární rakovina štítné žlázy: funkce raf-1 a human achaete-scute homologue-1  (anglicky)  // Thyroid: journal. - 2006. - Sv. 15 , č. 6 . - str. 511-521 . - doi : 10.1089/thy.2005.15.511 . — PMID 16029117 .

Poznámky

1. ↑ Li P., Wood K., Mamon H., Haser W., Roberts T. Raf-1: kináza v současné době bez příčiny, ale nepostrádající účinky  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1991. - Únor ( roč. 64 , č. 3 ). - str. 479-482 . - doi : 10.1016/0092-8674(91)90228-Q . — PMID 1846778 .
2. ↑ 1 2 Rapp UR, Goldsborough MD, Mark GE, Bonner TI, Groffen J., Reynolds FH, Stephenson JR Struktura a biologická aktivita v-raf, jedinečného onkogenu transdukovaného retrovirem   // Proceedings of the National Academy of Sciences of Spojené státy americké  : časopis. - 1983. - Červenec ( roč. 80 , č. 14 ). - str. 4218-4222 . - doi : 10.1073/pnas.80.14.4218 . - . — PMID 6308607 .
3. ↑ Bonner T., O'Brien SJ, Nash WG, Rapp UR, Morton CC, Leder P. Lidské homology onkogenu raf (mil) se nacházejí na lidských chromozomech 3 a 4  //  Science : journal. - 1984. - Leden ( roč. 223 , č. 4631 ). - str. 71-4 . - doi : 10.1126/science.6691137 . - . — PMID 6691137 .
4. ↑ Entrez Gen: RAF1 v-raf-1 homolog virového onkogenu myší leukémie 1 . Archivováno z originálu 10. dubna 2010. (neurčitý)
5. ↑ Sutrave P., Bonner TI, Rapp UR, Jansen HW, Patschinsky T., Bister K. Nukleotidová sekvence ptačího retrovirového onkogenu v-mil: homolog myšího retrovirového onkogenu v-raf   // Nature . - 1984. - Sv. 309 , č.p. 5963 . - S. 85-8 . - doi : 10.1038/309085a0 . — . — PMID 6325930 .
6. ↑ Moelling K., Heimann B., Beimling P., Rapp UR, Sander T. Serin- a threonin-specifické proteinkinázové aktivity eliminovaných proteinů gag-mil a gag-raf  //  Nature: journal. - 1984. - Sv. 312 , č.p. 5994 . - S. 558-561 . - doi : 10.1038/312558a0 . — . — PMID 6438534 .
7. ↑ Kolch W., Heidecker G., Lloyd P., Rapp UR Raf-1 proteinkináza je nutná pro růst indukovaných buněk NIH/3T3  //  Nature : journal. - 1991. - leden ( roč. 349 , č. 6308 ). - str. 426-428 . - doi : 10.1038/349426a0 . - . — PMID 1992343 .
8. ↑ Mark GE, Rapp UR Primární struktura v-raf: příbuznost s rodinou onkogenů src  //  Science : journal. - 1984. - Duben ( roč. 224 , č. 4646 ). - str. 285-289 . - doi : 10.1126/science.6324342 . - . — PMID 6324342 .
9. ↑ Kyriakis JM, App H., Zhang XF, Banerjee P., Brautigan DL, Rapp UR, Avruch J. Raf-1 aktivuje MAP kinázu-kinázu   // Nature . - 1992. - Červenec ( roč. 358 , č. 6385 ). - str. 417-421 . - doi : 10.1038/358417a0 . - . — PMID 1322500 .
10. ↑ Shimizu K., Nakatsu Y., Nomoto S., Sekiguchi M. Struktura aktivovaného genu c-raf-1 z rakoviny lidského žaludku   // Int . Symp. Princezna Takamatsu Cancer Res. Fond: časopis. - 1986. - Sv. 17 . - S. 85-91 . — PMID 2843497 .
11. ↑ Dozier C., Ansieau S., Ferreira E., Coll J., Stehelin D. Alternativně sestřižená c-mil/raf mRNA je převážně exprimována v kuřecích svalových tkáních a uchovávána mezi druhy obratlovců  (anglicky)  // Oncogene : deník. - 1991. - Srpen ( ročník 6 , č. 8 ). - S. 1307-1311 . — PMID 1886707 .
12. ↑ 1 2 Nassar N., Horn G., Herrmann C., Scherer A., ​​​​McCormick F., Wittinghofer A. Krystalová struktura 2,2 A Ras-vazebné domény serin/threonin kinázy c-Raf1 v komplexu s Rap1A a analogem GTP  (anglicky)  // Nature : journal. - 1995. - Červen ( roč. 375 , č. 6532 ). - S. 554-560 . - doi : 10.1038/375554a0 . — . — PMID 7791872 .
13. ↑ Emerson SD, Madison VS, Palermo RE, Waugh DS, Scheffler JE, Tsao KL, Kiefer SE, Liu SP, Fry DC Struktura řešení Ras-vazebné domény c-Raf-1 a identifikace jeho Ras interakčního povrchu  .)  // Biochemie : časopis. - 1995. - Květen ( roč. 34 , č. 21 ). - S. 6911-6918 . doi : 10.1021 / bi00021a001 . — PMID 7766599 .
14. ↑ Moodie SA, Willumsen BM, Weber MJ, Wolfman A. Complexes of Ras.GTP with Raf-1 and mitogen-activated protein kinase kinase  //  Science : journal. - 1993. - Červen ( roč. 260 , č. 5114 ). - S. 1658-1661 . - doi : 10.1126/science.8503013 . - . — PMID 8503013 .
15. ↑ Mott HR, Carpenter JW, Zhong S., Ghosh S., Bell RM, Campbell SL Struktura roztoku domény bohaté na cystein Raf-1: nové vazebné místo ras a fosfolipidů   // Proceedings of the National Academy of Sciences of Spojené státy americké  : časopis. - 1996. - Srpen ( roč. 93 , č. 16 ). - S. 8312-8317 . - doi : 10.1073/pnas.93.16.8312 . - . — PMID 8710867 .
