Dinoflageláty

Dinoflageláty

"Peridinea" , ilustrace z E. Haeckela " Krása forem v přírodě " (1904)
vědecká klasifikace
Doména:eukaryotaPoklad:Sarsupertyp:AlveolátyTyp:Dinoflageláty
Mezinárodní vědecký název
Dinoflagellata Bütschli , 1885
Synonyma
  • Dinophyta (dinofytní řasy)
  • Peridinea (Peridinea)
Třídy

Dinoflagellati , neboli dinofytní řasy , nebo dinofyti , nebo peridinea [1] , nebo bičíkovci pancéřní [2] ( lat.  Dinoflagellata syn. Dinophyta, Peridinea) je velká skupina protistů z alveolového supertypu (Alveolata), kterému se tradičně přiřazuje tzv. hodnost typu . Je známo asi 4000 fosílií a více než 2500 moderních druhů [3] , z nichž 90 % žije v mořích, zbytek ve sladkých vodách [4] . Asi polovina zástupců je volně žijících fotosyntetickýchorganismů jsou však známy jak bezbarvé heterotrofní formy, tak parazitické dinoflageláty [5] . Některé druhy jsou symbionty korálových polypů a mlžů .

Dinoflageláty jsou převážně jednobuněčné monadické formy, pohyblivé buňky jsou vybaveny dvěma nestejnými bičíky . Buněčné obaly jsou reprezentovány amfiesmou (theca), skládající se z váčků , které leží pod plasmalemou . Mitochondrie s tubulárními kristami . Chloroplasty u různých zástupců mají různý původ a vyznačují se různými fotosyntetickými pigmenty . Obvykle jsou zbarveny do žlutohněda, protože kromě zelených chlorofylů mají další pigmenty - např. peridinin . Chloroplastový genom je často fragmentován do krátkých kruhových chromozomů. Mnoho druhů má stigma (oko) různých struktur. Osmoregulaci zpravidla provádějí jedinečné organely  - puzuly . Často se vyskytují žahavé struktury ( trichocysty a další). Sladkovodní formy uchovávají škrob , mořské formy uchovávají lipidy a steroly .

Dinoflagelátové chromozomy jsou typicky kondenzované během buněčného cyklu a postrádají typické eukaryotické histony . Mitóza je uzavřena, metafázová ploténka se nevytváří. Charakteristickým rysem dinoflagelátů, který se u jiných eukaryot nenachází, je částečné nahrazení thyminu v jejich jaderné DNA jinou dusíkatou bází  , 5-hydroxymethyluracilem.

K rozmnožování dochází nejčastěji podélným dělením buňky na dvě části. Nepohlavní rozmnožování  je zoosporami a aplanosporami . U některých druhů byl popsán pohlavní proces . Většina zástupců má haplobiontní životní cyklus se zygotickou redukcí, ale existují výjimky. Mnoho druhů je schopno tvořit klidové formy ( cysty ).

Mnoho druhů je schopno bioluminiscence . V buňkách dinoflagelátů se navíc často tvoří toxiny  – například goniatoxin . Tento toxin má tendenci se hromadit v tkáních měkkýšů, korýšů, ryb, což vede k otravě zvířat, která se jimi živí, a také lidí, pokud je pozře [6] .

Dinoflageláty hrají důležitou roli v biocenózách moří a oceánů, kde spolu s rozsivou působí jako hlavní primární producenti . Fototrofní dinoflageláty jsou schopny způsobit květy řas a jejich masivní výskyty v pobřežních vodách jsou zodpovědné za výskyt „ červených přílivů “. Parazitické dinoflageláty někdy způsobují epizootiku v populacích ryb a korýšů.

Historie studia

První organismy v současnosti klasifikované jako dinoflageláty byly popsány v roce 1753 anglickým přírodovědcem Henry Bakerem ve svém pojednání „Zaměstnání pro mikroskop“ [7] jako „malá zvířata, která způsobují záři mořské vody“; Mluvil jsem o nočních světlech . V roce 1773 popsal dánský přírodovědec Otto Frederik Müller ve své knize [8] dva druhy sladkovodních dinoflagelátů a dal jim jména Bursaria hirundinella a Vorticella cincta (nyní známá jako Ceratium hirundinella a Peridinium cinctum ). Německý přírodovědec Christian Gottfried Ehrenberg ve 30. letech 19. století po prostudování mnoha vzorků mořské a sladké vody popsal v článku „Beiträge zur Kenntnis der Organization der Infusorien und ihrer geographischer Verbreitung, besonders in Sibirian“ [9] a v řadě následujících práce, několik v současnosti významných rodů dinoflagelátů, včetně Peridinium , Prorocentrum a Dinophysis . Podle prvního z nich se zástupcům uvažované skupiny začalo říkat Peridineové [10] .

V roce 1885 německý vědec Otto Buchli vyčlenil [11] tuto skupinu organismů do řádu prvoků Dinoflagellata (v typizované verzi - Dinoflagellida ; tento název taxonu používali protozoologové dlouhou dobu ). Název je odvozen z jiné řečtiny. δῖνος 'rotace' a lat.  bičík 'bičík' [12] . Algologové Eugenius Warming ( 1890 ) a Adolf Engler ( 1892 ) zároveň umístili dinoflageláty do rostlinné říše . Německý botanik Adolf Pascher ve svém systému řas ( 1914 ) identifikoval dinoflageláty ve třídě Dinophyceae jako součást oddělení Pyrrophyta (doslova „ohnivý rostliny“ - z jiného řeckého πῦρ 'oheň' a φυτóν 'rostlina'; název je dán proto, schopnosti některých druhů bioluminiscence [13] ). V pozdějších botanických klasifikacích byly dinoflageláty obvykle buď považovány za třídu v rámci Pyrrophyta, nebo byly rozděleny do nezávislé divize Dinophyta [14] [15] .

První podrobné systémy fosilních dinoflagelátů se objevily v 50. a 60. letech 20. století; vznikající mezera mezi klasifikacemi moderních a fosilních dinoflagelátů byla z velké části překonána v 90. letech 20. století, což bylo usnadněno důkladnějším studiem morfologie fosilních zástupců (což bylo možné s rozvojem elektronové mikroskopie ) a životními cykly moderních druhů . [10] .

Buněčná biologie

Vegetativní stadium životního cyklu dinoflagelátů je zastoupeno převážně monadickými formami s dorzoventrální strukturou , mnohem méně časté jsou rhizopodiální a kokoidní buňky [16] . Další fáze životního cyklu však mohou představovat palmeloidní, améboidní , vláknité a dokonce i polynukleární formy [3] . Parazitická Pfiesteria piscicida se tak v některých fázích svého životního cyklu přeměňuje do améboidní formy. Jiné dinoflageláty mohou také změnit svůj vzhled. Zejména někteří zástupci jsou schopni mít podobu „holé“, bez bičíkové koule ( palmella ). Jednobuněčná palmela dělením dává vzniknout husté akumulaci buněk. Dinoflageláty žijící v korálech jako zooxanthellae mají vždy podobu palmely [17] .

Dále je v této části popsána struktura vegetativního stadia dinoflagelátů; struktura dalších fází životního cyklu je popsána v částech Životní cyklus a reprodukce a Odpočinkové formy .

Tvar dinoflagelátů je rozmanitý: kulovitý, eliptický, vejčitý, obvejčitý, hruškovitý, hvězdicovitý, tyčinkovitý [18] , ve tvaru půlměsíce nebo čtyřstěnu . Buňky jsou zpravidla zploštělé, v průřezu vypadají jako elipsa nebo deska, méně často je tělo zaoblené a není zploštělé. Velikost buněk se pohybuje od 6 do 2000 mikronů . Největší dinoflageláty žijí v mořích a ze sladkovodních zástupců jsou největší buňky charakteristické pro druhy rodu Ceratium , jejich velikost je až 450 mikronů [16] .

Rozmanitost tvarů dinoflagelátových buněk
Ceratium Gymnodinium Noční světlo ( Noctiluca ) Peridinium willei Symbiodinium Pfiesteria . Améboidní a bičíkaté formy, cysta Dinophysis acuminata

Kryty buněk

U dinoflagelátů jsou buněčné kryty reprezentovány vnější plazmalemou a amfiesmou , která je pod ní , nebo theka  - kombinace cytoplazmatické membrány a řady amfiesmálních (thekálních) váčků umístěných pod ní nebo alveoly , z nichž každá je zploštělá vezikula. obklopený jedinou membránou . V kůži je mnoho pórů, pod kterými leží trichocysty [19] . Počet tekálních vezikul se pohybuje od několika stovek (např. Gymnodinium ) do dvou (např . Prorocentrum ) na buňku. Jejich umístění také není stejné: například u Oxyrrhis jsou thekální váčky od sebe odděleny a u některých dalších zástupců jsou v kontaktu. U některých druhů jsou tekální váčky vyplněny pouze amorfní hmotou. Takové formy se nazývají nahé nebo neskořápkové [20] . U jiných obsahují tekální destičky, sestávající z celulózy a dalších polysacharidů , u některých druhů jsou navíc pokryty proteinovým filmem [21] ; obal takových dinoflagelátů se nazývá krunýř . Je třeba poznamenat, že čím tlustší jsou tekální desky, tím méně jsou. V Katodinium jsou desky relativně tenké, zatímco v Peridinium a Ceratium jsou velmi silné a mohou mít různé výrůstky, přičemž jejich počet je snížen na dva tucty. Výrůstky na schránkách dinoflagelátů mohou mít podobu rohů, křídel, šupin, výrazně zvětšují povrch buňky [18] . Bylo prokázáno, že některé dinoflageláty jsou schopny za určitých podmínek shodit své skořápky, například když jsou ochlazeny na 4 °C, ale když se buňky, které svlékají své skořápky, přenesou do normálních podmínek, skořápky se obnoví. Desky, které tvoří skořápku, hrají klíčovou roli při identifikaci pancéřových dinoflagelátů. Tvoří takzvaný theca vzorec , kde jsou určité desky označeny čísly a písmeny. Jako systematické znaky se používá také tvar, množství, umístění destiček a přítomnost výrůstků [22] .

U amfiesmatu se rozlišují tři části: horní epivalva (epitecium, episoma, epikon), dolní hypovalva (hypotéka, hyposom, hypokonus) a střední - pletenec neboli cingulum , který spojuje epivalvu a hypovalvu. U obrněných forem se epivalva a hypovalva skládají ze samostatných štítků, které jsou v určitém pořadí spojeny stehy. Růst skořápky je způsoben růstem švů. Epivalva a hypovalva jsou dvě hemisféry sbíhající se v oblasti pletence [18] . Špička epivalvy někdy končí vrcholem , přičemž spodní konec krunýře se nazývá antapex . U mnoha druhů má krunýř dvě na sebe kolmé rýhy – příčné a podélné, ve kterých leží bičíky [23] . Příčná rýha rozděluje krunýř na epivalvu a hypovalvu, může být posunuta k přednímu ( Amphidinium ) nebo zadnímu ( Katodinium ) konci, nebo probíhá podél rovníku buňky. Příčná rýha může zcela obepínat hřbetní stranu krunýře, spojovat (prstencová) nebo nespojovat (spirála stočená) s druhým koncem na ventrální straně. Podélná rýha se nachází na ventrální straně a probíhá pouze podél hypovalvy, jen někdy přechází do epivalvy. U druhů rodu Gonyaulax však dosahuje nejen vrcholu, ale přechází i na hřbetní stranu [24] .

Pod thecal vesicles leží vrstva microtubules . Kromě toho má mnoho dinoflagelátů v tekálních vezikulách pod deskami další vrstvu, která je odolná vůči silným kyselinám a zásadám a skládá se z látky připomínající sporopollenin . Některé druhy mají navíc pod tekálními váčky další membránu. Některé dinoflageláty, jako je Amphidinium carterii , mají glykokalyx mimo plasmalemma , sestávající z kyselých polysacharidů. Možná je tvořen cytoplazmatickými mukocystami [24] .

Některé dinoflageláty mají na povrchu svých buněk organické šupiny, jako je Lepidodinium viride . U Heterocapsa se šupiny tvoří v Golgiho aparátu a migrují ve váčcích do bazálních těl bičíků, odkud se uvolňují na buněčný povrch [19] . Někteří zástupci mají vnitřní křemíkovou kostru. U fagotrofních dinoflagelátů Actiniscus pentasterias se tedy v blízkosti jádra nacházejí dvě pěticípé křemíkové hvězdy [24] .

V některých zdrojích se „amfyesma“ vztahuje k nejsvrchnějším vrstvám dinoflagelátové buňky (plazmalema, tekální váčky s destičkami a vrstvou mikrotubulů) a „theca“ se vztahuje k celku tekálních váčků [21] .

Flagella

U různých dinoflagelátů mohou být bičíky připevněny různými způsoby. Vybíhají -li z apikálního konce buňky dva nestejné bičíky, pak se tento typ nazývá desmokont (např. v Prorocentru ); taková varianta výboje bičíků je považována za primitivní. V tomto případě je při plavání jeden bičík nasměrován dopředu a druhý je kolmý na první. Většina dinoflagelátů má však evolučně pokročilejší variantu, kdy oba nestejné bičíky vybíhají z ventrální strany buňky ( typ bičíku dinokont ). U těchto dinoflagelátů se buňky dělí na epivalvu a hypovalvu, přičemž příčný bičík leží v příčném žlábku a podélný bičík v podélném [25] .

Oba bičíky mají axoném typický pro eukaryota ( 9 periferních mikrotubulových dubletů a 2 centrální mikrotubuly). Každý bičík se vynoří z malé invaginace na povrchu buňky ( bičíkový kanál ), který se otevírá bičíkovým pórem . U většiny dinoflagelátů má každý bičík svůj vlastní bičíkový kanál. Přechodová zóna bičíků u některých druhů může zahrnovat 2 paralelní disky na bázi dvou centrálních mikrotubulů a jeden nebo dva pod nimi ležící prstence. U většiny dinoflagelátů je však přechodová zóna představována silně zakřivenou příčnou destičkou se silnými obvodovými hřebeny a vyvinutým ztluštěním ve středu destičky (axosom). U Gymnodinium lanskaya a Heterocapsa pigmaea je nad příčnou ploténkou umístěn přechodný válec a u posledně jmenovaných druhů jsou navíc příčné plotny dvě místo jedné [25] .

Příčný bičík vypadá jako zvlněná stuha a je 2-3x delší než bičík podélný. Vystupuje z horního bičíkového póru a otáčí se doleva a obklopuje buňku. Kromě axonémy má příčně pruhovanou paraxiální šňůru, sestávající z centrinového proteinu  - Ca 2+ -dependentního kontraktilního proteinu. Plní mechanickou funkci a je vždy kratší než axoném, který je kolem něj uspořádán do levotočivé spirály. Kontrakce bičíku je doprovázena zvýšením stupně spiralizace axonémy. Na membráně příčného bičíku je řada dlouhých (2-4 mikrony dlouhých a 10 nm širokých) jednoduchých tenkých chloupků ( mastigonémy ), které mohou být stejné nebo různé délky. Poslední mikrometr příčného bičíku je bez chloupků a paraxiálního provazce. Tento bičík se při pohledu z předního konce buňky pohybuje v krátkých periodických vlnách proti směru hodinových ručiček ( leiotropní směr), čímž zajišťuje rotační a translační (ve formě tlaků) pohyby buněk [3] . Příčný bičík hraje roli kormidla buňky. Buňka se vždy otáčí ve směru úderu bičíku, takže tekutina směřuje opačným ( dexiotropním ) směrem [26] . Noctiluca nemá žádný příčný bičík a nemůže se při plavání otáčet [25] .

Podélný bičík pochází z dolního bičíkového póru a táhne se podél buňky a jde za ni. Tento bičík má společnou strukturu a často jsou chloupky (až 0,5 µm dlouhé a až 10 nm široké) na jeho membráně uspořádány ve dvou řadách. Někdy je v podélném bičíku také paraxiální provazec. Po délce podélného bičíku probíhá R-vlákno. Ke stažení bičíku dochází při zkrácení R-vlákna o třetinu jeho délky, což je způsobeno vstupem iontů Ca 2+ do podélného bičíku. Pohybuje se ve vlnách a s jeho pomocí buňka provádí translační pohyb v dopředném směru, náhle se zastaví a vrátí se zpět. Mechanické působení na buňky Ceratium tripos způsobí stažení podélného bičíku tak, aby zapadl do podélné rýhy [19] [25] .

Mezi fotosyntetickými jednobuněčnými organismy jsou dinoflageláty nejrychlejšími plavci, jejich rychlost pohybu je 200–500 µm/s. Stále jsou však horší než Mesodinium  , organismus, který je endosymbiózou nálevníků a kryptofytních řas . Buňky Lingulodinium polyedrum plavou lineární rychlostí 250 μm/s při teplotě 20 °C, zatímco buňky Gyrodinium při stejné teplotě vyvinou lineární rychlost 319 μm/s [27] .

Bazální těla bičíků u dinoflagelátů mají strukturu typickou pro eukaryota . Mohou být umístěny pod úhlem téměř 180°, navzájem kolmo nebo rovnoběžně. Z bazálního těla podélného bičíku začíná stuhovitý kořen mikrotubulů, procházející pod podélnou rýhou. Bazální tělo příčného bičíku je spojeno s mikrotubulárním kořenem jednoho nebo dvou mikrotubulů, ke kterým je v pravém úhlu připojena další řada mikrotubulů jako hřeben. Bazální tělíska jsou navzájem spojena příčně pruhovaným spojením centrinu. U různých dinoflagelátů může být radikulární systém jak redukován, tak komplikován přidáním dalších složek [25] .

