Alkalická fosfatáza, placentární
Alkalická fosfatáza, placentární
|
---|
|
|
|
Symboly
| ALPP , ALP, PALP, PLAP, PLAP-1, alkalická fosfatáza, placentární, ALPI, IAP |
---|
Externí ID |
OMIM: 171800 MGI: 1924018 HomoloGene: 122414 GeneCards: 250
|
---|
|
|
Více informací
|
Druhy |
Člověk |
Myš |
---|
Entrez |
|
|
---|
Soubor |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (mRNA) |
| |
---|
RefSeq (protein) |
| |
---|
Locus (UCSC) |
Chr 2: 232,38 – 232,38 Mb
| Chr 1: 87,03 – 87,03 Mb
|
---|
Vyhledávání PubMed |
[jeden]
| [2] |
---|
Upravit (člověk) | Upravit (myš) |
Alkalická fosfatáza, placentárního typu , také známá jako placentární alkalická fosfatáza ( PLAP ), je alosterický enzym kódovaný u lidí genem ALPP [1] [2] [3] umístěným u lidí na krátkém raménku chromozomu 2 [4] . Délka proteinového polypeptidového řetězce je 535 aminokyselin a molekulová hmotnost je 57 954 [5] .
Protein kódovaný genomem je klasifikován podle funkce jako hydroláza . Podílí se na takovém biologickém procesu, jako je polymorfismus. Protein má vazebné místo pro ionty kovů, ionty zinku , ionty hořčíku . Lokalizováno v buněčné membráně .
Gene
Existují alespoň čtyři odlišné, ale příbuzné alkalické fosfatázy: střevní ( ALPI ), placentární (tento enzym), placentárnímu typu ( ALPPL2 ) a tkáňově nespecifické (játra/kost/ledviny) ( ALPL ). První tři jsou umístěny společně na chromozomu 2, zatímco tkáňově specifická forma je umístěna na chromozomu 1. Kódující sekvence pro tuto formu alkalické fosfatázy je jedinečná v tom, že 3' nepřeložená oblast obsahuje více kopií repetice rodiny Alu. Tento gen je navíc polymorfní a tři běžné alely (typ 1, typ 2 a typ 3) pro tuto formu alkalické fosfatázy jsou dobře charakterizovány [3] .
Funkce
Alkalická fosfatáza placentárního typu je na membráně vázaný glykosylovaný dimerní enzym, nazývaný také tepelně rezistentní forma, která je exprimována primárně v placentě, i když je blízce příbuzná střevní i placentární formě [3] .
Klinický význam
PLAP je nádorový marker, zejména u seminomu [6] [7] [8] a rakoviny vaječníků , jako je dysgerminom [9 ] . PLAP je významný pouze u nekuřáků, protože kouření interferuje s měřením PLAP [10], protože koncentrace PLAP v séru se u kuřáků zvyšuje až 10krát, a proto má jeho měření v této skupině malou hodnotu [11] .
Viz také
Poznámky
- ↑ „Klonování, sekvenování a chromozomální lokalizace cDNA placentární alkalické fosfatázy lidského termínu“. Proč Natl Acad Sci USA . 82 (24): 8715-9. února 1986. doi : 10.1073/ pnas.82.24.8715 . PMID 3001717 .
- ↑ „Produkty dvou společných alel v lokusu pro lidskou placentární alkalickou fosfatázu se liší sedmi aminokyselinami“. Proč Natl Acad Sci USA . 83 (15): 5597-601. září 1986. doi : 10.1073/pnas.83.15.5597 . PMID 3461452 .
- ↑ 1 2 3 Entrez Gen: ALPP alkalická fosfatáza, placentární (Regan isozym) . (neurčitý)
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC: 439 ? . Staženo: 28. srpna 2017. (neurčitý)
- ↑ UniProt , P05187 . Staženo: 28. srpna 2017. (neurčitý)
- ↑ Evropská skupina pro nádorové markery. Evropská expertní skupina pro nádorové markery. rakovina zárodečných buněk. . Archivováno z originálu 26. dubna 2012. (neurčitý)
- ↑ W. Albrecht (2004). „Nádorové markery varlat: Základní kameny v léčbě maligních nádorů ze zárodečných buněk“ (PDF) . J Lab Med . 28 (2): 109-115. DOI : 10.1515/labmed.2004.018 .