16. ↑ 1 2 Daub M., Jöckel J., Quack T., Weber CK, Schmitz F., Rapp UR, Wittinghofer A., ​​​​Block C. Doména bohatá na cystein RafC1 obsahuje více odlišných regulačních epitopů, které kontrolují závislé na Ras Aktivace Raf  (anglicky)  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 1998. - Listopad ( roč. 18 , č. 11 ). - S. 6698-6710 . - doi : 10.1128/mcb.18.11.6698 . — PMID 9774683 .
17. ↑ 1 2 Yin X., Zafrullah M., Lee H., Haimovitz-Friedman A., Fuks Z., Kolesnick R. C1 doména vázající ceramid zprostředkovává supresor kinázy ras membránové translokace  (anglicky)  // Cell. fyziol. Biochem. : deník. - 2009. - Sv. 24 , č. 3-4 . - S. 219-230 . - doi : 10.1159/000233248 . — PMID 19710537 .
18. ↑ Kraft CA, Garrido JL, Fluharty E., Leiva-Vega L., Romero G. Role of phosphatidic acid in the coupling of ERK cascade  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2008. - prosinec ( roč. 283 , č. 52 ). - S. 36636-36645 . - doi : 10.1074/jbc.M804633200 . — PMID 18952605 .
19. ↑ Brtva TR, Drugan JK, Ghosh S., Terrell RS, Campbell-Burk S., Bell RM, Der CJ Dvě odlišné domény Raf zprostředkovávají interakci s Ras  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1995. - Duben ( roč. 270 , č. 17 ). - S. 9809-9812 . doi : 10.1074/ jbc.270.17.9809 . — PMID 7730360 .
20. ↑ 1 2 Cutler RE, Stephens RM, Saracino MR, Morrison DK Autoregulace Raf-1 serin  / threonin kinázy  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1998. - Srpen ( roč. 95 , č. 16 ). - S. 9214-9219 . - doi : 10.1073/pnas.95.16.9214 . - . — PMID 9689060 .
21. ↑ Hmitou I., Druillennec S., Valluet A., Peyssonnaux C., Eychène A. Diferenciální regulace izoforem B-raf fosforylačními a autoinhibičními mechanismy   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2007. - Leden ( roč. 27 , č. 1 ). - str. 31-43 . - doi : 10.1128/MCB.01265-06 . — PMID 17074813 .
22. ↑ 1 2 Hatzivassiliou G., Song K., Yen I., Brandhuber BJ, Anderson DJ, Alvarado R., Ludlam MJ, Stokoe D., Gloor SL, Vigers G., Morales T., Aliagas I., Liu B. , Sideris S., Hoeflich KP, Jaiswal BS, Seshagiri S., Koeppen H., Belvin M., Friedman LS, Malek S. Inhibitory RAF primují RAF divokého typu k aktivaci dráhy MAPK a posílení růstu  (anglicky)  // Nature : deník. - 2010. - březen ( roč. 464 , č. 7287 ). - str. 431-435 . - doi : 10.1038/nature08833 . — . — PMID 20130576 .
23. ↑ Wan PT, Garnett MJ, Roe SM, Lee S., Niculescu-Duvaz D., Good VM, Jones CM, Marshall CJ, Springer CJ, Barford D., Marais R. Mechanismus aktivace signální dráhy RAF-ERK pomocí onkogenní mutace B-RAF  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 2004. - Březen ( roč. 116 , č. 6 ). - S. 855-867 . - doi : 10.1016/S0092-8674(04)00215-6 . — PMID 15035987 .
24. ↑ Mark GE, MacIntyre RJ, Digan ME, Ambrosio L., Perrimon N. Drosophila melanogaster homology raf onkogenu   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1987. - Červen ( 7. díl , č. 6. ). - S. 2134-2140 . - doi : 10.1128/mcb.7.6.2134 . — PMID 3037346 .
25. ↑ Chong H., Vikis HG, Guan KL Mechanismy regulace rodiny kináz Raf  //  Buňka . signál. : deník. - 2003. - Květen ( roč. 15 , č. 5 ). - str. 463-469 . - doi : 10.1016/S0898-6568(02)00139-0 . — PMID 12639709 .
26. ↑ Koveal D., Schuh-Nuhfer N., Ritt D., Page R., Morrison DK, Peti W. A CC-SAM, pro spirálově spirálově sterilní α motiv, doména cílí skafold KSR-1 na specifická místa v plazmatická membrána  //  Sci Signal : deník. - 2012. - prosinec ( ročník 5 , č. 255 ). -P ra94 . - doi : 10.1126/scisignal.2003289 . — PMID 23250398 .
27. ↑ Hu J., Yu H., Kornev AP, Zhao J., Filbert EL, Taylor SS, Shaw AS Mutace, která blokuje vazbu ATP, vytváří pseudokinázu stabilizující funkci scaffoldingu supresoru kinázy Ras, CRAF a   BRAF / Proceedings of the Národní akademie věd Spojených států amerických  : časopis. - 2011. - Duben ( roč. 108 , č. 15 ). - S. 6067-6072 . - doi : 10.1073/pnas.1102554108 . - . — PMID 21441104 .
28. ↑ 1 2 3 Brennanová DF, Dar AC, Hertz NT, Chao WC, Burlingame AL, Shokat KM, Barford D. Raf-indukovaný allosterický přechod KSR stimuluje fosforylaci MEK  //  Nature : journal. - 2011. - Duben ( roč. 472 , č. 7343 ). - str. 366-369 . - doi : 10.1038/nature09860 . - . — PMID 21441910 .
29. ↑ Ortner E., Moelling K. Tvorba heteromerního komplexu ASK2 a ASK1 reguluje stresem indukovanou signalizaci   // Biochem . Biophys. Res. komunální. : deník. - 2007. - říjen ( roč. 362 , č. 2 ). - str. 454-459 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2007.08.006 . — PMID 17714688 .