Dinoflageláty s nemonádovým typem organizace thallusu - kokoidní  (rody Cystodinium , Stylodinium , Tetradinium a další), rhizopodiální ( Dinamoebidium ), palmeloidní ( Gloeodinium ), vláknité ( Dinothrix , Dinoclonium , Rufusiella s buňkami ve stadiu zoospore ) - jsou pohyblivé. dva bičíky připomínající vegetativní buňky gymnodinia a později bičíky. Zároveň u organismů s vláknitým stélkem po odhození bičíků buňky provedou několik dělení, ale nerozcházejí se, ale tvoří slabě se větvící vlákno zaoblených buněk [28] [29] .

Jádro a genetický aparát

Morfologie jádra

Organizace jádra a genetického aparátu dinoflagelátů je velmi neobvyklá; z tohoto důvodu se jádro dinoflagelátů nazývá mesokaryon nebo dinokaryon . Zejména chromozomy dinoflagelátů jsou kondenzovány během celého buněčného cyklu (včetně interfáze ). Je zajímavé, že hlavním strukturálním proteinem chromatinu v dinoflagelátech je protein virového původu, zcela odlišný od histonů , dinoflagelátový virový nukleoprotein (DVNP). U většiny studovaných druhů se však histony také exprimují [30] . Protože chromozomy v jádrech dinoflagelátů neprocházejí cyklickými přeměnami a jsou neustále kondenzovány, někteří autoři navrhují nazývat tento typ jaderné organizace chromozomální. Obvykle jsou chromozomy umístěny v nukleoplazmě v určité vzdálenosti od sebe, vyplňují celý prostor jádra a téměř úplně maskují jeho obsah; to se děje např. u Gloeodinium montanum a Amphidinium elegans [31] . U některých dinoflagelátů, většinou volně žijících, jsou některé chromozomy připojeny ke skořápce a zůstávají v tomto stavu po celou dobu mitózy. Někdy jsou v jadérku zabudovány jednotlivé chromozomy [32] . Kvůli neustálé kondenzaci chromozomů v dinoflagelátech byly dokonce považovány za přechodný článek mezi prokaryoty a eukaryoty ( mesokaryoty ), dokud nebylo navázáno spojení dinoflagelátů s Alveolata [33] .

Jádro v dinoflagelátových buňkách může mít nejrozmanitější tvar: kulovitý, vejčitý, trojúhelníkový, srpovitý, vícelaločný, podkovovitý, ledvinovitý nebo tupě kuželovitý. Velikost jádra se také velmi liší: od 0,37 mikronů ( Cochlodinium heterolobatum ) do 40-50 mikronů ( Ceratium cornutum ). Obvykle je jádro umístěno ve středu buňky, ale může být posunuto na přední nebo zadní konec. Jeho umístění v buňce závisí na fázi životního cyklu a přítomnosti nebo nepřítomnosti trávicí vakuoly . Každý obsahuje jedno nebo více nukleolů schopných fúze . Někdy je jádro dinoflagelátů obklopeno kromě dvoumembránového obalu také kanálem endoplazmatického retikula ( Ceratium hirundinella ), několik takových kanálů bylo identifikováno u Nematodinium armatum [34] . Dinoflagelátové buňky se vyznačují velmi vysokým obsahem DNA . Jiné eukaryotické buňky typicky obsahují mezi 0,046 a 3 pg DNA na buňku, zatímco dinoflageláty mají mezi 3 a 250 pg DNA, tj. celková velikost DNA obsažené v jejich buňkách je od 3 000 do 215 000 megabází (Mb, milion párů bází) .). Pro srovnání, haploidní lidský genom je 3180 Mb, zatímco genom hexaploidní pšenice je 16 000 Mb [35] [36] .

Počet chromozomů u dinoflagelátů se velmi liší: od 4 u Syndinium borgertii a 12–18 u Prorocentrum balticum po 260–280 u Ceratium hirundinla , 325 u Endodinium chattonii a 500–600 u jednotlivých druhů Gymnodinium [ 36] . Volně žijící dinoflageláty mají zpravidla více chromozomů než parazitické. Velikosti chromozomů se velmi liší i v rámci stejného karyotypu . Například u Prorocentrum micans dosahuje jejich délka 10-15 µm, u Woloszynskia stoschii  - 1,3-3,3 µm, u Gymnodinium indicum  - od 0,75 do 1,5 µm a u Katodinium rotundata průměr téměř kulovitých chromozomů nepřesahuje 5 µm. Takové krátké chromozomy postrádají centromery a sekundární zúžení a jsou špatně diferencované na délku. Tvar chromozomů je také různý a tvar chromozomů souvisí s jejich velikostí: dlouhé - vláknité ( Prorocentrum micans ), krátké tyčinkovité ( Gymnodinium vitiligo ), malé - tečkovité nebo soudkovité ( Amphidinium klebsii ). Obvykle je karyotyp jednoho druhu reprezentován chromozomy stejné formy, které jsou morfologicky nerozlišitelné. S tím jsou spojeny potíže s počítáním počtu chromozomů u dinoflagelátů, takže obvykle lze jejich počet pouze přibližně odhadnout [37] .

Ne všechny dinoflageláty mají dinokaryony. Někteří zástupci jádra jsou obyčejní eukaryoti ( Noctiluca , Oodinium [38] ); u některých zástupců jsou jádra ve vegetativních buňkách obyčejná a dinokaryon je přítomen i v jiných fázích buněčného cyklu (například gamety). U volně žijícího dinoflagelátního Oxyrrhis marina jsou chromozomy méně kondenzované než u dinokaryonu a obsahují typické eukaryotické histony [39] .

Některé dinoflageláty mají dvě jádra a na rozdíl od jiných vícejaderných buněk (například nálevníků ) tato jádra obsahují DNA různého původu: jedno jádro obsahuje genetickou informaci dinoflagelátu a druhé jádro je ve skutečnosti jádrem symbiotický rozsivek . Zajímavé je, že nejen jádro, ale i mitochondrie a plastidy rozsivek si zachovávají svoji funkčnost [40] .

DNA

Vegetativní fáze dinoflagelátů je haploidní, jedinou výjimkou je bledule diploidní ( Noctiluca ) [ 1] . Chromozomy dinoflagelátů jsou morfologicky stejné [36] a jsou kondenzované v průběhu celého buněčného cyklu – na rozdíl od jiných eukaryot, u kterých chromozomy kondenzují pouze během mitózy a v interfázi, kdy dochází k aktivní transkripci , je stupeň kondenzace mnohem nižší. Nedávné studie Pyrocystis lunula však odhalily přítomnost 49 párů chromozomů různé velikosti a morfologie v tomto dinoflagelátu, což svědčí o jeho diploidii [33] . Ve světelném mikroskopu jsou viditelné jako jasné struktury a na ultrastrukturální úrovni mají fibrilární strukturu [38] . Kondenzaci chromozomů v interfázi pozorujeme také u euglenoidů , ale na rozdíl od nich se dinoflagelátová DNA vyznačuje také neobvyklým chemickým složením [35] . Dinoflagelátové chromozomy postrádají centromery a během mitózy jsou připojeny kinetochory přímo k jaderné membráně [41] .

Dinoflageláty postrádají typické eukaryotické jádrové histony ( H2A , H2B , H3 , H4 ), ale mají možný histonový homolog H1 (histon) , který reguluje zhušťování DNA. Nedávné analýzy transkriptomů však odhalily přítomnost transkriptomů v dinoflagelátech nejen všech jádrových histonů, ale také některých jejich variant ( H2A.X a H2A.Z ). Tyto proteiny se zjevně nepodílejí na balení většiny genomové DNA (alespoň ve vegetativní fázi životního cyklu většiny dinoflagelátů). Možná se podílejí na sbalení pouze velmi malé části genomu a z tohoto důvodu nejsou určeny experimentálně; nebo možná sbalují DNA pouze v některých fázích životního cyklu (včetně cyst) [33] . Z tohoto důvodu nemají dinoflageláty nukleozomy a DNA je zabalena jinak: opakovaně se spirálovitě spiralizuje a tvoří silná vlákna, ačkoli jejich elementární fibrily (mikrofibrily) mají tloušťku 2–8 nm, jako bakterie , namísto silnějších eukaryotických fibril 10–25 nm tloušťka nm [42] . Chromozomy dinoflagelátů se liší v hustotě, která přímo závisí na tom, jak pevně jsou mikrofibrily chromozomů uloženy. Tento faktor může záviset na fázi buněčného cyklu, změnách světelného režimu, koncentraci živin , takže v organismech stejného druhu lze nalézt více či méně volné chromozomy [37] .

Mezi dusíkatými bázemi v dinoflagelátech jednoznačně převládají frakce adeninu a thyminu a ve velmi malém množství (0,4 ± 0,3 %) je přítomen 5-methylcytosin . Jak ukázal v roce 1973 Peter Ray, který studoval složení jaderné DNA u druhu Gyrodinium cohnii , asi 37 % thyminu v ní bylo nahrazeno jinou pyrimidinovou bází, 5-hydroxymethyluracilem [43] . Pozdější studie ukázaly, že podíl substituovaného thyminu v různých druzích dinoflagelátů se pohybuje od 12 % do 70 %, a to je jejich jedinečná vlastnost, která se u jiných eukaryot nenachází; současně je 5-hydroxymethyluracil přirozenou součástí genomu některých bakteriofágů  , například fágů bacilů sena ( Bacillus subtilis ). U většiny eukaryot se tato dusíkatá báze tvoří během oxidace thyminu nebo 5-methylcytosinu a je rychle opravena pomocí DNA glykosylázy . Funkční význam 5-hydroxymethyluracilu v jádrech dinoflagelátů zůstává neznámý [33] [44] . Stejně jako většina ostatních eukaryot mají dinoflageláty methylované motivy mCpG a 5-methylcytosin a také neobvyklý N 6 - methyladenin [35] [42] . Syntéza DNA u dinoflagelátů není omezena na určitou fázi buněčného cyklu, jako u jiných eukaryot, ale probíhá nepřetržitě, jako u prokaryot [45] .

Místo typických histonů mají dinoflageláty speciální základní proteiny podobné histonům (HLP ), které provádějí balení DNA .  Svou sekundární strukturou se podobají histonovým proteinům bakterií. Ve srovnání s jádrovými histony mají tyto proteiny velmi malou afinitu k DNA. Dinoflagelátové HLP jsou spojeny s jadérkem a smyčkami vyčnívajícími z kondenzovaných chromozomů. Koncentrace těchto proteinů jsou extrémně nízké a poměr základní protein:DNA je pouze 0,08-0,13, zatímco u většiny eukaryot se tato hodnota blíží 1 [35] . Pouze 20 % genomové DNA je chráněno proteiny a obvykle chráněné oblasti o 10–15 kilobázích jsou odděleny dlouhými nechráněnými oblastmi. Bylo prokázáno, že DNA v dinoflagelátových chromozomech může být ve dvou stavech: hlavní frakce, která obsahuje transkripčně neaktivní DNA, a difúzní periferní frakce, která obsahuje transkripčně aktivní DNA. Tato data podporují dlouhodobou hypotézu, že k transkripci v dinoflagelátech dochází mimo chromozomy, kde příslušné enzymy mohou přistupovat k sekvencím DNA mimo kondenzované chromozomy [36] . HLP jsou schopny regulovat hladinu kondenzace DNA v závislosti na vlastní koncentraci, jsou tedy pravděpodobně zodpovědné za kondenzaci vyčnívajících smyček a regulují přístup transkripčních faktorů ke genům [33] .

Renaturační experimenty ukázaly, že i dinoflageláty s obrovskými genomy mají velký podíl unikátních sekvencí. U Heterocapsa pygmaea je to tedy 75 %, u Crypthecodinium cohnii  40–45 % a u Glenodinium foliaceum  56 % [42] . U heterotrofa Crypthecodinium cohnii jsou jedinečné sekvence (1-3 kopie) odděleny opakujícími se oblastmi dlouhými asi 600 nukleotidů . Celková délka unikátních sekvencí v tomto dinoflagelátu je 1,5 × 10 9 párů bází, což je typické pro „vyšší“ eukaryota. U autotrofního dinoflagelátu Wolosynskia bosteniensis se délka jedinečných sekvencí odhaduje na 1,32 × 10 10 , což je řádově větší než analogický parametr u savců . Z tohoto důvodu je hypotéza, která vysvětluje velké množství DNA v dinoflagelátních buňkách polyploidií nesprávná: v polyploidii bude podíl unikátních sekvencí mnohem nižší [36] .

Genová exprese

Nedávno bylo učiněno několik důležitých objevů týkajících se rysů transkripce u dinoflagelátů. Jedním z nich byl objev 5' - trans sestřihu dinoflagelátových transkriptů. Ukázalo se, že 5'-konce všech transkriptů exprimovaných v jádře obsahují stejnou vedoucí sekvenci o délce 22 nukleotidů. K dnešnímu dni byl trans- sestřih popsán u všech studovaných dinoflagelátů, dokonce i těch, které se v průběhu evoluce velmi brzy rozcházely, takže se zdá, že tento proces byl jedním z prvních akvizic dinoflagelátové větve. Samotné vedoucí sekvence jsou kódovány řadami repetitivních genů neznámé velikosti a počtu. Fenomén trans- sestřihu byl popsán pro omezené množství mRNA u některých jiných eukaryot, ale nejlépe je studován na trypanozomech , které jej široce využívají. Intenzivní využívání 5' - trans sestřihu dinoflageláty a trypanozomy je zjevně výsledkem konvergentní evoluce [33] .

Některé další vlastnosti genetického aparátu dinoflagelátů také odhalují podobnosti s trypanosomy. Stejně jako trypanozomy mají dinoflageláty geny uspořádané v tandemových řadách, které kódují téměř identické proteiny. Ukázalo se, že nejintenzivněji exprimované geny jsou sestaveny do větších tandemových řad, zatímco geny, které jsou exprimovány na nízké úrovni, jsou přítomny v jediné kopii a obsahují více intronů . Transkripty, stejně jako transkripty jiných eukaryot, obvykle obsahují polyadenylační signál (AAAAG/C). Někdy transkripty dinoflagelátů neobsahují introny a zralé mRNA mohou být jak polycistronické , tak diskrétní a také v některých případech postrádají polyadenylaci [46] . Genová amplifikace může být důležitým procesem ovlivňujícím regulaci genové exprese u dinoflagelátů během evoluce . Pokud je u dinoflagelátů, stejně jako u trypanozomů, exprese většiny genů posttranskripčně regulována , pak genová amplifikace v genomu může být klíčovým mechanismem pro regulaci počtu genových transkriptů v buňce. Některé geny v řadě postrádají typické promotory rozpoznávané RNA polymerázou II , ačkoli tento enzym stále funguje jako RNA polymeráza v dinoflagelátech [46] . V blízkosti genů dinoflagelátů nejsou žádné TATA boxy , nicméně v Crypthecodinium cohnii byl nalezen modifikovaný TATA-binding protein (TBP), který vykazoval vysokou afinitu k motivu TTTT. Doposud nebyly identifikovány žádné takové promotory. Je možné, že celá série má jeden upstream promotor. Protože řady dinoflagelátů sestávají spíše z kopií stejného genu než z různých genů, jako u trypanozomů, mohou být jednotlivé genové rodiny stále regulovány na transkripční úrovni upstream promotorem [33] .

Je pravděpodobné, že dinoflageláty se při regulaci genové exprese spoléhají hlavně na post-transkripční mechanismy [33] , i když probíhají i mechanismy kontroly transkripce . V některých případech závisí použití určitých mechanismů na vnějším podnětu. Transkripční regulace byla prokázána pro protein vázající peridinin -chlorofyl a , protein podobný S-adenosylhomocysteinhydroláze , protein podobný methionin-aminopeptidáze a také protein podobný histonu. Posttranskripční mechanismy byly popsány v regulaci genu pro protein vázající luciferin a glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenázy [36] .

Přes všechny rozdíly v genetickém aparátu dinoflagelátů od jiných eukaryot se ukázalo, že sestřih a proteiny a RNA jej poskytující jsou téměř stejné jako u vyšších eukaryot. Zachovali malé jaderné RNA U1 -U6 , které sdílejí sekundární strukturu a post-transkripční modifikace podobné těm z vyšších eukaryot . Zdálo se, že jaderná tělíska obsahující sestřihové proteiny jsou podobná Cajalovým tělískům jiných eukaryot [46] .

Ukázalo se, že u dinoflagelátů závisí exprese malého, ale významného podílu genů na různých podmínkách. Analýza transkriptomu Pyrocystis lunula pomocí microarrays ukázala, že počet transkriptů asi 3 % genů se významně změnil v souladu s cirkadiánními rytmy a další 4 % - s oxidačním stresem . Byly provedeny studie o rozdílech v transkriptomech kmenů dinoflagelátů tvořících a netvořících toxiny . Ukázalo se, že 4–7 % transkriptomů se v těchto případech významně liší [33] .

Mitóza

Mitóza dinoflagelátů je charakterizována řadou znaků: jaderná membrána je zachována (uzavřená mitóza), metafázová deska není vytvořena . Tento typ uzavřené mitózy se nazývá dinomytóza [47] . Jako příklad nejpokročilejšího typu mitózy u dinoflagelátů uvažujme mitózu Syndinium . Začátek dělení je označen zdvojením základů bičíků ze dvou na čtyři. Během této fáze se jádro zvětšuje a lze vidět mnoho chromozomů ve tvaru Y a V. V profázi mitózy dochází k podélnému štěpení chromozomů a tvoří se chromatidy , spirálovitě stočené kolem sebe. Trvání profáze u dinoflagelátů je do značné míry určeno délkou chromozomů: čím delší jsou chromozomy, tím déle jim trvá, než se rozvinou [48] .

Jaderná membrána zůstává během mitózy nedotčena a během mitózy dochází k jejím hlubokým invaginacím (u některých dinoflagelátů se jaderná membrána rozpouští). Některé z nich tvoří tunely typu end-to-end procházející celým jádrem skrz naskrz (vytvořeno je 1 až 15 tunelů). Tyto tunely jsou vyplněny cytoplazmou a začnou se v nich shromažďovat mikrotubuly, které však nejsou spojeny s neporušeným jaderným obalem. Mikrotubuly se shromažďují ve svazcích po 25-40 bezprostředně po rozdělení chromozomů na chromatidy. U Amphidinium carterae se v jádře tvoří 2-4 tunely, u jiných druhů je jich více [48] .