- ↑ Sturgeon C (srpen 2002). "Praktické pokyny pro použití nádorových markerů na klinice." Clin. Chem . 48 (8): 1151-9. DOI : 10.1093/clinchem/48.8.1151 . PMID 12142367 .
- ↑ Fishman W. H. (prosinec 1987). "Klinický a biologický význam izozymového nádorového markeru - PLAP." Clin. Biochem . 20 (6): 387-92. DOI : 10.1016/0009-9120(87)90003-8 . PMID 3325192 .
- ↑ „Evropský konsensus o diagnostice a léčbě rakoviny zárodečných buněk: zpráva Evropské skupiny pro konsensus pro rakovinu zárodečných buněk (EGCCCG)“. Annals of Oncology . 15 (9): 1377-99. září 2004. doi : 10.1093/ annonc /mdh301 . PMID 15319245 .
- ↑ Nádorové markery u rakoviny varlat . Archivováno z originálu 12. listopadu 2010. (neurčitý)
Další čtení
- Nye KE, Riley GA, Pinching AJ (1992). "Defekt pozorovaný v dráze hydrolýzy fosfatidylinositolu v lymfocytech a lymfoblastoidních buňkách infikovaných HIV je způsoben inhibicí inositol-1,4,5-trisfosfát-1,3,4,5-tetrakisfosfát-5-fosfomonoesterázy . " Clin. Exp. Immunol . 89 (1): 89-93. DOI : 10.1111/j.1365-2249.1992.tb06883.x . PMC 1554388 . PMID 1321014 .
- Lowe M. E. (1992). „Místně specifické mutace na COOH-konci placentární alkalické fosfatázy: změna jedné aminokyseliny převede protein ukotvený fosfatidylinositol-glykanem na sekretovaný protein“ . J. Cell Biol . 116 (3): 799-807. DOI : 10.1083/jcb.116.3.799 . PMC2289307 . _ PMID 1730777 .
- Micanovic R, Gerber LD, Berger J, Kodukula K, Udenfriend S (1990). „Selektivita místa štěpení/připojení membránových proteinů ukotvených fosfatidylinositol-glykanem stanovená místně specifickou mutagenezí na Asp-484 placentární alkalické fosfatázy“ . Proč. Natl. Akad. sci. USA . 87 (1): 157-61. DOI : 10.1073/pnas.87.1.157 . PMC 53219 . PMID2153284 . _
- Martin D, Spurr NK, Trowsdale J (1988). „RFLP genu lidské placentární alkalické fosfatázy (PLAP)“ . Nucleic Acids Res . 15 (21): 9104. doi : 10.1093 /nar/15.21.9104 . PMC 306450 . PMID 2891112 .
- Knoll BJ, Rothblum KN, Longley M (1988). "Nukleotidová sekvence genu lidské placentární alkalické fosfatázy." Evoluce 5' přilehlé oblasti delecí/substitucí“. J Biol. Chem . 263 (24): 12020-7. PMID 3042787 .
- Micanovic R, Bailey CA, Brink L, Gerber L, Pan YC, Hulmes JD, Udenfriend S (1988). "Kyselina asparagová-484 z nascentní placentární alkalické fosfatázy kondenzuje s fosfatidylinositolglykanem a stává se karboxylovým koncem zralého enzymu . " Proč. Natl. Akad. sci. USA . 85 (5): 1398-402. DOI : 10.1073/pnas.85.5.1398 . PMC 279778 . PMID 3422741 .
- Knoll BJ, Rothblum KN, Longley M (1988). „Dvě události genové duplikace ve vývoji lidských tepelně stabilních alkalických fosfatáz“. Gene . 60 (2-3): 267-76. DOI : 10.1016/0378-1119(87)90235-6 . PMID 3443302 .