30. ↑ Matallanas D., Birtwistle M., Romano D., Zebisch A., Rauch J., von Kriegsheim A., Kolch W. Rodinné kinázy Raf: staří psi se naučili nové triky  //  Genes Cancer : journal. - 2011. - Sv. 2 , ne. 3 . - S. 232-260 . - doi : 10.1177/1947601911407323 . — PMID 21779496 .
31. ↑ Alexa A., Varga J., Reményi A. Lešení jsou „aktivní“ regulátory signalizačních modulů  // FEBS  J. : deník. - 2010. - Sv. 277 , č.p. 21 . - str. 4376-4382 . - doi : 10.1111/j.1742-4658.2010.07867.x . — PMID 20883493 .
32. ↑ Terai K., Matsuda M. Ras vazba otevírá c-Raf, aby se odhalilo dokovací místo pro mitogenem aktivovanou proteinkinázu kinázy  // EMBO Rep  . : deník. - 2005. - březen ( roč. 6 , č. 3 ). - str. 251-255 . - doi : 10.1038/sj.embor.7400349 . — PMID 15711535 .
33. ↑ Liu D., Bienkowska J., Petosa C., Collier RJ, Fu H., Liddington R. Krystalová struktura zeta izoformy proteinu 14-3-3  //  Nature : journal. - 1995. - Červenec ( roč. 376 , č. 6536 ). - S. 191-194 . - doi : 10.1038/376191a0 . — . — PMID 7603574 .
34. ↑ Fischer A., ​​​​Baljuls A., Reinders J., Nekhoroshkova E., Sibilski C., Metz R., Albert S., Rajalingam K., Hekman M., Rapp UR Regulace aktivity RAF podle 14-3- 3 proteiny: RAF kinázy se funkčně spojují s homo- i heterodimerními formami 14-3-3 proteinů  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. - 2009. - Leden ( roč. 284 , č. 5 ). - str. 3183-3194 . - doi : 10.1074/jbc.M804795200 . — PMID 19049963 .
35. ↑ Rodriguez-Viciana P., Oses-Prieto J., Burlingame A., Fried M., McCormick F. Fosfatázový holoenzym složený z [ sic ] Shoc2/Sur8 a katalytické podjednotky PP1 funguje jako M-Ras efektor pro modulaci Aktivita Raf  (anglicky)  // Mol. buňka : deník. - 2006. - Duben ( roč. 22 , č. 2 ). - S. 217-230 . - doi : 10.1016/j.molcel.2006.03.027 . — PMID 16630891 .
36. ↑ Jaumot M., Hancock JF Proteinové fosfatázy 1 a 2A podporují aktivaci Raf-1 regulací 14-3-3  interakcí //  Onkogen : deník. - 2001. - Červenec ( roč. 20 , č. 30 ). - S. 3949-3958 . - doi : 10.1038/sj.onc.1204526 . — PMID 11494123 .
37. ↑ Tzivion G., Luo Z., Avruch J. Dimerický 14-3-3 protein je nezbytným kofaktorem pro aktivitu Raf kinázy  //  Nature: journal. - 1998. - Červenec ( roč. 394 , č. 6688 ). - S. 88-92 . - doi : 10.1038/27938 . — . — PMID 9665134 .
38. ↑ Molzan M., Ottmann C. Synergická vazba fosforylovaných S233- a S259-vazebných míst C-RAF na jeden 14-3-3ζ dimer  //  J. Mol. Biol. : deník. - 2012. - Listopad ( roč. 423 , č. 4 ). - str. 486-495 . - doi : 10.1016/j.jmb.2012.08.009 . — PMID 22922483 .
39. ↑ McKay MM, Freeman AK, Morrison DK Komplexnost ve funkci KSR odhalená studiemi inhibitoru Raf a strukturou KSR  //  Malé GTPázy: časopis. - 2011. - Sv. 2 , ne. 5 . - str. 276-281 . - doi : 10.4161/sgtp.2.5.17740 . — PMID 22292131 .
40. ↑ Chong H., Guan KL Regulace Raf prostřednictvím fosforylace a interakce N-konec-C-konec  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2003. - září ( roč. 278 , č. 38 ). - S. 36269-36276 . - doi : 10.1074/jbc.M212803200 . — PMID 12865432 .
41. ↑ Shi F., Lemmon MA Biochemistry. KSR hraje CRAF-ty  (anglicky)  // Science. - 2011. - Květen ( roč. 332 , č. 6033 ). - S. 1043-1044 . - doi : 10.1126/science.1208063 . - . — PMID 21617065 .
42. ↑ Ye DZ, Jin S., Zhuo Y., Field J. p21-aktivovaná kináza 1 (Pak1) fosforyluje BAD přímo na serinu 111 in vitro a nepřímo prostřednictvím Raf-1 na serinu 112  // PLoS ONE  :  journal / Bauer, Joseph Alan. - 2011. - Sv. 6 , č. 11 . —P.e27637 . _ - doi : 10.1371/journal.pone.0027637 . - . — PMID 22096607 .
43. ↑ Ding Q., Gros R., Gray ID, Taussig R., Ferguson SS, Feldman RD Raf kinázová aktivace adenylyl cykláz: isoformně selektivní regulace   // Mol . Pharmacol. : deník. - 2004. - říjen ( roč. 66 , č. 4 ). - S. 921-928 . - doi : 10.1124/mol.66.4.921 . — PMID 15385642 .
44. ↑ Broustas CG, Grammatikakis N., Eto M., Dent P., Brautigan DL, Kasid U. Fosforylace myosin-vazebné podjednotky myosin fosfatázy pomocí Raf-1 a inhibice fosfatázové aktivity  //  J. Biol . Chem.  : deník. - 2002. - Leden ( roč. 277 , č. 4 ). - S. 3053-3059 . - doi : 10.1074/jbc.M106343200 . — PMID 11719507 .
45. ↑ Pfleiderer P., Sumandea MP, Rybin VO, Wang C., Steinberg SF Raf-1: nová srdeční troponin T kináza  (neopr.)  // J. Muscle Res. buňka. Motil.. - 2009. - V. 30 , č. 1-2 . - S. 67-72 . - doi : 10.1007/s10974-009-9176-y . — PMID 19381846 .