Již bylo uvedeno výše, že chromozomy jsou připojeny k jaderné membráně přímo prostřednictvím speciálních kinetochorů (kinetochorových destiček). Kinetochorové desky se objevují v plně vytvořených tunelech spolu s diferenciací jaderného obalu. Jaderná membrána tedy jakoby vymezuje chromozomy a mikrotubuly vřeténka. Dinoflagelláty jsou jedinou řasou s mimojaderným vřeténem [48] [49] .

V metafázi dinoflageláty netvoří metafázovou desku, která je charakteristická pro mitózu u vyšších eukaryot, a chromozomy zůstávají rozptýleny po celém jádře. Jadérko existuje během celého buněčného cyklu a dělí se vytvořením zúžení uprostřed. V anafázi se buňka a jádro prodlužují v postranním směru a chromozomy se rozcházejí směrem k opačným koncům jádra. Zatímco laterální elongace stále probíhá, jaderná membrána vytvoří zúžení ve středu buňky a dceřiná jádra se osamostatní [48] [49] .

Na vřetenových pólech mohou mít dinoflageláty jak typické centrioly ( centrická mitóza ), tak polární útvary zcela odlišného charakteru ( acentrická mitóza ). Polární útvary mohou představovat oblast cytoplazmy s velkou akumulací prvků endoplazmatického retikula a diktyozomů ; v jiných případech jsou to bezstrukturní průsvitné uzávěry cytoplazmy; konečně polární formace může být morfologicky diferencované bezstrukturní multilobulární těleso [50] .

Mitochondrie

Mitochondrie dinoflagelátů mají tubulární kristy , které vybíhají z vnitřní membrány a jsou na bázi zúžené [51] . Organizace mitochondriálního genomu dinoflagelátů má řadu jedinečných rysů. Jejich mitochondriální genom, stejně jako jejich blízkých příbuzných - apikomplexů , je výrazně redukován: má pouze 3 geny kódující protein (kódující cytochrom b (cob) , podjednotku 1 cytochrom c-oxidázy (cox1) a podjednotku 3 cytochrom oxidázy (cox3) ), dva geny kódující rRNA (malou podjednotku (SSU) a velkou podjednotku (LSU) rRNA) a vůbec žádné geny kódující tRNA [33] . V dinoflagelátech i apikomplexech jsou mitochondriální geny rRNA významně fragmentovány. Mitochondriální genom dinoflagelátů prošel významnou amplifikací a rekombinací , výsledkem je mnoho kopií genů a genových fragmentů, které se navzájem spojují v různých kombinacích. Nekódující sekvence prošly podobnými duplikacemi a přeskupením . Některé dinoflageláty v mitochondriálním genomu obsahují invertované repetice , které mohou tvořit prvky sekundární struktury (například vlásenky ). V důsledku duplikace a rekombinace zůstává skutečná velikost a organizace mitochondriálního genomu dinoflagelátů neznámá. Předběžné studie pomocí gelové elektroforézy ukázaly, že mitochondriální genom je rozptýlen v mnoha lineárních chromozomech, jejichž velikost nepřesahuje 30 kilobází [52] .

Kromě toho se exprese mitochondriálních genů u dinoflagelátů vyznačuje také neobvyklými rysy. Geny kódující protein mtDNA postrádají standardní start kodony AUG , navíc ani dinoflageláty nepoužívají běžné stop kodony . Transkripty cox1 a cob zcela postrádají stop kodony, transkripty cox3 mají stále stop kodon UAA, ten se však nepřepisuje z DNA, ale vzniká oligoadenylací U umístěného na konci původního transkriptu a je součástí poslední čtecí rámec . V dinoflagelátu Karlodinium micrum zahrnuje zpracování transkriptu cox3 trans- sestřih mRNA, což je proces, ve kterém se nezávisle kódované prekurzorové transkripty cox3 spojují dohromady za vzniku zralého transkriptu. Trans -sestřih cox3 byl také popsán u jiných dinoflagelátů [52] .

V mitochondriálních transkriptech většiny dinoflagelátů dochází k intenzivní editaci RNA , která postihuje až 6 % nukleotidů [52] . Při editaci RNA jsou některé nukleotidy odpovídající nukleotidům DNA nahrazeny jinými. Mezi nejčastější změny zavedené editací RNA patří přechody C → U a U → C.  U dinoflagelátů se kromě těchto přechodů vyskytují také přechody A  → G a malý počet transverzí . Je zajímavé, že ačkoliv systémy pro úpravu RNA fungují u některých jiných eukaryot, chybí u nejbližších příbuzných dinoflagelátů, nálevníků a apikomplexů. To může naznačovat, že mechanismus úpravy RNA vznikl v počátečních fázích evoluce dinoflagelátů nezávisle na jiných skupinách organismů [36] .

Chloroplasty

Chloroplasty dinoflagelátů jsou diskoidní, ale mohou být deskovité, páskovité nebo jiné. V buňce mohou být umístěny blízko okraje buňky nebo se mohou radiálně rozcházet od středu buňky. Počet chloroplastů v buňce se pohybuje od jednoho do mnoha [53] .

Endosymbionti

Na rozdíl od jiných eukaryot probíhají u dinoflagelátů procesy získávání a ztráty chloroplastů během endosymbiózy poměrně snadno a jsou běžné. To pravděpodobně vysvětluje obrovskou rozmanitost chloroplastů v dinoflagelátech. Většina jejich odrůd se vyznačuje přítomností membrány se třemi membránami, která nezahrnuje endoplazmatické retikulum , tylakoidy jsou shromažďovány ve svazcích po třech. Mezi domnělými starověkými a nedávno získanými dinoflagelátovými endosymbionty byly nalezeny následující:

  • sinice : např. v Ornithocercus magnificus , Citharistes regius ;
  • červené řasy : ve všech dinoflagelátech obsahujících chloroplasty se třemi membránami a peridinin, jako jsou druhy rodu Ceratium ;
  • haptofytní řasy : například u Gymnodinium mikimotoi , G. breve a G. galatheanum ;
  • kryptofytní řasy : např. v Gymnodinium eucyaneum , G. acidotum ;
  • prasinofytické řasy : například Lepidodinium viride , Gymnodinium chlorophorum ;
  • rozsivky : např. v Peridimium balticum , P. foliaceum ;
  • domnělé silicoflagellates : například u Podolampas bipes [38] .

Některé dinoflageláty, jako Dinophysis spp. a Amphidinium poecilchroum dochází ke kleptoplastice : jejich buňky dočasně obsahují chloroplasty vypůjčené z fotosyntetické kořisti [33] . Druh Dinophysis acuminata se vyznačuje dvojitou kleptoplastikou: zástupci tohoto druhu si vypůjčují plastidy od nálevníků , které jedí Myrionecta rubra , a ti zase akumulují chloroplasty kryptofytů druhu Teleaulax amphioxeia [54] [ 55] že jedí .

Typy chloroplastů

V dinoflagelátech existuje pět hlavních typů chloroplastů, z nichž každý má svou vlastní evoluční historii a je charakterizován přítomností specifické sady pigmentů .

U dinoflagelátů obsahují nejběžnější chloroplasty pigment peridinin (chloroplasty obsahující peridin) . Tyto chloroplasty jsou obklopeny třemi membránami a jsou výsledkem sekundární endosymbiózy s červenými řasami. Peridinin je hlavním karotenoidním pigmentem dinoflagelátů, absorbuje světelnou energii v modrozelené oblasti spektra (470–550 nm) a je spolu s chlorofylem součástí světlosběrného proteinového komplexu. Chlorofyly a a c a peridinin slouží jako hlavní fotosyntetické pigmenty [56] . Kromě peridininu jsou v chloroplastech dinoflagelátů přítomny β-karoten , diadinoxanthin , dinoxanthin a další karotenoidy . V chloroplastech tohoto typu byla nalezena forma II Rubisco , která se kromě dinoflagelátů vyskytuje u některých bakterií (podrobněji viz ). Pyrenoidy jsou vzácné. Mohou mít různé tvary: jednoduché pyrenoidy umístěné uvnitř chloroplastu, složité vnitřní holé pyrenoidy, pyrenoidy vyčnívající z chloroplastů ve formě ledviny, stejně jako pyrenoidy sedící na jedné nebo více nohách. Funkce pyrenoidů v dinoflagelátových buňkách nejsou známy [53] .

Druhým typem chloroplastů u dinoflagelátů jsou chloroplasty obsahující fukoxanthin nalezené v Gymnodinium mikimotoi , G. breve a G. galatheanum . Tyto chloroplasty jsou také pokryty třemi membránami, ale vznikly v důsledku terciární endosymbiózy dinoflagelátu, který ztratil endosymbionta červené řasy, a haptofytové řasy. Obsahují hexanoylfukoxanthin a/nebo butanoylfukoxanthin, c 1 a c 2 chlorofyly , ale postrádají peridinin [57] .

Třetí typ chloroplastů pochází z endosymbiotických kryptofytních řas a je známý pro zástupce rodu Dinophysis . Původ těchto chloroplastů je potvrzen jak ultrastrukturálními znaky a složením pigmentu, tak sekvencí genu psbA a malé podjednotky rRNA. Na rozdíl od kryptofytů jsou plastidy dinoflagelátů pokryty spíše dvěma než čtyřmi membránami a postrádají nukleomorf . Je možné, že tyto chloroplasty nejsou trvalé, ale kleptoplasty [58] .

Čtvrtý typ plastidů se nachází v Peridimium balticum a P. foliaceum . Tyto plastidy vznikly z rozsivek terciární endosymbiózou. Od cytoplazmy dinoflagelátového hostitele jsou odděleny jedinou membránou, pod kterou se nachází jádro, mitochondrie, ribozomy a chloroplasty s chloroplastovým endoplazmatickým retikulem, lamelami tří tylakoidů a páskovou lamelou. Hlavními pigmenty těchto chloroplastů jsou chlorofyl c 1 a fukoxanthin. Dinoflagelátoví hostitelé navíc obsahují třímembránové deriváty vysoce redukovaných chloroplastů obsahujících peridinin. P. balticum a P. foliaceum zřejmě představují mezistupeň mezi absorpcí endosymbionta a jeho redukcí na malé jádro (nukleomorf) a plastidy [58] .

Plastidy pátého typu vznikly v důsledku sekundární endosymbiózy se zelenými prasinofickými řasami. Jsou přítomny alespoň ve dvou dinoflagelátech, Lepidodinium viride a Gymnodinium chlorophorum . Jsou pokryty dvěma membránami, obsahují chlorofyly a a b , prazinoxantin [58] .

Genom chloroplastů

Chloroplastový genom řas obsahujících peridinin je pozoruhodný tím, že není reprezentován jedinou kruhovou molekulou DNA, ale je rozdělen do 2–3 kilobázových minikruhů obsahujících jeden nebo více genů a nekódující jádrovou sekvenci, která zjevně obsahuje původ replikace . K replikaci i transkripci plastidových minikruhů dochází v mechanismu rotujícího prstence . Bylo navrženo, že celý minikruh je transkribován nepřetržitě v několika otáčkách, což vede k dlouhému transkriptu obsahujícímu několik kopií mRNA odpovídajících celému kruhu. Dále jej endonukleázy štěpí na dlouhé prekurzory mRNA , které se dále zpracovávají na zralé mRNA, včetně polyuridinylace na 3' konci. Dosud bylo popsáno pouze 16 genů kódovaných minikroužkem, což z nich dělá nejmenší známé plastidové genomy. Geny na minikroužcích kódují 12 základních podjednotek čtyř hlavních komplexů tylakoidní membrány ( fotosystémy I a II , komplex cytochromu b6 - f a ATP syntáza ), dva ribozomální proteiny a dva dosud necharakterizované proteiny. Zbývající geny potřebné pro fotosyntézu byly přeneseny do jaderného genomu. Zůstává nejasné, proč plastidový genom dinoflagelátů prošel tak významnou redukcí, zdá se však, že to byla raná událost v evoluční historii dinoflagelátů [33] .

Je známo, že geny obsažené v genomech organel podléhají intenzivnější mutagenezi v důsledku blízkosti reaktivních forem kyslíku . Navíc kvůli chybějící rekombinaci akumulují mutace mnohem rychleji než jaderné genomy. Mezi geny přenesené do jádra z plastidů v dinoflagelátech patří 15 genů, které jsou v jakémkoli jiném fotosyntetickém eukaryotickém organismu kódovány chloroplastovým genomem. Jak lze vysvětlit skutečnost, že 16 genů přesto zůstalo v plastidovém genomu? Podle jedné hypotézy jsou geny kódující klíčové prvky fotosyntetického aparátu pod vlivem selekce, která je udržuje v chloroplastech, takže tyto geny mohou rychle regulovat množství svých produktů v reakci na změny redoxních podmínek organely. Pokud by tyto geny byly obsaženy v jádře, pak by organismy s několika plastidy nebyly schopny rychle dodat potřebný protein do organely v nouzi. Z tohoto důvodu může sada genů v genomu chloroplastů obsahujících peridinin představovat velmi minimální sadu genů, které musí zůstat v chloroplastu, aby byla zachována správná redoxní rovnováha [33] .

Proteiny kódované plastidovými geny, které migrovaly do jádra, se vyznačují přítomností tříčlenné signální sekvence na N-konci , která směřuje tyto proteiny do chloroplastů, a hydrofobní oblasti, která usnadňuje vstup těchto proteinů do transportních vezikul. Tyto transportní váčky se pak spojí s vnější membránou chloroplastu. Takový proteinový motiv, nezbytný pro vstup proteinu do chloroplastu, získala nezávisle na dinoflagelátech Euglena , která má také třímembránové chloroplasty, které však pocházejí ze zelených , nikoli červených řas. V tomto případě tedy probíhá konvergentní evoluce. Dalším překvapivým rysem plastidů obsahujících peridin je, že obvyklá I forma Rubisco je nahrazena formou II, která je kódována jádrem. Druhá forma Rubisco má mnohem nižší afinitu k CO 2 než první forma enzymu a obvykle se nachází v proteobakteriích rostoucích v podmínkách vysokých hladin CO 2 a nízkých hladin O 2 . Je možné, že dinoflageláty mají nové mechanismy koncentrace CO2 , které kompenzují nízkou afinitu enzymu k CO2 . Zajímavé je, že Rubisco II byl nedávno nalezen u dvou dalších alveolátů, Chromera velia a příbuzného druhu, který ještě nedostal oficiální jméno a je známý jako CCMP3115. Tato data naznačují, že forma II Rubisco se objevila u společného předka dinoflagelátů a apikomplexů [33] .

Jiné typy plastidů, které se objevily v důsledku endosymbióz s nečervenými řasami, byly získány později než plastidy obsahující peridinin a jejich genomy mají formu společnou plastidovým genomům (jedna kruhová molekula DNA) [33] .

Evoluce chloroplastů

Předpokládá se, že výchozím typem plastidů pro dinoflageláty byly plastidy obsahující peridinin, které vznikly v důsledku sekundární endosymbiózy s červenými řasami. U druhů na bázi evolučního stromu dinoflagelátů ( Perkinsus a Oxyrrhis ) však nebyly nalezeny žádné plastidy . Kromě toho byla nedávno objevena nová skupina pravděpodobně heterotrofních alveolátů v hlubinách oceánů zbavených světla, které se podle fylogenetické analýzy nacházejí v blízkosti základny stromu dinoflagelátu [36] . Dinoflageláty schopné fotosyntézy netvoří monofyletickou skupinu. Nedávné fylogenetické studie ukázaly, že u některých taxonů dinoflagelátů, zejména těch, jejichž chloroplasty neobsahují peridinin, je historie vztahu s endosymbionty poměrně složitá: získání červené řasy, její ztráta a nové získání některých dalších řas , což ukazuje na možnost opakované endosymbiózy. Dinoflageláty si navíc dodnes zachovávají schopnost získávat endosymbionty. To může potvrdit dinoflagelát Noctiluca scintillans , který je sám o sobě heterotrofní, ale uvnitř vakuol jedinců tohoto druhu se někdy nacházejí volně plovoucí prasinofické řasy [38] .

Zůstává nejasné, co může nepřítomnost plastidů u druhů na základně stromu dinoflagelátů naznačovat: že dinoflageláty zdědily starověký stav bez plastidů nebo že jejich předkové formy plastidy ztratily a následně je znovu získaly. Pokud je druhý předpoklad správný, pak se plastidy obsahující peridinin objevily jako výsledek terciární, a nikoli sekundární endosymbiózy [36] .

Neméně zajímavý je vývoj chloroplastů obsahujících peridinin. Fylogenetická analýza 23S rRNA a genu psbA ukázala, že chloroplasty tohoto typu jsou monofyletické a pravděpodobně vznikly z červených řas v důsledku sekundární endosymbiózy, jako tomu bylo u ochrofytů a apikomplexů. Analýza genů psaA , psbA a rbcL u různých červených, ochrofytních , haptofytních řas a dinoflagelátů však prokázala, že dinoflageláty obsahující peridinin a dinoflageláty obsahující fukoxanthin tvoří monofyletickou skupinovou sestru k haptofytům. Na základě těchto výsledků byla předložena alternativní hypotéza o původu plastidů obsahujících peridinin, podle níž plastidy obsahující peridinin i fukoxantin pocházejí ze společného předka, kterým byla řasa haptofyt, takže plastidy obsahující peridinin chloroplasty dinoflagelátů jsou výsledkem terciární endosymbiózy [53] .

Fototaxe

Všechny studované dinoflageláty vykazují fototaxi jako odpověď na stejnou část spektra a pro vlnovou délku 450 nm je stupeň projevu fototaxe maximální. Stigma (oko) není pro fototaxi vyžadováno a buňky bez stigmatu mohou také reagovat na světlo [59] . Receptory reagující na světlo rozhodně nejsou ve stigmatu a jsou pravděpodobně spojeny s plazmatickou membránou [60] .

