Pikornaviry

pikornaviry
Virus dětské obrny
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:PisuviricotaTřída:PisoniviricetesObjednat:PicornaviralesRodina:pikornaviry
Mezinárodní vědecký název
Picornaviridae
porod
viz text
Baltimorská skupina
IV: (+)ssRNA viry
Systematika na Wikispecies Obrázky na Wikimedia Commons NCBI   12058 EOL   8043

Picornaviridae [2] ( lat.  Picornaviridae , od pico  - small a rna  - RNA ) je čeleď, která sdružuje malé ikosaedrické viry vyšších obratlovců obsahující jednovláknovou genomickou RNA pozitivní polarity (tj. stejné polarity jako mRNA ). Velikost kapsidy je asi 27-30 nm , velikost genomu je asi 7-8 tisíc bází. K reprodukci pikornavirů dochází v cytoplazmě infikované buňky. Pikornaviry zahrnují původce takových onemocnění, jako je poliomyelitida , rýma , slintavka a kulhavka , hepatitida A atd. Ve světě virů se pikornaviry vyznačují velmi vysokou mírou mutací, což vede k vysoké pravděpodobnosti škodlivosti jejich variant pro člověka. [3] .

Struktura genomu

Genomová RNA pikornavirů obsahuje ve většině případů jeden otevřený čtecí rámec pod kontrolou IRES  , vnitřního vstupního místa ribozomu . Translace virové RNA vede k vytvoření obřího prekurzorového proteinu, který je ještě před dokončením syntézy štěpen virovými proteázami za vzniku zralých virových proteinů. Na 5' konec virové RNA - VPg (z anglického viral protein genome linked , viral protein spojený s genomem) je kovalentně připojen malý protein. 3' konec je polyadenylovaný (obsahuje několik desítek adeninových zbytků , podobně jako buněčné mRNA). Na 5'- a 3'-koncích virové RNA jsou tzv. cis - replikační elementy (OriL, resp. OriR - z anglického původu  - "začátek", levý  - "levý", pravý  - "pravý" ) - sekvence nezbytné pro replikaci genomu.   

Proteiny pikornavirů

Genom pikornaviru kóduje asi tucet proteinů , které zajišťují replikaci virové RNA, přeprogramování buněk a sestavení zralých virionů . Kódující oblast genomu je spíše podmíněně rozdělena do tří sekcí: P1  - kóduje strukturální proteiny VP1, VP2, VP3, VP4, ze kterých je postavena virová částice. P2 a P3  - kódují proteiny nezbytné pro přeprogramování a replikaci buněk:

• 2A - nehomologní u zástupců různých rodů pikornavirů. Například u afto- a kardiovirů je to peptid , který způsobuje kotranslační zlom v syntetizovaném proteinovém řetězci polyproteinu, u entero- a rinovirů je to serinová proteáza .
• 2B a 3A jsou malé hydrofobní proteiny podílející se na změně buněčných membrán způsobených pikornaviry.
• 2C - tento protein má homologii s helikázami , je součástí replikačního komplexu pikornaviru.
• 3B je VPg, protein, který se váže na 5' konec virové RNA.
• 3C – cysteinová proteáza , která štěpí polyprotein [4] .
• 3D - RNA polymeráza, protein, který syntetizuje virovou RNA.
• L - vedoucí protein je také nehomologní u zástupců různých rodů, chybí u řady pikornavirů. U aftovirů je to proteáza, která se štěpí z polyproteinu, u kardiovirů a Teschoviru postrádá enzymatickou aktivitu.

Klasifikace

Podle Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) k březnu 2017 rodina zahrnuje 35 rodů [5] :

• Ampivirus (1 druh)
• Aftovirus - aftoviry (4 druhy)
• Aquamavirus (1 druh)
• Avihepatovirus (1 druh)
• Avisivirus (3 druhy)
• Kardiovirus - Kardioviry [6] (3 druhy)
• Cosavirus (5 druhů)
• Dicipivirus (1 druh)
• Enterovirus - Enteroviry (13 druhů)
• Erbovirus (1 druh)
• Gallivirus (1 druh)
• Harkavirus (1 druh)
• Hepatovirus — Hepatoviry [7] (9 druhů)
• Hunnivirus (1 druh)
• Kobuvirus (6 druhů)
• Kunsagivirus (1 druh)
• Limnipivirus (3 druhy)
• Megrivirus (1 druh)
• Mischivirus (3 druhy)
• Mosavirus (1 druh)
• Oscivirus (1 druh)
• Parechoviry - Parechoviry (4 druhy)
• Pasivirus (1 druh)
• Passerivirus (1 druh)
• Potamipivirus (1 druh)
• Rabovirus (1 druh)
• Rosavirus (1 druh)
• Sakobuvirus (1 druh)
• Salivirus (1 druh)
• Sapelovirus (3 druhy)
• Senecavirus (1 druh)
• Sicinivirus (1 druh)
• Teschovirus (1 druh)
• Torchivirus (1 druh)
• Tremovirus (2 druhy)

Viz také

• Virus ptačí encefalomyelitidy

Poznámky

1. ↑ Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
2. ↑ Atlas lékařské mikrobiologie, virologie a imunologie: Učebnice pro studenty medicíny / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M .  : Lékařská informační agentura, 2003. - S. 117. - ISBN 5-89481-136-8 .
3. ↑ S. Dmitrijev. Virus je hacker, který rozbije buněčný program // Science and Life . - 2022. - č. 5 . - S. 8 .
4. ↑ Malcolm BA Pikornavirové 3C proteinázy: cysteinové nukleofily v záhybech serinových proteináz. : [ anglicky ] ] // Protein Sci. - 1995. - Sv. 4, č. 8 (srpen). - S. 1439-1445.
5. ↑ Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) . (Přístup: 23. března 2017) .
6. ↑ Sergejev, Nepoklonov, Aliper, 2007 , str. 461.
7. ↑ Sergejev, Nepoklonov, Aliper, 2007 , str. 448.

Literatura

• Sergeev V. A. , Nepoklonov E. A. , Aliper T. I. 10.23 Pikornaviry // Viry a virové vakcíny. - M  .: Biblionics, 2007. - S. 448-462. — ISBN 5-98685-012-2 .
• Semler BL a Wimmer E. 2002. Molekulární biologie pikornavirů. Americká společnost pro mikrobiologii, Washington, DC

Slovníky a encyklopedie	Velká dánština Velká Katalánština Britannica (online)
Taxonomie	EOL GBIF iPřírodovědec NCBI IRMNG WoRMS
V bibliografických katalozích	NKC : ph254777