46. ↑ Hindley A., Kolch W. Extracelulární signálem regulovaná kináza (ERK)/mitogenem aktivovaná proteinkináza (MAPK ) – nezávislé funkce Raf kináz   // Journal of Cell Science : deník. — Společnost biologů, 2002. - Duben ( roč. 115 , č. Pt 8 ). - S. 1575-1581 . — PMID 11950876 .
47. ↑ Catling AD, Schaeffer HJ, Reuter CW, Reddy GR, Weber MJ Sekvence bohatá na prolin jedinečná pro MEK1 a MEK2 je nutná pro vazbu raf a reguluje funkci MEK   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1995. - říjen ( roč. 15 , č. 10 ). - S. 5214-5225 . - doi : 10.1128/mcb.15.10.5214 . — PMID 7565670 .
48. ↑ Pandit B., Sarkozy A., Pennacchio LA, Carta C., Oishi K., Martinelli S., Pogna EA, Schackwitz W., Ustaszewska A., Landstrom A., Bos JM, Ommen SR, Esposito G., Lepri F., Faul C., Mundel P., López Siguero JP, Tenconi R., Selicorni A., Rossi C., Mazzanti L., Torrente I., Marino B., Digilio MC, Zampino G., Ackerman MJ, Dallapiccola B., Tartaglia M., Gelb BD Gain-of-function RAF1 mutace způsobují syndromy Noonan a LEOPARD s hypertrofickou kardiomyopatií   // Nat . Genet.  : deník. - 2007. - srpen ( roč. 39 , č. 8 ). - S. 1007-1012 . - doi : 10.1038/ng2073 . — PMID 17603483 .
49. ↑ Molzan M., Schumacher B., Ottmann C., Baljuls A., Polzien L., Weyand M., Thiel P., Rose R., Rose M., Kuhenne P., Kaiser M., Rapp UR, Kuhlmann J ., Ottmann C. Zhoršená vazba 14-3-3 na C-RAF u Noonanova syndromu naznačuje nové přístupy u onemocnění se zvýšenou signalizací Ras   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2010. - Říjen ( roč. 30 , č. 19 ). - str. 4698-4711 . - doi : 10.1128/MCB.01636-09 . — PMID 20679480 .
50. ↑ Storm SM, Rapp UR Aktivace onkogenu: mutace genu c-raf-1 v experimentálních a přirozeně se vyskytujících nádorech   // Toxikol . Lett. : deník. - 1993. - Duben ( roč. 67 , č. 1-3 ). - S. 201-210 . - doi : 10.1016/0378-4274(93)90056-4 . — PMID 8451761 .
51. ↑ Zebisch A., Staber PB, Delavar A., ​​​​Bodner C., Hiden K., Fischereder K., Janakiraman M., Linkesch W., Auner HW, Emberger W., Windpassinger C., Schimek MG, Hoefler G ., Troppmair J., Sill H. Dvě transformující mutace zárodečné linie C-RAF identifikované u pacientů s akutní myeloidní leukémií související s léčbou  //  Cancer Research : deník. — Americká asociace pro výzkum rakoviny, 2006. - Duben ( roč. 66 , č. 7 ). - S. 3401-3408 . - doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-0115 . — PMID 16585161 .
52. ↑ Emuss V., Garnett M., Mason C., Marais R. Mutace C-RAF jsou u lidské rakoviny vzácné, protože C-RAF má nízkou bazální kinázovou aktivitu ve srovnání s B-RAF  //  Cancer Research : deník. — Americká asociace pro výzkum rakoviny, 2005. — Listopad ( roč. 65 , č. 21 ). - S. 9719-9726 . - doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-1683 . — PMID 16266992 .
53. ↑ Forbes SA, Bindal N., Bamford S., Cole C., Kok CY, Beare D., Jia M., Shepherd R., Leung K., Menzies A., Teague JW, Campbell PJ, Stratton MR, Futreal PA COSMIC: těžba kompletních rakovinných genomů v Katalogu somatických mutací u rakoviny  // Nucleic Acids Res  . : deník. - 2011. - Leden ( roč. 39 , č. Vydání databáze ). - P.D945-50 . doi : 10.1093 / nar/gkq929 . — PMID 20952405 .
54. ↑ Capper D., Berghoff AS, Magerle M., Ilhan A., Wöhrer A., ​​​​Hackl M., Pichler J., Pusch S., Meyer J., Habel A., Petzelbauer P., Birner P., von Deimling A., Preusser M. Imunohistochemické testování stavu BRAF V600E v 1 120 vzorcích nádorové tkáně pacientů s mozkovými metastázami  // Acta Neuropathol  . : deník. - 2012. - Sv. 123 , č. 2 . - str. 223-233 . - doi : 10.1007/s00401-011-0887-y . — PMID 22012135 .
55. ↑ Capper D., Preusser M., Habel A., Sahm F., Ackermann U., Schindler G., Pusch S., Mechtersheimer G., Zentgraf H., von Deimling A. Hodnocení stavu mutace BRAF V600E imunohistochemicky s mutační specifická monoklonální protilátka  (anglicky)  // Acta Neuropathol. : deník. - 2011. - Sv. 122 , č. 1 . - str. 11-9 . - doi : 10.1007/s00401-011-0841-z . — PMID 21638088 .
56. ↑ Tran NH, Wu X., Frost JA B-Raf a Raf-1 jsou regulovány odlišnými autoregulačními mechanismy  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2005. - Duben ( roč. 280 , č. 16 ). - S. 16244-16253 . - doi : 10.1074/jbc.M501185200 . — PMID 15710605 .
57. ↑ Garnett MJ, Rana S., Paterson H., Barford D., Marais R. Divoký typ a mutantní B-RAF aktivují C-RAF prostřednictvím odlišných mechanismů zahrnujících heterodimerizaci   // Mol . buňka : deník. - 2005. - prosinec ( roč. 20 , č. 6 ). - str. 963-969 . - doi : 10.1016/j.molcel.2005.10.022 . — PMID 16364920 .