Méně než 5 % dinoflagelátů má stigma, z nichž většina jsou sladkovodní formy. Stigma nejjednodušší struktury, představované skupinou lipidových globulí lokalizovaných v cytoplazmě a neobklopených žádnou membránou, je přítomna např. u Woloszynskia coronata . Stigma druhého typu je reprezentováno množstvím lipidových globulí lokalizovaných v chloroplastech lokalizovaných na periferii buňky (například Peridinium westii , W. tenuissima ). Třetí typ stigmatu je charakteristický pro Glenodinium foliaceum . U tohoto dinoflagelátu dosahuje stigma 6 µm na délku a 3 µm na šířku. Je víceméně obdélníkového tvaru, zploštělý a vzhledem připomíná tašku. Uvnitř jsou dvě řady lipidových globulí oddělených zrnitým prostorem. Stigma je obklopena trojitou membránou, identickou s tou, která obklopuje chloroplasty. Ke stigmatu přiléhá lamelární těleso bez membrány sestávající ze zploštělých váčků uspořádaných víceméně paralelně k sobě. Lamelové těleso dosahuje délky asi 2 µm a šířky 0,75 µm a obsahuje až 50 vezikul. Vezikuly jsou navzájem spojeny na koncích a na okraji stohu - hrubým endoplazmatickým retikulem . Předpokládá se, že tento typ stigmatu je vysoce redukovaný chloroplast obsahující peridinin [61] .

Nejsložitější stigmata, připomínající oči mnohobuněčných organismů [62] , jsou charakteristická pro členy čeledi Warnowiaceae z řádu Peridiniales . Stigmata tohoto druhu se nazývají ocelloidi [63] . Oceloidy mají struktury podobné rohovce , čočce a sítnici zvířat . Zároveň je „rohovka“ soubor mitochondrií spojených do jednoho systému, „čočka“ ( čočka ) se skládá z membrán endoplazmatického retikula a „retina“ (retinoid) se ukázal jako modifikovaný chloroplast (druhy čeledi Warnowiaceae již dávno ztratily schopnost fotosyntézy) [64] . Je zajímavé, že nedávné studie zjistily expresi bakteriálního rodopsinu v sítnici , což potvrzuje zapojení těchto stigmat do určování směru světla [65] . Struktura blizen Nematodinium armatum a Erythropsis cornuta byla dobře prostudována a ukázalo se, že jejich struktura je v zásadě podobná. U N. armatum je stigma umístěno v horní části spodní části buňky vedle pletence a skládá se z čočky a za ní umístěného pigmentového pohárku [66] .

Osa procházející středy čočky a pigmentovým pohárkem je téměř kolmá k podélné ose buňky. Čočka leží bezprostředně pod plazmalemou. Pigmentové sklo se skládá ze tří hlavních částí. Většina jeho stěny se skládá z jediné vrstvy velkých podlouhlých pigmentových granulí o průměru 0,3 µm. Při přiblížení k okraji skla se granule pigmentu zmenšují a jsou volněji uspořádány a tvoří několik vrstev. Na základně poháru leží hustá vrstva fibril o průměru 33 nm, rovnoběžná s osou stigmatu. Tato vrstva pokrývá vrstvu příčných fibril, nazývaných retinoidy , protože je zodpovědná za vnímání světla. Nad retinoidem je kanál, který ústí do žlábku příčného bičíku. Buněčná membrána pokračuje do kanálkové membrány [66] .

Čočka je složitá struktura sestávající ze sítě mitochondrií. Uvnitř mitochondrií je zrnitá vrstva oddělená od čočky membránou. Centrální část čočky je představována membránou vázanou kopulí nebo soustřednými vrstvami hustého materiálu. Většina čočky obklopuje toto jádro a skládá se z několika velkých, téměř prázdných laloků. Mezi kůrou a laloky je síť středně velkých vezikul [66] . Světlo vstupuje do čočky, je fixováno a směrováno koncentrovaným paprskem do pigmentových globulí, procházejících retinoidem [59] . Nedávné studie ukázaly, že působením světla se membránové vezikuly stigmatu prodlužují a zplošťují [65] . Čočka je schopna měnit tvar a pigmentový kalíšek se zase může vzhledem k čočce pohybovat [63] .

Jídlo

Podle typu výživy mohou být dinoflageláty autotrofní, mixotrofní a heterotrofní. Zdá se, že mezi dinoflageláty prakticky neexistuje autotrofie v užším slova smyslu, ale mixotrofie je extrémně rozšířená. Je známo pouze méně než 10 čistě autotrofních druhů, které nepotřebují hotové organické sloučeniny. Většina dinoflagelátů schopných fotosyntézy je auxotrofní pro vitamíny B (B 1 ( thiamin ) , B 12 ( kyanokobalamin ) a H ( biotin )) a jsou nuceny je přijímat zvenčí v hotové formě. Kromě toho jsou známy fotosyntetické dinoflageláty schopné fagotrofie [67] .

Přibližně polovina známých druhů dinoflagelátů jsou obligátní heterotrofové, postrádají plastidy a absorbují potravu osmotrofními nebo fagotrofními prostředky. Fagotrofie je rozšířenější u dinoflagelátů. Fagotrofní organismy absorbují pevné částice potravy a tráví je v trávicích vakuolách. Živí se jinými řasami , včetně jiných dinoflagelátů, nematodů , larev mnohoštětinatců a rybích vajíček . K zachycení částic potravy používají různé speciální organely, včetně stopek (stopek), chapadel (chapadla), pístů (čepic) a závojů (pallium).

  • Stonky  jsou malé pohyblivé prstovité výrůstky, které se nacházejí v rýze na bázi bičíku. Pravděpodobně plní smyslové funkce a zajišťují připojení k substrátu.
  • Chapadla  jsou protáhlejší struktury, které slouží k zachycení potravy a jejímu nasměrování do ústí buňky ( cystomu ). Chapadla byla popsána v Nocticula , Pronocticula , Pavillardia a dalších.
  • Píst je dutý válcový výrůstek, který přitahuje potravu do cytostomu. Může se rychle prodlužovat a jeho délka může být 15krát delší než délka těla, roztahovat se a pak rychle zužovat a stahovat. Píst udělá díru do obětní buňky a vysaje z ní cytoplazmu. Takový píst je charakteristický pro Gymnodinium fungiforme , zoospory Pfiesteria piscicida , stejně jako fotosyntetické dinoflageláty Amphidinium cryophilum .
  • Závoj  je pseudopodiální membrána, která vystupuje z drážky blízko základny bičíku a vypadá jako záchytná síť větší než buňka. Oddělené velké buňky a koloniální a rozsivky ulpívají na této síti, pak jsou obaleny a jejich obsah je absorbován. Tento akt extracelulárního trávení trvá 20-30 minut. Závoj byl popsán u některých druhů rodů Protoperidinium , Oblea a Diplopsalis . Ti první se živí převážně rozsiveky a dinoflageláty, zatímco všichni ostatní mohou chytat nejen rozsivky, ale také haptofyty, prasinofyty a kryptofyty [68] .

Dinoflagelátové buňky mohou obsahovat velké vezikuly obsahující zbytky natrávených organel (akumulačních tělísek). Pravděpodobně odpovídá vezikulům se stejnými funkcemi, jaké se nacházejí u kryptofytů a jiných bičíkovců . Akumulační těleso je charakteristické zejména pro symbiotické dinoflageláty [69] .

Osmoregulace

Kontraktilní vakuoly byly nalezeny pouze u několika sladkovodních dinoflagelátů. Jedna nebo dvě kontraktilní vakuoly se nacházejí u zástupců čeledi Protaspidaceae a také v některých fázích životního cyklu u zástupců řádu Phytodiniales, u kterých kontraktilní vakuoly mizí při přechodu do jiné fáze životního cyklu [70] .

Zbývající dinoflageláty nemají pulzující kontraktilní vakuoly a místo nich plní osmoregulační funkce puzuly  , jedinečné organely vlastní pouze dinoflagelům. Jsou to invaginace cytoplazmatické membrány ve formě vaku nebo trubice vyčnívající do dutiny buňky. U mořských zástupců z tohoto vaku vystupuje systém kanálků a výčnělků ve tvaru prstů - vezikuly. Takové složité pustuly jsou viditelné pod světelným mikroskopem. U sladkovodních forem se pustuly nacházejí pouze pomocí elektronového mikroskopu . Mají jednodušší strukturu a představují jednu velkou nebo několik malých vakuol. Puzuly nejsou schopny kontrakcí, na rozdíl od kontraktilních vakuol se však otevírají póry do bičíkových kanálků, odkud jejich obsah vytéká bez určité periodicity. Obvykle jsou v buňce dvě pustuly, z nichž každá je spojena s jedním bičíkovým kanálem [27] [71] .

Bodavé struktury

Dinoflageláty mají tři typy bodavých struktur (extrusomů): trichocysty , nematocysty a mukocysty. Trichocysty jsou umístěny kolmo k povrchu buňky podél jejího obvodu. Trichocysta se skládá z těla a krku a je obklopena jedinou membránou [70] . Uvnitř trichocyst jsou krystalické proteinové fibrily dlouhé několik mikrometrů (jádra), které jsou stočeny do spirály. Ve vnitřní části trichocysty je třetina kůry představována krátkými tubulárními elementy, mírně vyčnívajícími dopředu. Na samém vrcholu trichocysty vystupuje z kůry směrem k uzavírací membráně skupina 20-22 fibril a tenčí fibrily je dále spojují s apikální částí membrány trichocysty.

Uvnitř uzavírací membrány trichocysty je tenký neprůhledný prstenec. Vnější část trichocystové membrány je připojena k plazmatické membráně mezi tekálními váčky nebo k tekálním váčkům umístěným pod zaoblenými tenkými oblastmi tekálních destiček, které tvoří speciální póry pro trichocysty [72] .

Trichocysty se tvoří v Golgiho aparátu a pravděpodobně jej opouštějí jako kulovité váčky, které pak získávají vřetenovitý tvar a vyvíjejí se v trichocysty. Při vzrušení se „nabitá“ trichocysta během pár milisekund promění v „nenabitou“  – možná díky rychlému přílivu vody. "Nenabité" trichocysty jsou rovné tyčinky kuželovitého tvaru, mnohonásobně delší než "nabité" trichocysty (až 200 µm v Prorocentru ). Trichocysty jsou přítomny ve většině dinoflagelátů, existují však výjimky ( Gymnodinium prohibitum , Aureodinium pigmentosum , Woloszynskia tylota , Symbiodinium microadriaticum ). Konkrétní přínos (pokud existuje) trichocyst není jasný. Mohou sloužit k rychlému odražení klece v opačném směru, než je vyhazování nitě, nebo k přímému poražení nepřítele [72] .

Nematocysty byly nalezeny u několika dinoflagelátů (u rodů Nematodinium , Warnowia , Proterythropsis a některých zástupců rodu Polykrikos , u posledně jmenovaných se nematocysty výrazně liší svou morfologií [73] [74] ). Jsou větší než trichocysty, dosahují délky 20 mikronů; někdy jsou srovnávány s cnidocyty v cnidocytech . Mukocysty  jsou jednoduché váčky, které vylučují hlen na buněčný povrch; jsou blízké podobným strukturám euglenoidů . Takové váčky byly nalezeny u některých dinoflagelátů v oblasti břišního pole (lamely podélné rýhy) pod buněčnou membránou [70] [75] .

Odpočinkové formuláře

Za podmínek, které neumožňují další nárůst populace (jako je nízká dostupnost živin ), mohou dinoflageláty tvořit nepohyblivé klidové spory nebo cysty . Dinoflagelátové cysty ( dinocysty ) u většiny druhů jsou morfologicky odlišné od vegetativních buněk. Dosahují průměru 30-70 mikronů, mají hladký nebo drsný povrch. Nově vzniklé cysty druhu Scrippsiella trochoidea obsahují 10x více sacharidů než vegetativní buňky; přičemž rychlost oxidačních procesů v nich je 1,5 % vegetativního stadia. Buněčné stěny cyst jsou vysoce odolné a obsahují dinosporin , který je chemicky blízký sporopolleninu, který obaluje pyl vyšších rostlin [76] .

Proces encystace neboli tvorby klidových spór je regulován komplexní interakcí vnějších faktorů, včetně délky dne, teploty a koncentrace živin. Během encystace se obsah melatoninu několikanásobně zvýší, což může zabránit oxidaci cystických lipidů . U sladkovodních dinoflagelátů Woloszynskia tylota zahrnuje encystace následující kroky:

  1. Theca je nahrazena tenkou, amorfní vnější stěnou, která je značně zesílena přidáním nového materiálu z její vnitřní strany.
  2. Na hranici cytoplazmy vznikající cysty se vytvoří vrstva těsně umístěných lipidových kapének.
  3. Cytoplazmatické struktury, jako jsou chloroplasty, Golgiho aparát a puzuli, se zmenšují nebo mizí.
  4. Zvětšení oranžovohnědého tělíska umístěného ve středu buňky a cytoplazmatických vakuol obsahujících krystaly [77] .

Po svém vzniku se cysta přesune na dno jezera nebo oceánu, kde zůstává životaschopná po mnoho let. Oceánské proudy mohou tyto bentické cysty přenést na jiná místa. Za příznivých podmínek mohou cysty vyklíčit, čímž vzniknou živé plovoucí buňky. Tvorba cyst, jejich pohyb a klíčení vysvětlují mnoho aspektů ekologie a geografie jedovatého vodního květu způsobeného dinoflageláty. To vysvětluje skutečnost, že vodní květy se nemusí nutně vyskytovat na stejném místě každý rok, stejně jako skutečnost, že vodní květy jsou spojeny s nadbytkem živin v oceánu, způsobeným například vnikáním odpadních vod nebo odtokem vody z oceánu. zemědělské podniky. Navíc se kvůli cystám mohou místa vodního květu každý rok navzájem měnit [78] .

Cysty lze identifikovat podle absence chloroplastů, přítomnosti mikrogranulární hnědé cytoplazmy a červeného oka (pokud má vegetativní stadium oko). U některých druhů dochází ke kalcifikaci ukládáním krystalů uhličitanu vápenatého do úzké mezery mezi buněčnou stěnou a plazmatickou membránou. Cysty Ceratium hirundinella mají vnější vrstvu křemíku [77] .

Životní cyklus a reprodukce

Dinoflageláty se mohou rozmnožovat vegetativně , nepohlavně a pohlavně . Buňka se při vegetativním množení dělí na dvě v podélném nebo šikmém směru, přičemž obal původní buňky se na tvorbě obalů dceřiných buněk podílí různým způsobem. Takže u bezskořepinových dinoflagelátů jsou rozděleny na polovinu zúžením a každá dceřiná buňka zdědí skořápku od matky. V Ceratium dochází k dělení tak, že skořápka je rozdělena na dvě nestejné části šikmou rýhou a každá dceřiná buňka obdrží od matky pouze polovinu skořápky a chybějící polovinu sama doplní. V Peridiniu se mateřská buňka zbaví theca (tento proces se nazývá ekdysis ), po rozdělení se kolem dceřiných buněk vytvoří ztluštělá pelikula a buňka se změní v ekdyzální cystu . Když se buňka vynoří ze stavu cysty, vytvoří se pod její pelikulou nové thékální váčky. U Gambierdiscus toxicus je ekdysis vyvolána speciální glycerolovou sloučeninou produkovanou zelenou řasou Bryopsis . Tento druh dinoflagelátů žije v těsné blízkosti stélky zelených řas [79] . V některých případech se dceřiné buňky v důsledku dělení nerozcházejí a pak se tvoří řetězové kolonie. V závislosti na druhu a podmínkách prostředí může vegetativní rozmnožování probíhat každých 1–15 dní [80] .

Při nepohlavním rozmnožování tvoří dinoflageláty zoospory a aplanospory [80] .

S nedostatkem dusíku a změnou teploty vody se některé druhy dinoflagelátů [78] začnou pohlavně rozmnožovat . U dinoflagelátů byly popsány tři typy sexuálních procesů: izogamie , anizogamie a chologamie . Gamety jsou menší než vegetativní buňky, u obrněných druhů mohou být nahé. Nejčastěji se při splynutí gamet vytvoří diploidní planozygot, který může existovat poměrně dlouho. Je obvykle větší než haploidní vegetativní buňky, zadržuje 2 zadní bičíky a vyznačuje se silnou, chemicky inertní, nepravidelnou buněčnou stěnou . Nejprve následuje období dlouhodobého růstu planozygota a poté se může změnit buď v klidovou buňku (hypnozygota), jejíž klidové období trvá několik hodin až několik měsíců, nebo podstoupit meiózu a dát vznik 4 haploidům vegetativní buňky v mobilním stavu. U druhů, jejichž chloroplasty vznikly z rozsivek a haptofytů, je fúze jader gamet následována fúzí endosymbiontů a jejich jader [81] [82] .

V naprosté většině dinoflagelátů se studovanými životními cykly jsou haplobionti : diploidní stadium je omezeno na zygotu . Výjimkou je Noctiluca , jejíž životní cyklus je diplobiontní. Jádro diploidní vegetativní buňky se dělí meiózou a poté mitózou, čímž vzniká více než 2000 identických gamet. Při splynutí gamet vzniká zygota, která se po dormantním období promění ve vegetativní buňku [83] [84] . Stejně jako v případě některých červených řas , některé dinoflageláty pěstované v laboratorní kultuře ukázaly, že morfologicky odlišní protistové mohou být různými životními stádii stejného druhu [78] .

Meióza dinoflagelátů je velmi špatně pochopena. Za jeho rozlišovací znaky lze považovat slabou spirálovitost a zkrácení chromozomů, které dosahují maxima během zygotenového období (profáze I. stádium dělení meiózy) [82] .