- Ovitt CE, Strauss AW, Alpers DH, Chou JY, Boime I (1986). „Exprese různě velkých mRNA placentární alkalické fosfatázy v buňkách placenty a choriokarcinomu“ . Proč. Natl. Akad. sci. USA . 83 (11): 3781-5. DOI : 10.1073/pnas.83.11.3781 . PMC 323607 . PMID 3459156 .
- Millán JL (1986). „Molekulární klonování a sekvenční analýza lidské placentární alkalické fosfatázy“. J Biol. Chem . 261 (7): 3112-5. PMID 3512548 .
- Ezra E, Blacher R, Udenfriend S (1984). „Čištění a částečné sekvenování lidské placentární alkalické fosfatázy“. Biochem. Biophys. Res. komunální . 116 (3): 1076-83. DOI : 10.1016/S0006-291X(83)80252-6 . PMID 6651840 .
- Le Du MH, Stigbrand T, Taussig MJ, Menez A, Stura EA (2001). "Krystalická struktura alkalické fosfatázy z lidské placenty při rozlišení 1,8 A." Důsledky pro substrátovou specifitu“. J Biol. Chem . 276 (12): 9158-65. DOI : 10.1074/jbc.M009250200 . PMID 11124260 .
- Spurway TD, Dalley JA, High S, Bulleid NJ (2001). „Časné události při přidávání kotvy glykosylfosfatidylinositolu. substrátové proteiny asociované s transamidázovou podjednotkou gpi8p“. J Biol. Chem . 276 (19): 15975-82. DOI : 10.1074/jbc.M010128200 . PMID 11278620 .
- Rump A, Kasper G, Hayes C, Wen G, Starke H, Liehr T, Lehmann R, Lagemann D, Rosenthal A (2001). „Komplexní uspořádání genů v oblasti 220 kb dvojitě duplikované DNA na lidské 2q37.1“. Genomika . 73 (1): 50-5. DOI : 10.1006/geno.2000.6504 . PMID 11352565 .
- Wennberg C, Kozlenkov A, Di Mauro S, Fröhlander N, Beckman L, Hoylaerts MF, Millán JL (2002). „Struktura, typizace genomové DNA a kinetická charakterizace D alozymu placentární alkalické fosfatázy (PLAP/ALPP)“. Hučení. Mutat . 19 (3): 258-67. doi : 10.1002/ humu.10052 . PMID 11857742 .
- Kozlenkov A, Mánes T, Hoylaerts MF, Millán JL (2002). „Přiřazení funkce konzervovaným zbytkům v savčích alkalických fosfatázách“. J Biol. Chem . 277 (25): 22992-9. DOI : 10.1074/jbc.M202298200 . PMID 11937510 .
- Tang J, Li W (2002). „[Metodologická studie o testu aktivity glykosylfosfatidylinositol-specifické fosfolipázy D v séru]“. Hunan Yi Ke da Xue Xue Bao . 24 (2): 119-22. PMID 11938765 .
- Lehto MT, Sharom FJ (2002). "Blízkost proteinové části proteinu ukotveného GPI k povrchu membrány: studie FRET." biochemie . 41 (26): 8368-76. DOI : 10.1021/bi012038+ . PMID 12081485 .
- Le Du MH, Millan JL (2003). „Strukturální důkaz funkční divergence v lidských alkalických fosfatázách“. J Biol. Chem . 277 (51): 49808-14. DOI : 10.1074/jbc.M207394200 . PMID 12372831 .
- Llinas P, Stura EA, Menez A, Kiss Z, Stigbrand T, Millán JL, Le Du MH (červenec 2005). „Strukturální studie lidské placentární alkalické fosfatázy v komplexu s funkčními ligandy“. J. Mol. biol . 350 (3): 441-51. DOI : 10.1016/j.jmb.2005.04.068 . PMID 15946677 .
Enzymy |
---|
Aktivita |
|
---|
Nařízení |
|
---|
Klasifikace |
|
---|
Typy |
|
---|