58. ↑ Maurer G., Tarkowski B., Baccarini M. Raf kinázy v rolích rakoviny a terapeutických  příležitostech //  Onkogen : deník. - 2011. - Srpen ( roč. 30 , č. 32 ). - str. 3477-3488 . - doi : 10.1038/onc.2011.160 . — PMID 21577205 .
59. ↑ Kim DH, Sim T. Nové malomolekulární inhibitory kinázy Raf pro cílená protinádorová léčiva   // Arch . Pharm. Res. : deník. - 2012. - březen ( roč. 35 , č. 4 ). - S. 605-615 . - doi : 10.1007/s12272-012-0403-5 . — PMID 22553052 .
60. ↑ Zimmermann S., Moelling K. Fosforylace a regulace Raf pomocí Akt (proteinkináza B  )  // Science : journal. - 1999. - Listopad ( roč. 286 , č. 5445 ). - S. 1741-1744 . - doi : 10.1126/science.286.5445.1741 . — PMID 10576742 .
61. ↑ Chen J., Fujii K., Zhang L., Roberts T., Fu H. Raf-1 podporuje přežití buněk tím, že antagonizuje kinázu 1 regulující signál apoptózy prostřednictvím nezávislého mechanismu MEK-ERK  //  Proceedings of the National Academy of Sciences Spojených států amerických  : časopis. - 2001. - Červenec ( roč. 98 , č. 14 ). - str. 7783-7788 . - doi : 10.1073/pnas.141224398 . - . — PMID 11427728 .
62. ↑ Wang HG, Takayama S., Rapp UR, Reed JC Bcl-2 interagující protein, BAG-1, se váže a aktivuje kinázu Raf-1  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1996. - Červenec ( roč. 93 , č. 14 ). - str. 7063-7068 . - doi : 10.1073/pnas.93.14.7063 . - . — PMID 8692945 .
63. ↑ Weber CK, Slupsky JR, Kalmes HA, Rapp UR Aktivní Ras indukuje heterodimerizaci cRaf a BRaf  // Výzkum  rakoviny : deník. — Americká asociace pro výzkum rakoviny, 2001. - Květen ( roč. 61 , č. 9 ). - str. 3595-3598 . — PMID 11325826 .
64. ↑ Wang HG, Rapp UR, Reed JC Bcl-2 se zaměřuje na proteinkinázu Raf-1 do mitochondrií  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1996. - Listopad ( roč. 87 , č. 4 ). - S. 629-638 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)81383-5 . — PMID 8929532 .
65. ↑ Galaktionov K., Jessus C., Beach D. Interakce Raf1 s fosfatázou Cdc25 váže transdukci mitogenního signálu na aktivaci buněčného cyklu  // Genes Dev  .  : deník. - 1995. - Květen ( roč. 9 , č. 9 ). - S. 1046-1058 . - doi : 10.1101/gad.9.9.1046 . — PMID 7744247 .
66. ↑ Huang TS, Shu CH, Yang WK, Whang-Peng J. Aktivace fosfatázy CDC 25 a kinázy CDC 2 zapojené do apoptózy indukované GL331  //  Cancer Research : deník. — Americká asociace pro výzkum rakoviny, 1997. — Červenec ( roč. 57 , č. 14 ). - S. 2974-2978 . — PMID 9230211 .
67. ↑ Kataoka T., Budd RC, Holler N., Thome M., Martinon F., Irmler M., Burns K., Hahne M., Kennedy N., Kovacsovics M., Tschopp J. Inhibitor kaspázy-8 FLIP podporuje aktivace signálních drah NF-kappaB a Erk  (anglicky)  // Curr. Biol.  : deník. - 2000. - Červen ( roč. 10 , č. 11 ). - S. 640-648 . - doi : 10.1016/s0960-9822(00)00512-1 . — PMID 10837247 .
68. ↑ 1 2 Cleghon V., Morrison DK Raf-1 interaguje s Fyn a Src způsobem, který není závislý na fosfotyrosinu  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1994. - Červenec ( roč. 269 , č. 26 ). - S. 17749-17755 . — PMID 7517401 .
69. ↑ Nantel A., Huber M., Thomas DY Lokalizace endogenního Grb10 do mitochondrií a jeho interakce s mitochondriálně asociovaným Raf-1 poolem  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1999. - prosinec ( roč. 274 , č. 50 ). - S. 35719-35724 . doi : 10.1074 / jbc.274.50.35719 . — PMID 10585452 .
70. ↑ Nantel A., Mohammad-Ali K., Sherk J., Posner BI, Thomas DY Interakce adaptorového proteinu Grb10 s kinázami Raf1 a MEK1  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1998. - Duben ( roč. 273 , č. 17 ). - S. 10475-10484 . doi : 10.1074/ jbc.273.17.10475 . — PMID 9553107 .
71. ↑ Stang S., Bottorff D., Stone JC Interakce aktivovaného Ras se samotným Raf-1 může být dostatečná pro transformaci buněk rat2   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1997. - Červen ( roč. 17 , č. 6 ). - S. 3047-3055 . - doi : 10.1128/MCB.17.6.3047 . — PMID 9154803 .
72. ↑ Germani A., Prabel A., Mourah S., Podgorniak MP, Di Carlo A., Ehrlich R., Gisselbrecht S., Varin-Blank N., Calvo F., Bruzzoni-Giovanelli H. SIAH-1 interaguje s CtIP a podporuje jeho degradaci proteazomovou  dráhou //  onkogen : deník. - 2003. - prosinec ( roč. 22 , č. 55 ). - S. 8845-8851 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206994 . — PMID 14654780 .
73. ↑ Mitin NY, Ramocki MB, Zullo AJ, Der CJ, Konieczny SF, Taparowsky EJ Identifikace a charakterizace deště, nového proteinu interagujícího s Ras s jedinečnou subcelulární lokalizací  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2004. - Květen ( roč. 279 , č. 21 ). - S. 22353-22361 . - doi : 10.1074/jbc.M312867200 . — PMID 15031288 .