Extrémně neobvyklý a složitý životní cyklus je charakteristický pro dinoflageláty Pfiesteria piscicida . Při absenci ryb u dna je Pfeisteria reprezentována bentickými cystami . Přítomnost ryb způsobuje, že cysty vyraší do plovoucí formy, která uvolňuje toxickou látku. Tato látka způsobí ochrnutí dýchacího ústrojí ryb a ryba během pár minut zemře udušením a klesne ke dnu. Když se mrtvé ryby začnou rozkládat, dinoflageláty začnou ryby jíst přes stonky. Když je ryba úplně sežrána, bičíkové buňky se promění zpět ve spící, nenápadné bentické cysty, jejichž transformace někdy trvá pouhé dvě hodiny [85] [86] .

Biochemie

Vlastnosti metabolismu

Sladkovodní dinoflageláty uchovávají hlavně škrob , který se ukládá v cytoplazmě, zatímco mořské formy uchovávají hlavně lipidy . Kromě toho mohou dinoflageláty uchovávat steroly , zejména 4α-methylsteroly, což je odlišuje od všech ostatních skupin řas [87] . Některé mořské dinoflageláty a organismy, ve kterých žijí dinoflageláty jako endosymbionti, akumulují specifický sterol , dinosterol [58] .

Pro životně důležitou aktivitu většiny volně žijících dinoflagelátů, na rozdíl od jejich nejbližších příbuzných - apikomplexů, vedoucích parazitický životní styl, je nutná účinná syntéza ATP kvůli úplné oxidaci sacharidů . O důležitosti této dráhy svědčí přítomnost škrobových granulí v cytoplazmě mnoha dinoflagelátů. Avšak komplex pyruvátdehydrogenázy , který zajišťuje konverzi pyruvátu na acetyl-CoA ve většině ostatních eukaryot, v dinoflagelátech (stejně jako v apikomplexech) chybí. Ačkoli se na udržování mitochondriálního acetyl-CoA poolu mohou podílet i alternativní, neglykolytické cesty (zejména rozklad aminokyselin s rozvětveným řetězcem , například prostřednictvím 2-methylcitrátového cyklu), zdá se nepravděpodobné, že by pyruvát zůstal konečný produkt oxidace sacharidů v dinoflagelátech. Pravděpodobně mají dinoflageláty jiné cesty a enzymy pro další oxidaci pyruvátu. Tento předpoklad potvrzují výsledky studií využívajících radioaktivně značený 13C3 - pyruvát: do cyklu trikarboxylových kyselin vstoupil i značený 13C2 - acetyl-CoA , zřejmě získaný z 13C3 - pyruvátu . Dinoflageláty mají geny kódující všechny enzymy pro β-oxidaci mastných kyselin , včetně karnitin-acylkarnitin translokázy . Tato metabolická dráha je dalším zdrojem acetyl-CoA v mitochondriích a její význam v metabolismu dinoflagelátů je potvrzen přítomností lipidových zásob u mnoha druhů [88] .

Genom dinoflagelátů obsahuje všechny geny kódující enzymy cyklu trikarboxylových kyselin (TCA). CTC hraje klíčovou roli v metabolismu dinoflagelátů, stejně jako všech volně žijících aerobních organismů. Většina eukaryot má dvě formy isocitrátdehydrogenázy (enzym TCA, který katalyzuje oxidaci isocitrátu na α-ketoglutarát ): NAD (H)-dependentní a NADP (H)-dependentní. Dinoflageláty však ztratily NAD(H) dependentní formu isocitrátdehydrogenázy, stejně jako apikomplexy, ačkoli tento protein je extrémně konzervovaný jak mezi eukaryoty, tak prokaryoty . Dalším zajímavým rozdílem mezi CTC dinoflagelátů a CTC jiných eukaryot je to, že mají dvě formy fumarázy : jednu se shlukem železa a síry a jednu bez něj. Obvykle se mezi zástupci jednoho taxonu vyskytuje pouze jedna forma tohoto enzymu. Ačkoli dinoflageláty mají obvyklou mitochondriální NAD-dependentní malátdehydrogenázu , která oxiduje malát na oxaloacetát , mají také malát chinonoxidoreduktázu, membránově vázaný enzym, který může také oxidovat malát na oxaloacetát, ale s FAD spíše než redukcí NAD + . Tento enzym je přítomen v některých bakteriích a apikomplexech, které ztratily mitochondriální formu malátdehydrogenázy, a zřejmě jej získal společný předek dinoflagelátů a apikomplexů ještě před jejich separací. Přes všechny tyto rozdíly se však obecné schéma CTC reakcí jak u dinoflagelátů, tak u apikomplexů nevymyká standardnímu schématu [88] .

Došlo také k určitým změnám v řetězci transportu elektronů dinoflagelátů. Jak dinoflageláty, tak apikomplexy ztratily komplex I (NADH dehydrogenáza) dýchacího řetězce, který je charakteristický pro většinu eukaryot. Místo toho mají dinoflageláty speciální protein, který má signál mitochondriální lokalizace a funguje v mitochondriální matrix, kde jeho substrátem místo NADH je NADPH získaný během CTC. Typická NADH dehydrogenáza byla zjevně ztracena volně žijícím předkem dinoflagelátů a apikomplexů. Důvody pro to nejsou jasné, ale je možné, že ztráta NAD(H)-dependentní isocitrátdehydrogenázy přispěla k rozšíření alternativní NADPH dehydrogenázy . Kromě ní obsahují mitochondrie dinoflagelátů další proteiny, které zajišťují vstup elektronů do ETC. Mají tedy fungující dihydroorotátdehydrogenázu  - enzym pro syntézu pyrimidinů který v mezimembránovém prostoru mitochondrií oxiduje dihydroorotát na orotát a koenzym Q přijímá elektrony . Další cesta je zajištěna malát-chinon oxidoreduktázou a TCA, které přispívají ke zvýšení redukovaného poolu koenzymu Q. Zajímavé je, že dinoflageláty postrádají glycerol-3-fosfátový raketoplán nacházející se v apikomplexech a ciliáty en[ redukuje koenzym Q. Dinoflageláty však mají cytochrom b 2 ( L-laktát : cytochrom c oxidoreduktáza ), který se nachází v mezimembránovém prostoru a oxiduje cytosolický L-laktát na pyruvát, přenášející elektrony na cytochrom c. U dinoflagelátů byly také nalezeny ETC uncoupling proteiny , tj. proteiny, které zajišťují únik protonů z mezimembránového prostoru do matrix bez syntézy ATP . Tento proces je aktivován volnými mastnými kyselinami, a přestože snižuje rychlost syntézy ATP, minimalizuje množství reaktivních forem kyslíku vytvořených během provozu ETC [88] .

Dinoflageláty mají proteiny , které zajišťují transport dikarboxylových a trikarboxylových kyselin přes vnitřní mitochondriální membránu . Tyto metabolity se používají při syntéze aminokyselin, metabolismu mastných kyselin glukoneogenezi , biosyntéze izoprenoidů a TCA. Mezi těmito dinoflagelátovými proteiny je α-ketoglutarát-malátový transportér, který vyměňuje mitochondriální α-ketoglutarát za cytosolové dikarboxylové kyseliny, zejména malát. Tento přenašeč je spojen s malát-aspartátovým raketoplánem , který umožňuje účinný přenos redukujících ekvivalentů ve formě NADH do mitochondrií z cytosolu. Tento raketoplán také vyžaduje aspartát , glutamátový nosič, který, i když je přítomen v dinoflagelátech, chybí v apikomplexech. Dinoflageláty, nikoli však apikomplexy a nálevníky, mají také oxodikarboxylátový transportér, který mezi sebou vyměňuje oxodikarboxyláty oxoadipátu a α-ketoglutarátu. Tento transportér je nezbytný pro syntézu lysinu a glutamátu v cytoplazmě z mitochondriálního 2-oxoadipátu, který je zase tvořen z α-ketoglutarátu a acetyl-CoA. Výměna může probíhat i opačným směrem, kdy je do matrix transportován oxoadipát, vzniklý při katabolismu cytosolového lysinu. Zde je oxoadipát dekarboxylován a dále používán jako zdroj acetyl-CoA. Mitochondrie dinoflagelátů obsahují i ​​další výměníky dikarboxylátů a trikarboxylátů, které v apikomplexech chybí [88] .

Stejně jako všechny alveoláty mají i dinoflageláty všechny proteiny nezbytné pro syntézu železo-sírových klastrů v mitochondriích. Syntéza tetrapyrrolů v dinoflagelátech, stejně jako v mnoha fotosyntetických organismech, probíhá v plastidech, nikoli v mitochondriích [88] .

Proces fotorespirace je poněkud odlišný od obvyklého u dinoflagelátů : vyšší rostliny , characeae , červené a glaukocystofytní řasy využívají k oxidaci glykolátu enzym glykolátoxidázu , která za účasti molekulárního kyslíku oxiduje glykolát na glyoxylát za vzniku vodíku. peroxid, který je zničen katalázou . U dinoflagelátů, stejně jako u některých dalších skupin řas, tento enzym chybí a oxidaci glykolátu provádí jiný enzym, glykolátdehydrogenáza [89] [90] .

Bioluminiscence

Planktonické formy dinoflagelátů, které se nacházejí ve všech světových oceánech , mají schopnost luminiscovat (často chybně nazývané fosforescence ), což lze často vidět v rozbouřené vodě oceánu v noci v létě. Luminiscenční dinoflageláty obývají především povrchové vody [91] . Mezi fotosyntetickými protisty jsou dinoflageláty jedinou skupinou schopnou bioluminiscence ; Celkem bylo zaznamenáno asi 85 fotosyntetických a heterotrofních druhů mořských dinoflagelátů s touto schopností (sladkovodní druhy ji nemají). Excitované buňky emitují záblesky modrozelené barvy (s maximální emisí na vlnové délce 475 nm) s dobou trvání obvykle od 0,05 do 5 s [92] .

Luminiscence vody, vyvstávající z pohybu lodi, a záře tropických zálivů jsou způsobeny hlavně druhy třídy Dinophyceae ; v mírných zeměpisných šířkách je záře moře obvykle způsobena nočním světlem . Jakoby planoucí mořská voda z dávných dob přitahovala pozornost mořeplavců a této záři vody byl dlouhou dobu připisován nadpřirozený původ, dokud nebyla v roce 1830 experimentálně prokázána biologická podstata této záře [87] . Německý přírodovědec Kurt Tesing popsal obrázek záře moře, který pozoroval v Neapolském zálivu , následovně : „Poblíž, pak daleko, se blýskalo, blýskalo a okamžitě mizelo světlo, namodralé jiskry. Lesk moře byl silnější a silnější, každá vlna se rozpadla v ohnivý déšť, jak padala... Zdálo se, že plujeme podél zářivého proudu; všechny věci ponořené do vody se zdály být naplněny tekutým stříbrem. Když jsme stáli pozdě v noci na molu, celý přístav a celé moře, kam až oko dohlédlo, jako by byly zality měkkým ohněm. Byl to nepopsatelný pohled a jen ten, kdo ho viděl v celé jeho kráse, může pochopit, jak nesmazatelný dojem na každého člověka zanechá .

Bioluminiscence zahrnuje přeměnu energie uvolněné během exergonické chemické reakce na světelnou energii . Látkou zodpovědnou za bioluminiscenci je luciferin , který se působením enzymu luciferázy oxiduje kyslíkem a uvolňuje energii ve formě záblesku světla. Luciferin a luciferáza jsou běžné názvy pro sloučeniny spojené s luminiscencí a nesdílejí společnou chemickou strukturu pro všechny luminiscenční organismy. Takže v bakteriích je luciferin redukovaný flavin a v dinoflagelátech je to tetrapyrrol. Luciferázy mají také různé struktury v různých skupinách organismů, ačkoli všechny jsou oxidoreduktázy. Podle obecné rovnice bioluminiscence se působením luciferázy luciferin oxiduje kyslíkem za vzniku excitovaného produktu, který při přechodu do neexcitovaného stavu emituje foton [94] .

Dinoflagelát luciferin je lineární tetrapyrrol. Při alkalickém pH se váže na protein vázající luciferin ( LBP  ) , který uvolňuje luciferin za kyselých podmínek. Byla vyslovena hypotéza, že záblesk světla nastává jednoduše snížením pH z 8,0 na 6,5. V excitovaných buňkách dochází k depolarizaci vakuolární membrány , díky čemuž protony (H + ) vstupují do cytoplazmy a okyselují její periferní oblasti. Snížení pH spouští dvě reakce závislé na pH: (1) LBP uvolňuje luciferin a (2) luciferin je aktivován a emituje foton modrozeleného světla [95] .

Luciferin, LBP a luciferáza jsou sestaveny do speciálních částic o průměru 0,5-1,5 mikronu - scintillonů (blikající jednotky). Záblesky světla se vyskytují v cytoplazmatických invaginacích vakuolární membrány. Záblesky modrozeleného světla nastávají, když akční potenciál prochází membránou vakuoly, což způsobí, že protony opustí kyselé prostředí vakuoly a vstoupí do cytoplazmy. Výsledný pokles pH ve scintilonech způsobí záblesk světla [95] .

Lingulodinium polyedrum luminiscuje hlavně během noční fázecirkadiánního rytmu. To je způsobeno více než desetinásobným zvýšením množství luciferázy a LBP během noční fáze. Fotoinhibice bioluminiscence během dne se zdá být nezbytná pro to, aby buňka šetřila energii v době, kdy je hladina světla kolem tak vysoká, že bioluminiscence je neúčinná. U Pyrocystis fusiformis může bioluminiscence probíhat po celý den. Ve dne kulovitá tělesa v hustě zabalených váčcích shromážděných kolem jádra vyzařují luminiscenci a v noci periferní vrstvy cytoplazmy bioluminiscují. Je zajímavé, že chloroplasty se pohybují opačným směrem a jsou seskupeny kolem jádra v noci a ve dne jsou umístěny na periferii buňky [95] .

Dinoflageláty mohou vyzařovat světlo třemi způsoby:

  • s mechanickou, chemickou, elektrickou stimulací;
  • spontánně;
  • slabě zářící pozdě v noci [96] .

Maximální množství světla emitovaného jedním zábleskem se mezi druhy výrazně liší, přičemž velcí zástupci uvolní více světla jedním zábleskem než malí. V populaci dinoflagelátů vyšle v průměru jedna buňka jeden záblesk za den. Není jasné, zda buňka v tomto období svítí opravdu jednou a jen jednou, nebo naopak některé buňky svítí opakovaně, jiné nesvítí vůbec. Jas záře je ovlivněn zásobováním buněk živinami. Noční řasy, které mají zelené endosymbiontní řasy, uvolňují čím více fotonů, tím intenzivněji jsou buňky osvětleny, a proto je fotosyntéza aktivnější. Různí jedinci patřící ke stejnému druhu rodů Dissodinium a Pyrocystis mohou nebo nemusí být schopni luminiscence [96] .

Nejsilnější záře je charakteristická pro Pyrocystis , která způsobuje záři moří v rovníkových oblastech. Buňka Pyrocystis vyzařuje 1000krát více světla než Lingulodinium a 100krát více než Ceratium fusus , Peridinium pentagonium a Pyrodinium bahamense [96] .

Existují dvě teorie týkající se adaptivní hodnoty bioluminiscence u dinoflagelátů.

  1. Hypotéza alarmu. Podle této hypotézy, když se objeví bezobratlý živočich , který se živí dinoflageláty, dinoflageláty vydávají záři a označují polohu tohoto zvířete. Tento signál zachytí predátor, který se živí výše zmíněným bezobratlým živícím se dinoflagelátem.
  2. Hypotéza strachu. Podle této hypotézy záblesk světla, který dinoflagelát vydává, když je mechanicky stimulován jedlíkem (jako je copepod ), korýše vyděsí a způsobí, že odplave [96] .

Biologické rytmy

Rytmické procesy jsou pozorovány u mnoha zástupců Dinophyceae a nejznámější řasou vykazující rytmické změny je dinoflagelát Lingulodinium polyedrum . Tento druh je schopen bioluminiscence a má svůj vlastní luciferin a luciferázu. Tyto řasy vydávají záblesk světla, když se mořská voda, ve které plavou, prudce otřese, nebo když je silně rozbouřena. Při měření luminiscence třepané kultury v laboratoři se ukazuje, že množství světla, které buňky vydávají za jednotku času, není stejné a závisí na nedávných událostech. Pokud byla kultura pěstována za přirozeného světla nebo za podmínek den-noc, závisí množství vyzařovaného světla do značné míry na denní době, kdy bylo měření provedeno. Během dne je množství vyzařovaného světla velmi nízké a aby došlo k nějaké luminiscenci, bylo nutné kulturu velmi silně protřepat. Při noční stimulaci buněk však kultura vyzařuje mnohem více světla a k záblesku stačí jen slabé ozáření. Pokud sestrojíme graf závislosti luminiscence na denní době, pak bude graf vypadat jako na Obr. Nejvyšší luminiscence je pozorována uprostřed období tmy, ale jak se blíží ráno, záblesky se zmenšují a zmenšují a k jejich produkci je zapotřebí stále větší stimulace buněk. Intenzita luminiscence se tedy řídí cirkadiánními rytmy, protože rytmicita změn jasu záblesků byla stále zachována, když byly buňky po dlouhou dobu udržovány ve tmě. Ve tmě se cyklus udržuje po dobu 4 dnů, amplituda změn jasu záblesků však výrazně klesá. Při dlouhém pobytu buněk na světle není pozorován pokles amplitudy. Za podmínek nepřetržitého osvětlení správné intenzity cyklus trvá minimálně 3 týdny [97] .

Měření fotosyntézy v Lingulodinium polyedrum , jak z hlediska uvolňování kyslíku , tak i fixace oxidu uhličitého , ukázala, že tyto procesy jsou také rytmické, přesněji řečeno, řídí se cirkadiánními rytmy a nezanikají za podmínek dlouhodobého osvětlení. Nejvyšší intenzita fotosyntézy je podle očekávání pozorována uprostřed dne. Rytmus fotosyntézy zajišťují změny fotosystému II [98] .

Třetím procesem v Lingulodinium polyedrum , který je v souladu s cirkadiánními rytmy, je buněčné dělení . Za podmínek změny dne a noci dochází k dělení buněk každých 30 minut. Když je poměr den:noc 12:12, jsou 30minutové intervaly obzvláště výrazné. Studie provedené v jiných podmínkách den:noc, například 7:7, ukázaly, že pro buněčné dělení není přechod den-noc rozhodující, protože k buněčnému dělení dochází 12 hodin po začátku období tmy, i když nový období světla přišlo dávno před tím. Za podmínek dlouhodobého osvětlení světlem o nízké intenzitě jsou všechny ostatní cirkadiánní rytmy Lingulodinium polyedrum zachovány, buňky se však prakticky nedělí a celková doba existence buňky se prodlužuje na téměř 6 dní. Ty buňky, které jsou připraveny se dělit, se však dělí každých 24 hodin ve stejnou dobu [99] .

Čtvrtým typem cirkadiánního rytmu u dinoflagelátů je vertikální migrace buněk ve vodním sloupci. Před svítáním buňky vystupují na povrch, kde tvoří velké shluky (agregace), ale v noci opět plavou do hlubin. V mořských vodách během vertikální migrace buňky podléhají následujícím gradientům :

  • Koncentrace živin jsou větší v hloubce, protože se hromadí u dna nebo termokliny , zatímco v povrchových vodách nejsou téměř žádné živiny.
  • Teplota blízko povrchu je vyšší než teplota v hloubce.
  • Mění se intenzita světla.
  • Ve stojatých vodách jsou rozdíly mezi povrchovými a hlubokými vrstvami vody téměř negovány přílivovými vlnami [99] .

Lingulodinium polyedrum má určitou kontrolu nad luminiscencí, fotosyntézou a dělením buněk, takže každý proces vrcholí a přirozeně klesá v přísně uspořádaném režimu každých 24 hodin. Všechny tyto procesy lze řídit jediným mechanismem – biologickými hodinami. Může se klidně stát, že prvkem buňky, který řídí biologické hodiny, je plazmatická membrána, protože u synchronizovaných buněk dochází k rytmické reorganizaci plazmatické membrány každých 24 hodin [99] .

Přestože rytmické procesy v Lingulodinium polyedrum vrcholí v různých fázích, předpokládá se, že jsou regulovány jedním kardiostimulátorem. Rytmické procesy zřejmě nemají zpětnou vazbu, a proto jsou řízeny vyšším mechanismem. Fotosyntézu lze tedy účinně potlačit působením konkrétního herbicidu, ale rytmus bioluminiscence je zachován a její fáze se také nemění. Tato pozorování podporují následující model týkající se cirkadiánních rytmů Lingulodinium polyedrum . Centrální kardiostimulátor je regulován slunečním světlem a synchronizován s ním prostřednictvím fotoreceptorů, přičemž udržuje 24hodinovou periodicitu cirkadiánních rytmů. V souladu s tím reguluje všechny ostatní rytmické procesy: buněčné dělení, bioluminiscenci, fotosyntézu [100] .

U dinoflagelates jsou cirkadiánní rytmy řízeny dvěma odlišnými systémy: systémem citlivým na červené světlo, který prodlužuje časové intervaly, a systémem citlivým na modré světlo, který synchronizuje rytmy s úsvitem. Pravděpodobně tyto systémy stimulují nebo potlačují tvorbu melatoninu v buňkách. Zvýšení koncentrace melatoninu zřejmě znamená konec světelné fáze. Při tvorbě melatoninu je sledován cirkadiánní rytmus: na konci světlé fáze se koncentrace melatoninu rychle zvyšuje a během tmavé fáze postupně klesá a na začátku světlé fáze dosahuje svých minimálních hodnot. Koncentrace melatoninu v dinoflagelátových buňkách je podobná jako v epifýze savců . Melatonin je tedy základem fotoperiodických jevů v tak vzdálených skupinách organismů, jako jsou dinoflageláty a savci. Tato skutečnost potvrzuje přítomnost prastarého mechanismu spojujícího informace o osvětlení s cirkadiánními rytmy [101] .

Distribuce a ekologie

Mezi volně žijícími dinoflageláty se vyskytují jak mořské (asi 90 % všech dinoflagelátů žije v mořských vodách, kde jsou součástí planktonu i bentosu ), tak sladkovodní formy [102] . Spolu s rozsivekmi tvoří většinu mořského fytoplanktonu , v tropických vodách převládají dinoflageláty a v polárních a cirkumpolárních vodách rozsivky. Dinoflageláty jsou v pobřežních mořských vodách na druhém místě po rozsivecích jako primární producenti . Největší diverzita a hojnost dinoflagelátů je pozorována v neritické zóně oceánů, kde je obsaženo více organické hmoty díky splachům s pobřežím, ale žijí také v pelagiálu (otevřená voda) v tropech a subtropech [83] .

Mezi bentické dinoflageláty se rozlišují dvě hlavní ekologické skupiny: psamofilní druhy žijící v mořském písku a epifytické druhy žijící na mořských řasách a trávách (zejména mezi epifytické dinoflageláty patří zástupci rodů Prorocentrum a Gambierdiscus , známé svou toxicitou ) [103]. .

Ve sladkovodním fytoplanktonu jsou dinoflageláty mnohem méně hojné ( nejčastěji se zde vyskytují druhy Ceratium a Peridinium ) [104] .

Zdá se, že většina dinoflagelátů jsou kosmopolité . Vyskytují se v severních, mírných a jižních zeměpisných šířkách, i když nejhojněji se vyskytují v teplých vodách, kde jsou jejich počty vysoké po celý rok. V mírných oblastech je největšího množství dinoflagelátů dosaženo až koncem jara a léta. V mořských i sladkých vodách dochází před masovým rozvojem dinoflagelátů k masovému rozvoji rozsivek. Existují kryofilní dinoflageláty, které žijí ve sněhu a dávají mu červenou barvu. Mezi dinoflageláty jsou epifyty a typické bentické formy mnohem vzácnější než planktonní [83] .

Dinoflageláty jsou schopny produkovat velkou biomasu v krátkém čase , a proto slouží jako důležitý článek v potravním řetězci ryb , kytovců , vířníků , různých prvoků [83] a dalších vodních organismů  , a to jak přímo, tak po předběžné konzumaci zooplanktonem . zástupci [28] [104] .

Dinoflageláty se často chovají jako symbionti ( zooxanthellae ) jiných organismů - mořských bezobratlých ( houby , útesové korály , medúzy , ploštěnci , měkkýši ) a protistů ( radiolaria , foraminifera , nálevníci ). V každém z případů symbiózy stačí, aby hostitel po požití dinoflagelátu jej začlenil, aniž by jej strávil ve svých tkáních ; poté se symbiont opakovaně dělí a začíná syntetizovat sacharidy , které dodává hostitelskému organismu. Stupeň závislosti hostitele na takové symbióze se velmi liší: například Anemonia [ může docela žít bez zooxanthel a někteří koráli se neobejdou bez dinoflagelátních symbiontů [13] [105] . Je známo, že nejméně 5 druhů dinoflagelátů (z nichž 4 patří do rodu Symbiodinium ) působí jako zooxanthellae. Zooxanthellae jsou pokryty tenkou skořápkou, schopnou vegetativního rozmnožování a tvorby výtrusů podobných hymnodiniu. Nejlépe je prostudována asociace zooxanthel a korálů tvořících útesy . Je to případ mutualismu a oba organismy z něj těží. Zooxanthellae dávají svému hostiteli až 50 % pevného uhlíku , z nichž většina přichází ve formě glycerolu , menší část - ve formě glukózy , alaninu , organických kyselin . Bylo prokázáno, že koráli se zooxanthellami rychleji kalcifikují. Korál dodává řase některé organické sloučeniny ( močovina , glycerol-3-fosfát , aminokyseliny ) a růstové faktory [106] .

Dinoflageláty samotné jsou často hostiteli mnoha symbiotických řas, endo- i exosymbiontů . Sinice Synechocystis a Synechococcus tedy žijí na povrchu buněk bezbarvých dinofytů Citharister , Histioneis , Ornithocercus a Parahistioneis . Dinoflagelátní endosymbionti mohou být kryptofyty, zelené a zlaté řasy , stejně jako bakterie. Takže ve vodách Nové Guineje jsou zelené Noctiluca , které však postrádají chloroplasty, ale obsahují 6 až 12 tisíc malých buněk zelené řasy Pedinomonas [106] .

Asi 20 druhů dinoflagelates jsou parazity bezobratlých (zejména malých korýšů ), ryb a vláknitých řas [13] . Rozšířený dinoflagelát Dissodinium pseudolunula  je ektoparazit vajíček copepod , který má chloroplasty. Ektoparazité zbavení chloroplastů parazitují na rybách, vajíčkách copepodů, rozsivek a dalších řasách (zástupci rodů Chytriodinium , Paulsenella aj.). Dva rody endoparazitických dinoflagelátů nalezených ve vejcích copepod, Blastodinium a Schizodinium  , mají chloroplasty. Endoparaziti bez chloroplastů obývají další dinoflageláty, sifonofory a veslonôžky [106] . Hranice mezi symbionty a parazity je někdy nejasná; druhy rodu Symbiodinium se tedy obvykle chovají jako symbionti korálů a jiných bezobratlých, ale některé jejich druhy se chovají spíše jako parazité a jsou schopny způsobit hromadnou smrt korálů [107] .

Řada druhů dinoflagelátů, množících se ve významných počtech, je schopna způsobit vodní květy . Zejména propuknutí hojnosti mořských dinoflagelátů v pobřežních vodách, ke kterému obvykle dochází v teplém období, vede k jevu zvanému „ červený příliv “ (v mořích Ruska jsou červené přílivy pozorovány na Dálném východě [108] ] ). Během rudého přílivu získává mořská voda díky přítomnosti mikroskopických řas obsahujících fotosyntetické pigmenty neobvyklou barvu – obvykle červenou, někdy však třešňovou, hnědou nebo žlutou [109] . Vznik červených přílivů usnadňují vlastnosti vody: teplé povrchové vrstvy, vysoký obsah živin , nízká slanost (což se často stává po dlouhém období dešťů) a absence silných vln. Pokud druhy produkující červený příliv produkují toxiny, výsledkem by mohla být masová úmrtnost ryb, měkkýšů a korýšů živících se planktonem (viz níže ; mnoho dinoflagelátů produkujících toxiny nemění barvu vody [110] ) [ 13] . Na konci srpna 1987 byl tedy na západním pobřeží Floridy pozorován nejsilnější rudý příliv za posledních 150 let a pláže byly posety stovkami tisíc mrtvých ryb. Bylo zjištěno, že za to může dinoflagelát Gymnodinium breve [111] .

Ve sladké vodě jsou květy řas obvykle způsobeny nedinoflagellaty; v některých oblastech však hrají hlavní roli posledně jmenovaní (zejména zástupci rodů Peridinium , Ceratium a Peridiniopsis ) [112] . Ceratium hirundinella tedy během hromadného rozmnožování dává vodě hnědo-bělavou barvu (kterou lze pozorovat v létě v stojatých vodách a lužních jezerech ukrajinských řek ) [28] . Dalším známým příkladem je intenzivní krvavě červené zbarvení vod horského jezera Lago di Tovel , které leží na severozápadě provincie Trento v Itálii , pozorované do roku 1964 v určitých slunečných dnech (mezi červencem a září) . Dlouho se věřilo, že za takové zbarvení jsou zodpovědné druhy rodu Glenodinium , později se však zjistilo, že zbarvení způsobili zástupci druhu Tovellia sanguinea popsaní v roce 2006 (v jezeře se vyskytují dodnes, ale v r. malé počty: převaha přešla na jiný dinoflagelát Baldinia anauniensis , mající zelenou barvu) [113] [114] .

Fenomén Rudého Nilu je také běžně spojován s množením sladkovodních dinoflagelátů . Tak se nazývá druhá fáze letní a podzimní povodně na dolním toku Nilu , během níž se řeka vylije z břehů a na přilehlých polích pak zanechá další vrstvu úrodného bahna (během první fáze - „zelená Nil"  - řeka, díky mikroskopickým řasám, které jsou v ní přítomny, získává zelenou barvu a během druhé - tmavě červenou). Konkrétní druhy dinoflagelátů odpovědné za tento jev nebyly dosud identifikovány (někteří autoři se domnívali, že příčinou červeného zbarvení vod Nilu by mohla být sinice Oscillatoria rubescens , euglenoid Euglena sanguinea nebo zelená řasa Haematococcus pluvialis , ale tyto hypotézy nedostaly spolehlivé odůvodnění) [115] .

Paleontologie

Dinoflagelátové fosilie jsou známy ze středního triasu ; současně pozůstatky dvou rodů, Arpylorus [116] a Palaeodinophysis [117] , pravděpodobně příbuzných dinoflagelátům, pocházejí z pozdního siluru a devonu , v tomto pořadí . V raných druhohorách prudce vzrostla diverzita dinoflagelátů a vznikly jejich hlavní morfologické typy. V křídě dosáhly dinoflageláty nejvyšší morfologické diverzity, ale od neogénu dochází k jejímu úbytku [118] .

Ve fosilním stavu jsou dinoflageláty zastoupeny především dinocystami , které jsou díky své perzistenci dobře zachovány ve starých sedimentárních horninách . Nálezy dinocyst jsou známy již od permu a mají velký význam pro stratifikaci druhohor a kenozoika , protože na jejich základě byla vytvořena lokální stratigrafická měřítka . Jsou také cenné pro paleoekologické studie. Fosilní cysty dinoflagelátů se nazývají histrichosferidy (histrichospory) a jsou považovány za součást acritarchs  , cystovitých struktur fosilních jednobuněčných řas [76] [119] . Ve stejné době byly dinosteroly a 4α-methyl-24-ethylcholesten specifické pro dinoflageláty nalezeny již u starokambrických akritarchů (před 520 miliony let); jsou-li předpoklady o vztahu mezi akritarchy a dinoflageláty správné, pak evoluční historie posledně jmenovaných může být rozšířena do raného kambria a ještě dříve (před 800 miliony let) [10] .

Histrichospherids byly objeveny nezávisle různými paleontology a jsou klasifikovány jako samostatná taxonomická skupina reprezentovaná výhradně fosilními druhy ; mnoho klidových výtrusů dinoflagelátů je identických s kenozoickými histrichosferidami, takže v tomto případě má jedna struktura dvě jména. Z permu jsou známy i fosilní pozůstatky dinoflagelátových schránek , jsou však mnohem vzácnější [76] [119] .

Význam v přírodě a lidském životě

Význam dinoflagelátů v biosféře je velmi vysoký. V ekosystému korálových útesů jsou fototrofní dinoflageláty nejdůležitějšími primárními producenty a mezi mořskými primárními producenty obecně jsou na druhém místě po rozsivecích . Heterotrofní mořské dinoflageláty se ukázaly být důležitými složkami takzvané mikrobiální smyčky , pomáhající nasměrovat významné energetické toky do planktonních potravních sítí [51] [120] .

Dinoflagelátová místa (místa květu) patří mezi nejdůležitější přírodní úložiště tuku (například úložiště Severního moře ). Fosilní horniny obsahující odumřelé buňky dinoflagelátů také slouží jako zásoby tuku nahromaděného v buňkách. Největší z těchto úložišť je Kimmeridge břidlice ( angl.  Kimmeridge Clay ) v Anglii . Ropa a starověká sedimentární ložiska obsahují také 4α-methylstyrenové uhlovodíky , které pravděpodobně pocházejí z 4α-methylstyrenů dinoflagelátů [121] .

Parazitické dinoflageláty jsou schopné způsobit epizootiku v populacích ryb a korýšů [122] .

Mnoho dinoflagelátů je velmi citlivých na přítomnost organických polutantů ve vodě, a proto se používají jako bioindikátory v hygienickém a biologickém průzkumu vodních zdrojů [28] . Fosilní cysty dinoflagelátů slouží geologům k odhadu stáří navrhovaných ložisek ropy [108] .

Toxiny

Některé druhy dinoflagelates jsou schopné produkovat nebezpečné toxiny ; mezi druhy fytoplanktonu tvořícího toxiny tvoří dinoflageláty asi 75–80 % a toxiny uvolňované dinoflageláty patří mezi nejsilnější známé biotoxiny [51] . Je známo asi 60 druhů dinoflagelátů produkujících toxiny; více než polovina z nich patří k rodům Prorocentrum , Alexandrium a Dinophysis , v menší míře pak Gambierdiscus , Ostreopsis a Karenia [92] .

Některé z toxinů produkovaných dinoflageláty jsou těkavé a bylo známo, že způsobují otravu u vědců studujících dinoflageláty při vdechování nebo kontaktu s kůží [86] . Dinoflagelátové toxiny mohou být rozpustné ve vodě a tucích, mají cytolytické, hepatotoxické a neurotoxické účinky [110] .