74. ↑ Vargiu P., De Abajo R., Garcia-Ranea JA, Valencia A., Santisteban P., Crespo P., Bernal J. Malý protein vázající GTP, Rhes, reguluje přenos signálu z receptorů spřažených s G proteinem  .)  // Onkogen : deník. - 2004. - Leden ( roč. 23 , č. 2 ). - str. 559-568 . - doi : 10.1038/sj.onc.1207161 . — PMID 14724584 .
75. ↑ 1 2 Yuryev A., Wennogle LP Nové interakce protein-protein raf kinázy nalezené vyčerpávající analýzou dvou hybridů kvasinek  // Genomics  :  journal. - 2003. - únor ( roč. 81 , č. 2 ). - S. 112-125 . - doi : 10.1016/s0888-7543(02)00008-3 . — PMID 12620389 .
76. ↑ 1 2 3 4 Li W., Han M., Guan KL Na leucin bohatý opakující se protein SUR-8 zvyšuje aktivaci MAP kinázy a tvoří komplex s Ras a Raf  // Genes Dev  .  : deník. - 2000. - Duben ( roč. 14 , č. 8 ). - S. 895-900 . — PMID 10783161 .
77. ↑ 1 2 Kiyono M., Kato J., Kataoka T., Kaziro Y., Satoh T. Stimulace Ras guanin nukleotidové výměnné aktivity Ras-GRF1/CDC25 ( Mm) po fosforylaci tyrosinu pomocí Cdc42-regulované kinázy ACK1   // J. Biol. Chem.  : deník. - 2000. - září ( roč. 275 , č. 38 ). - S. 29788-29793 . - doi : 10.1074/jbc.M001378200 . — PMID 10882715 .
78. ↑ Janoueix-Lerosey I., Pasheva E., de Tand MF, Tavitian A., de Gunzburg J. Identifikace specifického efektoru malého proteinu vázajícího GTP Rap2  // Eur  . J Biochem. : deník. - 1998. - březen ( roč. 252 , č. 2 ). - str. 290-298 . - doi : 10.1046/j.1432-1327.1998.2520290.x . — PMID 9523700 .
79. ↑ Boettner B., Govek EE, Cross J., Van Aelst L. Junkční multidoménový protein AF-6 je vazebným partnerem Rap1A GTPázy a asociuje se s aktinovým cytoskeletálním regulátorem profilinem   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the Spojené státy americké  : časopis. - 2000. - srpen ( roč. 97 , č. 16 ). - S. 9064-9069 . - doi : 10.1073/pnas.97.16.9064 . - . — PMID 10922060 .
80. ↑ Karbownicek M., Robertson GP, ​​​​Henske EP Rheb inhibuje aktivitu C-raf a heterodimerizaci B-raf/C-raf   // J. Biol. Chem.  : deník. - 2006. - září ( roč. 281 , č. 35 ). - S. 25447-25456 . - doi : 10.1074/jbc.M605273200 . — PMID 16803888 .
81. ↑ 1 2 Han L., Colicelli J. Lidský protein vybraný pro interferenci s funkcí Ras interaguje přímo s Ras a soutěží s Raf1   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1995. - březen ( roč. 15 , č. 3 ). - S. 1318-1323 . - doi : 10.1128/mcb.15.3.1318 . — PMID 7862125 .
82. ↑ Jelinek T., Catling AD, Reuter CW, Moodie SA, Wolfman A., Weber MJ RAS a RAF-1 tvoří signální komplex s MEK-1, ale ne s MEK-2   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1994. - prosinec ( roč. 14 , č. 12 ). - S. 8212-8218 . - doi : 10.1128/mcb.14.12.8212 . — PMID 7969158 .
83. ↑ Romero F., Martínez-A C., Camonis J., Rebollo A. Transkripční faktor Aiolos řídí buněčnou smrt v T buňkách regulací exprese Bcl-2 a jeho buněčné lokalizace  // EMBO  J. : deník. - 1999. - Červen ( roč. 18 , č. 12 ). - S. 3419-3430 . - doi : 10.1093/emboj/18.12.3419 . — PMID 10369681 .
84. ↑ Morcos P., Thapar N., Tusneem N., Stacey D., Tamanoi F. Identifikace mutantů neurofibrominu, které vykazují alelovou specifitu nebo zvýšenou Ras afinitu vedoucí k supresi aktivovaných alel ras   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1996. - Květen ( roč. 16 , č. 5 ). - S. 2496-2503 . - doi : 10.1128/mcb.16.5.2496 . — PMID 8628317 .
85. ↑ Hu CD, Kariya K., Tamada M., Akasaka K., Shirouzu M., Yokoyama S., Kataoka T. Oblast Raf-1 bohatá na cystein interaguje s doménou aktivátoru posttranslačně modifikovaného Ha-Ras  )  // J. Biol. Chem.  : deník. - 1995. - prosinec ( roč. 270 , č. 51 ). - S. 30274-30277 . doi : 10.1074/ jbc.270.51.30274 . — PMID 8530446 .
86. ↑ Rodriguez-Viciana P., Warne PH, Khwaja A., Marte BM, Pappin D., Das P., Waterfield MD, Ridley A., Downward J. Role fosfoinositid 3-OH kinázy v buněčné transformaci a kontrole aktinu cytoskeleton od Ras  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1997. - Květen ( roč. 89 , č. 3 ). - str. 457-467 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80226-3 . — PMID 9150145 .
87. ↑ Huang YZ, Zang M., Xiong WC, Luo Z., Mei L. Erbin potlačuje MAP kinázovou dráhu  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2003. - Leden ( roč. 278 , č. 2 ). - S. 1108-1114 . - doi : 10.1074/jbc.M205413200 . — PMID 12379659 .
88. ↑ 1 2 Dogan T., Harms GS, Hekman M., Karreman C., Oberoi TK, Alnemri ES, Rapp UR, Rajalingam K. X-vázané a buněčné IAP modulují stabilitu C-RAF kinázy a buněčnou  motilitu )  // Nat. Buněčný biol.  : deník. - 2008. - prosinec ( roč. 10 , č. 12 ). - S. 1447-1455 . - doi : 10.1038/ncb1804 . — PMID 19011619 .