Často (zejména během červených přílivů) se tyto toxiny hromadí v tkáních mlžů živících se fytoplanktonem, aniž by jim způsobily velké škody, ale jejich hladina v tkáních je toxická (často smrtelná) pro obratlovce živící se měkkýši  – pro ryby nebo lidi. V druhém případě mohou způsobit následující onemocnění [51] [123] [124] :

Choroba toxiny Strukturní vzorec patogeny Mechanismus působení Příznaky
Paralytická otrava měkkýšů (anglicky Paralytic shellfish poisoning, PSP) Saxitoxiny , neosaxitoxiny , goniatoxiny saxitoxin Alexandrium ,Gymnodinium, Karenia ,Pyrodiniuma další. Blokují sodíkové kanály v nervových a svalových buňkách . Paralytická otrava, smrt může nastat za 2-24 hodin.
Amnesic shellfish poisoning (ang. Amnesic shellfish poisoning, ASP) Kyselina domoová Kyselina domoová Prorocentrum lima [125] Působí na kainátové receptory centrálního nervového systému jako aktivátor glutamátu , nadměrně stimuluje nervový systém a způsobuje v něm degenerativní účinky. Amnézie (ztráta krátkodobé paměti ), toxické poškození mozku ; s těžkou otravou - smrt.
Průjmová otrava měkkýši [ (DSP ) Dinophysistoxiny, kyselina okadaová , pektenotoxiny, essotoxiny Kyselina okadaová Dinophysis ,Prorocentrum,Gonyalax grindleyi Kyselina okadaová blokuje práci proteinových fosfatáz ve střevních buňkách [126] . Průjem, zvracení, bolesti břicha, průjem [127] . Úmrtí nejsou známa.
Neurotoxická otravaměkkýšů en]  Brevetoxiny Brevetoxin A Karenis brevis Působí na napěťově řízené sodíkové kanály, což způsobuje konstantní proud sodíkových iontů do buňky a depolarizaci [128] . Výpadky paměti, paralýza. Toxiny vdechované postříkáním mohou způsobit dýchací potíže .
Otrava měkkýšů azaspirovou kyselinou ( ASP  ) Azaspiracid Protoperidinim crassipes Inhibují syntézu proteinů, indukují apoptózu . Příznaky jsou jako u průjmové otravy měkkýši.
Ciguatera ( angl.  Ciguateric fish poisoning , CFP) Ciguatoxiny , mitotoxiny Ciguatoxin Gambierdiscus toxicus a další. Ciguatoxiny působí na sodíkové kanály [129] K otravě dochází při konzumaci ryb z korálových útesů. Neurologické a gastrointestinální příznaky. Smrtelné následky jsou vzácné.
PEAS ( Possible Estuary Associated Syndrome [130] ( špatně  pochopená nemoc) Dinoflageláty ústí ( Pfiesteria piscicida a příbuzné druhy) Porucha paměti a učení, poškození kůže, respirační účinky.

Některé dinoflageláty, které produkují toxiny, které mohou ovlivnit ryby , savce a ptáky , mají velký ekonomický význam, protože poškozují farmy, které chovají mořské živočichy [110] . Mezi tyto druhy patří Pfiesteria piscicida , která se vyznačuje neobvyklým životním cyklem. Toxiny uvolňované tímto dinoflagelátem jsou tak silné, že ryby, které se jimi živí (např . sleď atlantický , platýs jižní ), umírají během několika minut [86] . Právě tento druh dinoflagelátů je zodpovědný za masový úhyn ryb během rudého přílivu u atlantického pobřeží USA [51] [123] .

V potravinářském průmyslu

Dinoflagelát Crypthecodinium cohnii se v průmyslovém měřítku používá k výrobě kyseliny dokosahexaenové (cervonové), která je jednou z nejdůležitějších esenciálních omega-3 polynenasycených mastných kyselin pro lidské tělo [131] .

Klasifikace a fylogeneze

Téměř po celé 20. století vyvíjeli klasifikaci dinoflagelátů prakticky nezávisle protozoologové a botanici- algologové . Protozoologové interpretovali taxon jako řád Dinoflagellida  Bütschli, 1885 v rámci kmene Protozoa [133] ; algologové - buď jako třída Dinophyceae  Pascher, 1914 jako součást divize Pyrrophyta (která zahrnovala i třídu Cryptophyceae , a někdy také třídu Chloromonadophyceae ) [15] [28] , nebo jako samostatná divize Dinophyta  Dillon, 1963 [134] . Botanici zároveň vybudovali vnitřní klasifikaci dinofytních řas na základě typu organizace stélku , rozlišující řády Peridiniales (monadické formy), Dinamoebidiales (rhizopodiální formy), Gloeodiniales (palmeloidní formy), Dinococcales (kokoidní formy), Dinothrichales (vláknité formy) [15] . Na konci 20. století tyto rané klasifikace zcela zastaraly [10] .

Moderní výzkum v oblasti taxonomie dinoflagelátů je založen na analýze jejich fylogeneze , prováděné s ohledem na morfologická i molekulární data [10] . Podle fylogenetické analýzy (2014) na základě srovnání nukleotidových sekvencí RNA 76 druhů alveolátů a heterokontů (zástupci posledně jmenovaných hráli roli outgroup ), dinoflageláty v rámci alveolátů představují monofyletickou skupinu, sesterskou k apikomplexům a společný rodový taxon dinoflagelátů a apikomplexů byl sestrou nálevníků. V mezích dinoflagelátů oddělil Perkinsus marinus nejdříve z druhů účastnících se analýzy (podle jiných klasifikací nejsou Perkinsus a příbuzné skupiny zahrnuty mezi dinoflageláty, ale ve složení jejich sesterské skupiny Perkinsozoa [ 135] [136 ] ), po něm - Oxyrrhis marina , ještě později - klad sindiny [ a zbývající skupiny dinoflagelátů ( dinokaryotes ) tvoří ve vztahu k ní sesterský klad. Vnitřní vztahy zástupců diokaryot nejsou dosud jasné a dostupná data jsou do značné míry rozporuplná [132] .

Fensomeův systém se spoluautory

Nejdůležitější příspěvek k utváření moderních představ o taxonomii dinoflagelátů přinesl systém [137] publikovaný v roce 1993 a navržený Robertem Fensem et al. Tento systém spojil moderní a fosilní rody do jediné klasifikace a shrnul dosavadní úspěchy v oblasti taxonomie dinoflagelátů; vycházela především z morfologických znaků (především z charakteristik buněčného integumentu), ale zohledňovala také molekulární data získaná porovnáním nukleotidových sekvencí jednotlivých genů ribozomální RNA . V následujících letech se systém rozšířil; zároveň byly vysloveny vážné pochybnosti o monofylii řady v ní rozlišovaných podtříd a řádů [138] [139] .

V rámci tohoto systému se klasifikace typu Dinoflagellata dívá na nejvyšší úroveň následovně [140] [141] :

Typ Dinoflagellata  Bütschli, 1885 (dinoflagellates)

  • Podkmen Syndinea   Chatton, 1920 (Syndinea)
    • Třída Syndiniophyceae   Loeblich III, 1976 (Syndinophyces): řád Syndiniales
  • Podtyp Dinokaryota   Fensome et al. , 1993; Cavalier-Smith, 1993 (dinokaryota)
    • Třída Dinophyceae   Pascher, 1914 (Dinophycea)
      • Podtřída Gymnodiniphycidae  Fensome et al. , 1993 : objednávky Gymnodiniales, Ptychodiscales, Suessiales
      • Podtřída Peridinphycidae  Fensome et al. , 1993 : objednávky Gonyaulacales , Peridiniales
      • Podtřída Dinophysiphycidae  Möhn, 1984 : řády † Nannoceratopsiales, Dinophysiales
      • Podtřída Prorocentrophycidae  Fensome et al. , 1993 : Prorocentrales order
      • Dinophyceae incertae sedis : řády Desmocapsales, Phytodiniales, Thoracosphaerales
    • Třída Blastodinifyceae  Fensome et al. , 1993 (Blastodinyfiaceae): řád Blastodiniales
    • Třída Noctiluciphyceae  Fensome et al. , 1993 (Noctilucifian): řád Noctilucales
  • Dinoflagellata incertae sedis : čeleď †Arpyloraceae s rodem Arpylorus

Autoři systému nezařadili do složení dinoflagelátů řády Ellobiopsida (paraziti korýšů ) a Ebriida (volně žijící fagotrofní bičíkovci ), jejichž systematické postavení dlouhodobě vyvolávalo spory mezi protozoology. [139] . Později se ukázalo, že ellobiopsidy stále patří mezi dinoflageláty [142] , zatímco ebriidy nikoli: své místo našly ve třídě Cercozoa [143] . Mezi uvažovanými rody nebyl zmíněn ani bičíkatý Oxyrrhis (dříve obvykle řazený do syndinia jako jediná volně žijící forma této skupiny [144] ); pozdější studie ukázaly, že v rodokmenu dinoflagelátů představuje zvláštní, raně divergentní větev [132] .

System Ruggiero et al

Výzkum v oblasti fylogeneze dinoflagelátů, který se rozvinul na přelomu 20. a 21. století, se promítl do taxonového systému Dinoflagellata navrženého v roce 2015 Michaelem Ruggierem et al., který byl zahrnut jako integrální součást makrosystému živé organismy, které prezentovali. Zde má tento taxon hodnost nadtřídy v rámci kmene Miozoa supertypu Alveolata (postavení této nadtřídy mezi ostatními alveoláty naleznete v části "Klasifikace" v článku Alveoláty ). Systém byl doveden na úroveň řádů a řádů (ve vztahu ke třídě Dinophyceae se autoři systému řídí pravidly botanické nomenklatury , ve vztahu k ostatním třídám dinoflagelátů - pravidly zoologické nomenklatury ) a vypadá takto [135] [136] :

Superclass Dinoflagellata  Bütschli, 1885 (dinoflagellates)

  • Třída Ellobiopsea   Cavalier-Smith, 1993 (ellobiopsei): řád Ellobiopsida
  • Třída Oxyrrhea   Cavalier-Smith, 1987 (Oxyrrhea): řády Acrocoelida, Oxyrrhida
  • Class Syndinea   Chatton, 1920 (Sindinea): objednávky Rastrimonadida, Syndinida
  • Třída Noctilucea   Haeckel, 1866 (Noctylucea): řád Noctilucida
  • Třída Dinophyceae   Pascher, 1914 (Dinophycea)
    • Podtřída Suessioidia   Cavalier-Smith & Chao, 2004 objednat Suessiales
    • Podtřída Dinophysoidia   Lindemann, 1928 : řády † Nannoceratopsiales, Dinophysiales
    • Podtřída Peridinoidia   Poche, 1913 : řády Prorocentrales , Peridiniales
    • Podtřída Gonyaulacoidia   Cavalier-Smith, 2004 : řády Gymnodiniales, Gonyaulacales
    • Dinophyceae incertae sedis : řády Actiniscales, Blastodinales, Coccidinales, Dinamoebales, Lophodinales, Pyrocystales, Thoracosphaerales

Dinoflageláty v kultuře

Přestože jsou dinoflageláty mikroskopické velikosti, neobvyklé přírodní jevy, které způsobují při masovém rozmnožování, přitahovaly pozornost lidí již dlouho a odrážely se v literárních památkách  , včetně těch velmi raných [145] .

„Červený Nil“ je zmíněn již ve staroegyptských textech z doby Nové říše . Tento jev se odráží i v Bibli : v knize „ Exodus “, jako první z „ deseti ran egyptských “, je zmíněn trest krví : „...veškerá voda v řece se proměnila v krev a ryby v řece vymřely a řeka páchla a Egypťané nemohli pít vodu z řeky; a krev byla po celé egyptské zemi .

Fenomén krvavě červeného zbarvení vod jezera Lago di Tovel tvořil základ legendy . Podle ní si kdysi mnoho nápadníků namlouvalo princeznu Trezengu, dceru posledního vládce Ragoli , ale ona všechny odmítla. Jeden z odmítnutých nápadníků, Lavinto, vládce Tuenna , se nesmířil a pokusil se vynutit si souhlas princezny násilím a poslal proti obyvatelům Ragoli armádu. Nechtěli se podrobit arogantnímu Lavintovi a v čele s Trezengou bojovali na břehu jezera s nepřítelem, který je převyšoval. Na konci dne padli obránci Ragoli a Lavinto osobně probodl Trezengu mečem; jezero bylo potřísněno krví padlých a od té doby čas od času lidem připomínalo odvahu obyvatel Ragoli [146] [147] .

Obrazné popisy záře moře podal I. A. Goncharov v cyklu cestovatelských esejů „ Fregata Pallada“ (1855-1857) a Victor Hugo v románu „ Toilers of the Sea “ (1866). Zde je obrázek tohoto jevu, který podal Hugo: „Zdálo se, že voda byla pohlcena ohněm... Namodralé pruhy na vodě ležely v záhybech rubáše. Na hladině vody se třepotala široká škála bledé záře. Ale nebyl to oheň, ale jeho duch... Kapky, padající z vesla do vlny, sprchují moře hvězdami... Vložíš ruku do vody a vyndáš ji v ohnivé rukavici; tento plamen je mrtvý, necítíte to .