89. ↑ Stancato LF, Chow YH, Hutchison KA, Perdew GH, Jove R., Pratt WB Raf existuje v nativním heterokomplexu s hsp90 a p50, který lze rekonstituovat v bezbuněčném systému  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1993. - říjen ( roč. 268 , č. 29 ). - S. 21711-21716 . — PMID 8408024 .
90. ↑ 1 2 3 Yeung K., Janosch P., McFerran B., Rose DW, Mischak H., Šedivý JM, Kolch W. Mechanismus suprese Raf/MEK/extracelulární signálem regulované kinázové dráhy proteinem inhibitoru raf kinázy  (anglicky)  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2000. - Květen ( roč. 20 , č. 9 ). - str. 3079-3085 . - doi : 10.1128/mcb.20.9.3079-3085.2000 . — PMID 10757792 .
91. ↑ Karandikar M., Xu S., Cobb MH MEKK1 váže raf-1 a komponenty kaskády ERK2  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2000. - prosinec ( roč. 275 , č. 51 ). - S. 40120-40127 . - doi : 10.1074/jbc.M005926200 . — PMID 10969079 .
92. ↑ English JM, Pearson G., Hockenberry T., Shivakumar L., White MA, Cobb MH Příspěvek cesty ERK5/MEK5 k signalizaci a kontrole růstu Ras/Raf  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1999. - říjen ( roč. 274 , č. 44 ). - S. 31588-31592 . doi : 10.1074 / jbc.274.44.31588 . — PMID 10531364 .
93. ↑ Kuboki Y., Ito M., Takamatsu N., Yamamoto KI, Shiba T., Yoshioka K. Scaffold protein v c-Jun NH2-terminálních kinázových signálních drahách potlačuje extracelulární signálem regulované kinázové signální  dráhy  // J. Biol. Chem.  : deník. - 2000. - prosinec ( roč. 275 , č. 51 ). - S. 39815-39818 . - doi : 10.1074/jbc.C000403200 . — PMID 11044439 .
94. ↑ Ito M., Yoshioka K., Akechi M., Yamashita S., Takamatsu N., Sugiyama K., Hibi M., Nakabeppu Y., Shiba T., Yamamoto KI JSAP1, nová jun N-terminální proteinkináza ( JNK)-vazebný protein, který funguje jako skafoldový faktor v JNK signální dráze   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1999. - Listopad ( roč. 19 , č. 11 ). - str. 7539-7548 . - doi : 10.1128/mcb.19.11.7539 . — PMID 10523642 .
95. ↑ Zang M., Hayne C., Luo Z. Interakce mezi aktivním Pak1 a Raf-1 je nezbytná pro fosforylaci a aktivaci Raf-1  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2002. - únor ( roč. 277 , č. 6 ). - S. 4395-4405 . - doi : 10.1074/jbc.M110000200 . — PMID 11733498 .
96. ↑ 1 2 Wang S., Nath N., Fusaro G., Chellappan S. Rb a prohibitin cílí na odlišné oblasti E2F1 pro represi a reagují na různé upstream signály   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1999. - Listopad ( roč. 19 , č. 11 ). - str. 7447-7460 . - doi : 10.1128/mcb.19.11.7447 . — PMID 10523633 .
97. ↑ 1 2 3 4 5 6 Van Der Hoeven PC, Van Der Wal JC, Ruurs P., Van Dijk MC, Van Blitterswijk J. Izotypy 14-3-3 usnadňují spojení proteinkinázy C-zeta s Raf-1: negativní regulace fosforylací 14-3-3  (anglicky)  // Biochem. J. : deník. - 2000. - leden ( roč. 345 , č. 2 ). - str. 297-306 . - doi : 10.1042/0264-6021:3450297 . — PMID 10620507 .
98. ↑ Hu CD, Kariya K., Okada T., Qi X., Song C., Kataoka T. Vliv fosforylace na aktivity Rap1A při interakci s Raf-1 a potlačení aktivace Raf-1 závislé na Ras   // J. Biol. Chem.  : deník. - 1999. - Leden ( roč. 274 , č. 1 ). - str. 48-51 . doi : 10.1074 / jbc.274.1.48 . — PMID 9867809 .
99. ↑ Okada T., Hu CD, Jin TG, Kariya K., Yamawaki-Kataoka Y., Kataoka T. Síla interakce v doméně bohaté na cystein Raf je kritickým determinantem odpovědi Raf na malé  GTPázy rodiny Ras.)  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 1999. - září ( roč. 19 , č. 9 ). - S. 6057-6064 . - doi : 10.1128/mcb.19.9.6057 . — PMID 10454553 .
100. ↑ Long X., Lin Y., Ortiz-Vega S., Yonezawa K., Avruch J. Rheb váže a reguluje kinázu mTOR   // Curr . Biol.  : deník. - 2005. - Duben ( roč. 15 , č. 8 ). - str. 702-713 . - doi : 10.1016/j.cub.2005.02.053 . — PMID 15854902 .
101. ↑ Karbowniczek M., Cash T., Cheung M., Robertson GP, ​​​​Astrinidis A., Henske EP Regulace aktivity B-Raf kinázy tuberinem a Rheb je savčí cíl nezávislý na rapamycinu (mTOR)  (anglicky)  // J Biol. Chem.  : deník. - 2004. - Červenec ( roč. 279 , č. 29 ). - S. 29930-29937 . - doi : 10.1074/jbc.M402591200 . — PMID 15150271 .
102. ↑ Yee WM, Worley PF Rheb interaguje s Raf-1 kinázou a může fungovat při integraci signálů závislých na růstovém faktoru a protein kináze A   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1997. - únor ( roč. 17 , č. 2 ). - S. 921-933 . - doi : 10.1128/mcb.17.2.921 . — PMID 9001246 .
103. ↑ Movilla N., Crespo P., Bustelo XR Signální transdukční elementy TC21, onkogenní člen podrodiny R-Ras proteinů vázajících GTP  //  Onkogen : deník. - 1999. - říjen ( roč. 18 , č. 43 ). - S. 5860-5869 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202968 . — PMID 10557073 .
104. ↑ 1 2 Wang S., Ghosh RN, Chellappan SP Raf-1 fyzicky interaguje s Rb a narušuje jeho funkci: spojení mezi mitogenní signalizací a regulací buněčného cyklu   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 1998. - prosinec ( roč. 18 , č. 12 ). - str. 7487-7498 . - doi : 10.1128/mcb.18.12.7487 . — PMID 9819434 .
105. ↑ Ayroldi E., Zollo O., Macchiarulo A., Di Marco B., Marchetti C., Riccardi C. Glukokortikoidy indukovaný leucinový zipper inhibuje Raf-extracelulární signálem regulovanou kinázovou dráhu vazbou na Raf-  1  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2002. - Listopad ( roč. 22 , č. 22 ). - str. 7929-7941 . - doi : 10.1128/mcb.22.22.7929-7941.2002 . — PMID 12391160 .
106. ↑ Truong AB, Masters SC, Yang H., Fu H. Role 14-3-3 C-terminální smyčky v interakci ligandů  //  Proteiny: časopis. - 2002. - Listopad ( roč. 49 , č. 3 ). - str. 321-325 . - doi : 10.1002/prot.10210 . — PMID 12360521 .
107. ↑ Yuryev A., Ono M., Goff SA, Macaluso F., Wennogle LP Izoformně specifická lokalizace A-RAF v mitochondriích   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2000. - Červenec ( roč. 20 , č. 13 ). - str. 4870-4878 . - doi : 10.1128/mcb.20.13.4870-4878.2000 . — PMID 10848612 .
108. ↑ 1 2 3 Vincenz C., Dixit VM 14-3-3 proteiny se asociují s A20 izoformně specifickým způsobem a fungují jako chaperonové i adaptorové molekuly  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1996. - srpen ( roč. 271 , č. 33 ). - S. 20029-20034 . doi : 10.1074 / jbc.271.33.20029 . — PMID 8702721 .
109. ↑ 1 2 Conklin DS, Galaktionov K., Beach D. 14-3-3 proteiny asociované s fosfatázami cdc25  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1995. - Srpen ( roč. 92 , č. 17 ). - str. 7892-7896 . - doi : 10.1073/pnas.92.17.7892 . - . — PMID 7644510 .
110. ↑ 1 2 Ewing RM, Chu P., Elisma F., Li H., Taylor P., Climie S., McBroom-Cerajewski L., Robinson MD, O'Connor L., Li M., Taylor R., Dharsee M., Ho Y., Heilbut A., Moore L., Zhang S., Ornatsky O., Bukhman YV, Ethier M., Sheng Y., Vasilescu J., Abu-Farha M., Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B., Hogue K., Colwill K., Gladwish K., Muskat B., Kinach R., Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T., Figeys D. Large-scale mapping of human protein -proteinové interakce hmotnostní spektrometrií   // Mol . Syst. Biol. : deník. - 2007. - Sv. 3 , ne. 1 . — S. 89 . - doi : 10.1038/msb4100134 . — PMID 17353931 .
111. ↑ Autieri MV, Carbone CJ 14-3-3Gamma interaguje a je fosforylován mnoha izoformami proteinkinázy C v PDGF-stimulovaných lidských buňkách vaskulárního hladkého svalstva  // DNA Cell Biol  . : deník. - 1999. - Červenec ( roč. 18 , č. 7 ). - S. 555-564 . - doi : 10.1089/104454999315105 . — PMID 10433554 .
112. ↑ Ichimura T., Wakamiya-Tsuruta A., Itagaki C., Taoka M., Hayano T., Natsume T., Isobe T. Interakce lehkého řetězce kinesinu 2 a proteinu 14-3-3  závislá na fosforylaci)  // Biochemie: časopis. - 2002. - Duben ( roč. 41 , č. 17 ). - S. 5566-5572 . - doi : 10.1021/bi015946f . — PMID 11969417 .
113. ↑ Liu YC, Elly C., Yoshida H., Bonnefoy-Berard N., Altman A. Aktivací modulovaná asociace 14-3-3 proteinů s Cbl v T buňkách  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1996. - Červen ( roč. 271 , č. 24 ). - S. 14591-14595 . doi : 10.1074 / jbc.271.24.14591 . — PMID 8663231 .
114. ↑ Clark GJ, Drugan JK, Rossman KL, Carpenter JW, Rogers-Graham K., Fu H., Der CJ, Campbell SL 14-3-3 zeta negativně reguluje aktivitu raf-1 interakcemi s Raf-1 bohatým na cystein doména  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. - 1997. - srpen ( roč. 272 , č. 34 ). - S. 20990-20993 . doi : 10.1074 / jbc.272.34.20990 . — PMID 9261098 .
115. ↑ Tzivion G., Luo ZJ, Avruch J. Calyculinem A-indukovaná fosforylace vimentinu sekvestruje 14-3-3 a vytěsňuje jiné 14-3-3 partnery in vivo  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2000. - září ( roč. 275 , č. 38 ). - S. 29772-29778 . - doi : 10.1074/jbc.M001207200 . — PMID 10887173 .
116. ↑ Koyama S., Williams LT, Kikuchi A. Charakterizace interakce Raf-1 s proteinem ras p21 nebo 14-3-3 v intaktních buňkách  // FEBS Lett  . : deník. - 1995. - Červenec ( roč. 368 , č. 2 ). - str. 321-325 . - doi : 10.1016/0014-5793(95)00686-4 . — PMID 7628630 .
117. ↑ Chow CW, Davis RJ Integrace vápníkových a cyklických signálních drah AMP pomocí 14-3-3   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2000. - leden ( roč. 20 , č. 2 ). - str. 702-712 . - doi : 10.1128/MCB.20.2.702-712.2000 . — PMID 10611249 .

Odkazy

• Mitogenem aktivované proteinkinázové kaskády a zapojení Ste20-like proteinkináz v nich. E. S. Potekhina, E. S. Naděždina. Pokroky v biologické chemii, vol. 42, 2002, str. 235-223556.