Poznámky

  1. 1 2 Belyakova et al., 2006 , s. 140.
  2. Objednejte obrněné bičíkovce neboli Peridinea – článek z Velkého encyklopedického slovníku
  3. 1 2 3 Houseman a kol., 2010 , str. 118.
  4. Belyakova et al., 2006 , s. 141.
  5. Shukanov et al., 2009 , s. 60.
  6. Munday R., Thomas K., Gibbs R., Murphy C., Quilliam M. A.  Akutní toxicita saxitoxinu, neosaxitoxinu, dekarbamoyl saxitoxinu a gonyautoxinů 1&4 a 2&3 na myši různými způsoby podání  // Toxikon. - 2013. - Sv. 76, prosinec 15. - S. 77-83. - doi : 10.1016/j.toxicon.2013.09.013 . — PMID 24060374 .
  7. Baker M. . Světelného vodního hmyzu // Zaměstnání pro mikroskop. - Londýn: Dodsley, 1753. - 403 s.  - S. 399-403.
  8. Müller O. F. . Vermium terrestrium et fluviatilium, seu animalium infusoriorum, helminthicorum et testaceorum, non marinorum, succincta historia. sv. 1 . - Havniæ et Lipsiæ : Heineck a Faber, 1773. - xxxiv + 135 S.  (nepřístupný odkaz)  - S. 63, 98.
  9. Ehrenberg C. G.  Beiträge zur Kenntnis der Organization der Infusorien und ihrer geographischer Verbreitung, besonders in Sibirien // Abhandlungen der Königlich Preussischen Akademie der Wissenschaften zu Berlin gehalten in den Jahren -881830 -881830
  10. 1 2 3 4 5 Okolodkov, 2011 , str. osm.
  11. Butschli O. . 3. Unterabtheilung (Ordnung) Dinoflagellata // Dr. Klassen und Ordnungen des Thier-Reichs, wissenschaftlich dargestellt in Wort und Bild od H. G. Bronna. bd. 1. Prvoci. - Leipzig und Heidelberg: C. F. Winter, 1885. - xviii + 1097 S.  - S. 906-1029.
  12. Carty, Parrow, 2015 , str. 773.
  13. 1 2 3 4 Dinoflagellata: Životní historie a ekologie . // Muzeum paleontologie Kalifornské univerzity . Získáno 29. července 2015. Archivováno z originálu 17. října 2015.
  14. Okolodkov, 2011 , str. 8-9.
  15. 1 2 3 Kurz nižších rostlin / Ed. M. V. Gorlenko . - M . : Vyšší škola , 1981. - 504 s.  - S. 220-222.
  16. 1 2 Belyakova et al., 2006 , s. 142.
  17. Ruppert, Fox, Barnes, 2008 , str. 67.
  18. 1 2 3 Houseman a kol., 2010 , str. 119.
  19. 1 2 3 Lee, 2008 , str. 265.
  20. Mukhin, Treťjaková, 2013 , str. 82.
  21. 12 Lee , 2008 , str. 263.
  22. Belyakova et al., 2006 , s. 142-143.
  23. Raven a kol., 2005 , str. 303.
  24. 1 2 3 Belyakova et al., 2006 , str. 143.
  25. 1 2 3 4 5 Belyakova et al., 2006 , str. 144.
  26. Lee, 2008 , str. 265-267.
  27. 12 Lee , 2008 , str. 268.
  28. 1 2 3 4 5 Matvienko A. M.  Oddělení pyrofytických řas (Pyrrophyta) // Život rostlin. T. 3. Řasy. Lišejníky / Ed. M. M. Gollerbach . - M . : Vzdělávání , 1977. - 487 s.  - S. 93-100.
  29. Sarjeant W.A.S. Fosilní a žijící dinoflageláty. - San Diego: Elsevier , 2013. - viii + 182 s. — ISBN 978-1-48-327232-0 .  - S. 17-18.
  30. Georgi K. Marinov, Michael Lynch. Diverzita a divergence dinoflagelátových histonových proteinů  (anglicky)  // G3: Genes, Genomes, Genetics. — 2016-02-01. — Sv. 6 , iss. 2 . — S. 397–422 . — ISSN 2160-1836 . - doi : 10.1534/g3.115.023275 . Archivováno z originálu 7. srpna 2017.
  31. Sedova, 1996 , str. 122.
  32. Sedova, 1996 , str. 209.
  33. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 Wisecaver J. H., Hackett J. D.  Dinoflagellate genome evolution  // Annual review of microbiology. - 2011. - Sv. 65. - S. 369-387. - doi : 10.1146/annurev-micro-090110-102841 . — PMID 21682644 .
  34. Sedova, 1996 , str. 122, 124.
  35. 1 2 3 4 5 Belyakova et al., 2006 , str. 145.
  36. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Hackett J. D., Anderson D. M., Erdner D. L., Bhattacharya D.  Dinoflagelláty: pozoruhodný evoluční experiment  // American Journal of Botany . - 2004. - Sv. 91, č. 10. - S. 1523-1534. - doi : 10.3732/ajb.91.10.1523 . — PMID 21652307 .
  37. 1 2 Sedova, 1996 , str. 207.
  38. 1 2 3 4 Houseman a kol., 2010 , str. 121.
  39. Belyakova et al., 2006 , s. 145-146.
  40. Imanian B. , Pombert JF , Dorrell RG , Burki F. , Keeling PJ Terciární endosymbióza u dvou dinotomů vyvolala jen malé změny v mitochondriálních genomech jejich dinoflagelátních hostitelů a endosymbiontů rozsivek.  (anglicky)  // Public Library of Science ONE. - 2012. - Sv. 7, č. 8 . — P. e43763. - doi : 10.1371/journal.pone.0043763 . — PMID 22916303 .
  41. Belyakova et al., 2006 , s. 146.
  42. 1 2 3 Thomas G. Doak, Robert B. Moore, Ove Hoegh-Guldberg, Mary Alice Coffroth. Důvody pro vybudování dinoflagelátových knihoven Symbiodinium BAC . — 2005.
  43. Rae P. M.  5-Hydroxymethyluracil v DNA dinoflagelátu  // Proc. Nat. Akad. sci. USA . - 1973. - Sv. 70, č. 4. - S. 1141-1145. — PMID 4515611 .
  44. Bayer T., Aranda M., Sunagawa S., Yum L. K., Desalvo M. K., Lindquist E., Coffroth M. A., Voolstra C. R., Medina M.  Symbiodinium transscriptomes  : genome insights to the dinoflagelate symbionts of reef-building coral . - 2012. - Sv. 7, č. 4. - P. e35269. - doi : 10.1371/journal.pone.0035269 . — PMID 22529998 .
  45. Sedova, 1996 , str. 206.
  46. 1 2 3 Alverca E., Franca S., Díaz de la Espina S. M.  Topologie sestřihu a biogeneze snRNP v jádrech dinoflagelátu  // Biologie buňky. - 2006. - Sv. 98, č. 12. - S. 709-720. - doi : 10.1042/BC20050083 . — PMID 16875467 .
  47. Mukhin, Treťjaková, 2013 , str. 84-85.
  48. 1 2 3 4 Sedova, 1996 , str. 124.
  49. 12 Lee , 2008 , str. 275.
  50. Sedova, 1996 , str. 124-125.
  51. 1 2 3 4 5 Hoppenrath M., Saldarriaga JF Dinoflagelláty . // Webový projekt Tree of Life . Získáno 6. srpna 2015. Archivováno z originálu 13. října 2012.
  52. 1 2 3 Jackson C. J., Gornik S. G., Waller R. F.  Mitochondriální genom a transkriptom bazálního dinoflagelátu Hematodinium sp. : evoluce charakteru v rámci odvozených vysoce mitochondriálních genomů dinoflagelátů  // Biologie a evoluce genomu. - 2012. - Sv. 4, č. 1. - S. 59-72. doi : 10.1093 / gbe/evr122 . — PMID 22113794 .
  53. 1 2 3 Belyakova et al., 2006 , str. 147.
  54. Nishitani G., Nagai S., Baba K., Kiyokawa S., Kosaka Y., Miyamura K., Nishikawa T., Sakurada K., Shinada A., Kamiyama T.  Vysoká kongruence kořisti Myrionecta rubra a Dinophysis druhové plastidové identity odhalené genetickými analýzami izolátů z japonských pobřežních vod  // Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. - 2010. - Sv. 76, č. 9. - S. 2791-2798. - doi : 10.1128/AEM.02566-09 . — PMID 20305031 .
  55. Wisecaver J. H., Hackett J. D.  Analýza transkriptomu odhaluje jaderně kódované proteiny pro udržení dočasných plastidů v dinoflagelátu Dinophysis acuminata  // BMC Genomics. - 2010. - Sv. 11. - S. 366. - doi : 10.1186/1471-2164-11-366 . — PMID 20537123 .
  56. Lee, 2008 , str. 269.
  57. Belyakova et al., 2006 , s. 147-148.
  58. 1 2 3 4 Belyakova et al., 2006 , str. 148.
  59. 1 2 Belyakova et al., 2006 , s. 150.
  60. Lee, 2008 , str. 272.
  61. Lee, 2008 , str. 272-273.
  62. Houseman a kol., 2010 , s. 122.
  63. 1 2 Mukhin, Treťjaková, 2013 , str. 84.
  64. Gavelis G. S., Hayakawa S., White R. A. 3rd, Gojobori T., Suttle C. A., Keeling P. J., Leander B. S.  Oceloidi podobné očím jsou postaveni z různých endosymbioticky získaných komponent  // Nature . - 2015. - Sv. 523, č. 7559. - S. 204-207. - doi : 10.1038/příroda14593 . — PMID 26131935 .
  65. 1 2 Hayakawa S., Takaku Y., Hwang J. S., Horiguchi T., Suga H., Gehring W., Ikeo K., Gojobori T.  Funkce a evoluční původ jednobuněčné struktury oka typu kamery  // PLoS ONE . - 2015. - Sv. 10, č. 3. - P. e0118415. - doi : 10.1371/journal.pone.0118415 . — PMID 25734540 .
  66. 1 2 3 Lee, 2008 , str. 273-274.
  67. Belyakova et al., 2006 , s. 149.
  68. Belyakova et al., 2006 , s. 149-150.
  69. Lee, 2008 , str. 277.
  70. 1 2 3 Belyakova et al., 2006 , str. 151.
  71. Belyakova et al., 2006 , s. 150-151.
  72. 12 Lee , 2008 , str. 275-276.
  73. Steidinger a Tangen 1997 , s. 401.
  74. Hoppenrath M., Bachvaroff T. R., Handy S. M., Delwiche C. F., Leander B. S.  Molekulární fylogeneze ocelloidních dinoflagelátů (Warnowiaceae) odvozená ze sekvencí rDNA SSU a LSU  // BMC Evolutionary Biology. - 2009. - Sv. 9. - S. 116. - doi : 10.1186/1471-2148-9-116 . — PMID 19467154 .
  75. Okolodkov, 2011 , str. 25.
  76. 1 2 3 Lee, 2008 , str. 277-278.
  77. 12 Lee , 2008 , str. 278.
  78. 1 2 3 Raven a kol., 2005 , str. 304.
  79. Lee, 2008 , str. 264-265.
  80. 1 2 Belyakova et al., 2006 , s. 152.
  81. Belyakova et al., 2006 , s. 152-153.
  82. 1 2 Sedova, 1996 , str. 161.
  83. 1 2 3 4 Belyakova et al., 2006 , str. 153.
  84. Steidinger a Tangen 1997 , s. 415.
  85. Raven a kol., 2005 , str. 305.
  86. 1 2 3 Margulis, Chapman, 2009 , str. 144.
  87. 12 Lee , 2008 , str. 285.
  88. 1 2 3 4 5 Danne J. C., Gornik S. G., Macrae J. I., McConville M. J., Waller R. F.  Alveolate mitochondrial metabolic evolution: dinoflagelates force reassessment of the role of parazitism as driver of change in apicomplexans  and Molecular biology and. - 2013. - Sv. 30, č. 1. - S. 123-139. - doi : 10.1093/molbev/mss205 . — PMID 22923466 .
  89. Belyakova et al., 2006 , s. 32.
  90. Suzuki K., Iwamoto K., Yokoyama S., Ikawa T.  Glycolate-oxidizing Enzymes in Algae // Journal of Phycology. - 1991. - Sv. 27, č. 4. - S. 492-498. — ISSN 0022-3646 . - doi : 10.1111/j.0022-3646.1991.00492.x .
  91. Hastings JW Dinoflagellátová bioluminiscence a její cirkadiánní regulace . // American Society for Photobiology (5.02.2009). Získáno 2. 8. 2015. Archivováno z originálu 24. 9. 2015.
  92. 1 2 Okolodkov, 2011 , str. 27.
  93. Tezing K. . Záře moře // Zázraky přírody. Pozoruhodná díla živé a mrtvé přírody v samostatných esejích vynikajících vědců / Ed. vyd. V. M. Šimkevič . — Str. : Typolitografie "Sebevzdělávání", 1914. - 495 s.  - S. 71-74.
  94. Lee, 2008 , str. 285-286.
  95. 1 2 3 Lee, 2008 , str. 286.
  96. 1 2 3 4 Lee, 2008 , str. 287.
  97. Lee, 2008 , str. 287-288.
  98. Lee, 2008 , str. 288.
  99. 1 2 3 Lee, 2008 , str. 289.
  100. Lee, 2008 , str. 290.
  101. Lee, 2008 , str. 290-291.
  102. Dinoflageláty . // Smithsonian National Museum of Natural History . Získáno 5. srpna 2015. Archivováno z originálu dne 21. dubna 2015.
  103. Okolodkov, 2011 , str. 37.
  104. 1 2 Nikolaev I. I.  Planktonické řasy // Život rostlin. T. 3. Řasy. Lišejníky / Ed. M. M. Gollerbach . - M . : Vzdělávání , 1977. - 487 s.  - S. 44-54.
  105. Carty, Parrow, 2015 , str. 798.
  106. 1 2 3 Belyakova et al., 2006 , str. 154.
  107. Stat M., Morris E., Gates R. D.  Funkční diverzita v symbióze korálů a dinoflagelátu  // Proc. Nat. Akad. sci. USA . - 2008. - Sv. 105, č. 27. - S. 9256-9261. - doi : 10.1073/pnas.0801328105 . — PMID 18591663 .
  108. 1 2 Okolodkov, 2011 , str. 34.
  109. Langlois GW, Tom P. D. Red Tides: Otázky a odpovědi . // Woods Hole Oceanographic Institution (30.09.2008). Získáno 3. srpna 2015. Archivováno z originálu dne 5. března 2015.
  110. 1 2 3 Belyakova et al., 2006 , str. 155.
  111. Raven a kol., 2005 , str. 302.
  112. Okolodkov, 2011 , str. 33.
  113. Moestrup Ø., Hansen G., Daugbjerg N., Flaim G., d'Andrea M.  Studie o woloszynských dinoflagelátech II: On Tovellia sanguinea sp. listopadu, dinoflagelát zodpovědný za zčervenání jezera Tovel v severní Itálii  // European Journal of Phycology. - 2006. - Sv. 41, č. 1. - S. 47-65. - doi : 10.1080/09670260600556682 .
  114. Hansen G., Flaim G.  Dinoflagelláty z provincie Trentino, Itálie  // Journal of Limnology. - 2007. - Sv. 66, č. 2. - S. 107-141. - doi : 10.4081/jlimnol.2007.107 . .
  115. 1 2 Trevisanato S. I. . Mory Egypta: Archeologie, historie a věda Podívejte se na Bibli . - Piscataway, NJ: Gorgias Press , 2005. - S. 17-24. - viii + 196p. — ISBN 978-1-59333-234-1 .
  116. Sarjeant W. A. ​​S.  Arpylorus antiquus Calandra emend., dinoflagelátová cysta z horního siluru // Palynologie. - 1978. - Sv. 2. - S. 167-179.
  117. Vozzhennikova T. F., Shegeshova L. I.   Palaeodinophysis gen. et sp. n. z devonu Rudnyj Altaj (unikátní nález dinoflagelátových fosilií) // Doklady Akademii Nauk SSSR. - 1989. - Sv. 307, č. 2. - S. 442-445.
  118. Okolodkov, 2011 , str. 40.
  119. 1 2 Michajlova I. A., Bondarenko O. B. . Paleontologie. Část 1. - M . : Moskevské nakladatelství. un-ta, 1997. - 448 s. — ISBN 5-211-03841-X .  - S. 101.
  120. Houseman a kol., 2010 , s. 123.
  121. Lee, 2008 , str. 284-285.
  122. Okolodkov, 2011 , str. 39.
  123. 1 2 Okolodkov, 2011 , str. 28.
  124. Belyakova et al., 2006 , s. 155-157.
  125. Kurisu Y., Sato S., Kobayasi K., Ogata T., Kotaki Y.  Detekce kyseliny domoové v kultuře Prorocentrum lima // DINO7, Sedmá mezinárodní konference o moderních a fosilních dinoflagellátech, 21.-25. září 2003. DINO 7 Kniha abstraktů / Ed. K. Matsuoka, M. Yoshida, M. Iwataki. - Nagasaki: Univerzita v Nagasaki, 2003. - 66 s.
  126. Dawson J. F., Holmes C. F. Molekulární mechanismy, které jsou základem inhibice proteinových fosfatáz mořskými toxiny  // Frontiers in bioscience: časopis a virtuální knihovna. - 1999. - Sv. 4. - S. D646-658. — PMID 10502549 .
  127. Diarrhetic Shellfish Poisoning (DSP) z kyseliny Okadaic . // Ministerstvo zdravotnictví státu Washington . Získáno 13. září 2015. Archivováno z originálu 15. září 2015.
  128. Watkins S. M., Reich A., Fleming L. E, Hammond R.  Neurotoxická otrava měkkýšů  // Marine Drugs. - 2008. - Sv. 6, č. 3. - S. 431-455. - doi : 10.3390/md20080021 . — PMID 19005578 .
  129. Pearn J.  Neurology of ciguatera  // Časopis neurologie, neurochirurgie a psychiatrie. - 2001. - Sv. 70, č. 1. - S. 4-8. — PMID 11118239 .
  130. Biotoxiny (živé patogeny) . // Connersova klinika. Staženo: 13. září 2015.
  131. Martek Biosciences Corporation (5. února 2007). Staženo: 6. září 2018.
  132. 1 2 3 Bachvaroff T. R., Gornik S. G., Concepcion G. T., Waller R. F., Mendez G. S., Lippmeier J. C., Delwiche C. F.  Dinoflagellate phylogeny revisited: using ribosomal proteins to resolution deep branching cladesecular  dinofylogene - 2014. - Sv. 70. - S. 314-322. - doi : 10.1016/j.ympev.2013.10.007 . — PMID 24135237 .
  133. Houseman K.  Protozoologie. — M .: Mir , 1988. — 336 s. — ISBN 5-03-000705-9 .  - S. 45-46.
  134. Algologie Gorbunova N.P. - M . : Vyšší škola , 1991. - 256 s. - ISBN 5-06-000641-7 .  - S. 162.
  135. 1 2 Ruggiero Michael A. , Gordon Dennis P. , Orrell Thomas M. , Bailly Nicolas , Bourgoin Thierry , Brusca Richard C. , Cavalier-Smith Thomas , Guiry Michael D. , Kirk Paul M. Klasifikace všech živých na vyšší úrovni Organismy  (anglicky)  // PLOS ONE. - 2015. - 29. dubna ( roč. 10 , č. 4 ). — P.e0119248 . — ISSN 1932-6203 . - doi : 10.1371/journal.pone.0119248 .
  136. 1 2 Ruggiero MA , Gordon DP , Orrell TM , Bailly N. , Bourgoin T. , Brusca RC , Cavalier-Smith T. , Guiry MD , Kirk PM Oprava: Klasifikace všech živých   organismů na vyšší úrovni // - 2015. - 11. června ( roč. 10 , č. 6 ). — P.e0130114 . — ISSN 1932-6203 . - doi : 10.1371/journal.pone.0130114 .
  137. Fensome R. A., Taylor F. J. R., Norris G., Sarjeant W. A. ​​​​S., Wharton D. I., Williams G. L. . Klasifikace živých a fosilních dinoflagelátů. - Hanover, PA: Sheridan Press, 1993. - 351 s. — ( Mikropaleontologie . Zvláštní publikace č. 7).
  138. Okolodkov, 2011 , str. 8-9, 41.
  139. 1 2 Okolodkov Yu. B.  Klasifikace a fylogeneze dinoflagellat (Dinoflagellata) // Botanický časopis . - 2000. - T. 85, č. 4 . - S. 1-14 .
  140. Okolodkov, 2011 , str. 9-14.
  141. Okolodkov Yu. B.  Moderní systém dinoflagellat (Dinoflagellata) // Botanický časopis . - 2001. - T. 86, č. 1 . - S. 110-125 .
  142. Gómez F., López-García P., Nowaczyk A., Moreira D.  Paraziti korýšů Ellobiopsis Caullery, 1910 a Thalassomyces Niezabitowski, 1913 tvoří monofyletický divergentní klad v Alveolatě  // Systematic parasitology. - 2009. - Sv. 74, č. 1. - S. 65-74. - doi : 10.1007/s11230-009-9199-1 . — PMID 19633933 .
  143. Hoppenrath M., Leander B. S.  Fylogeneze Ebriid a expanze Cercozoa  // Protist. - 2006. - Sv. 157, č. 3. - S. 279-290. - doi : 10.1016/j.protis.2006.03.002 . — PMID 16730229 .
  144. Kusakin O. G. , Drozdov A. L.  Filema organického světa. Část 2. - Petrohrad. : Nauka , 1997. - 381 s. — ISBN 5-02-026018.  - S. 189, 193.
  145. 1 2 3 Seravin L. N.  Nejjednodušší ... Co to je? / Rev. vyd. Yu I. Polyansky . - L .: Nauka , 1984. - 176 s.  - S. 137-147.
  146. Freni S. Il mistero del lago di Tovel: leggenda e scienza a confronto per spiegare perchè le sue acque diventavano rosse . // Sitoweb MeteoWeb.eu (3.06.2014). Staženo: 5. srpna 2015.
  147. Fusco F. . Lago di Tovel // Vacanze sui laghi italiani . - Youcanprint, 2014. - 606 s. — ISBN 978-8-89-115824-6 .  - S. 283-286.

Literatura

V ruštině

  • Belyakova G. A., Dyakov Yu. T., Tarasov K. L. . Botanika: ve 4 svazcích T. 2. - M . : Nakladatelství. Centrum "Akademie", 2006. - 320 s. - ISBN 978-5-7695-2750-1 .
  • Mukhin V. A., Tretyakova A. S. . Biodiverzita: řasy a houby. — Rostov n/a. : Phoenix, 2013. - 269 s. — ISBN 978-5-222-20177-0 .
  • Yu. B. Okolodkov. Dinoflagellata // Protistové: Průvodce zoologií. Část 3 / kap. vyd. O. N. Pugačev . - Petrohrad. ; M. : Sdružení vědeckých publikací KMK, 2011. - 474 s. - ISBN 978-5-87317-809-4 .  — s. 7–94.
  • Ruppert E. E., Fox R. S., Barnes R. D. Zoologie bezobratlých: funkční a evoluční aspekty: ve 4 dílech T. 1. - M . : Izdat. Centrum "Akademie", 2008. - 496 s. - ISBN 978-5-7695-3493-5 .
  • Sedova T.V. Karyologie řas. - Petrohrad. : Nauka , 1996. - 386 s. — ISBN 5-02-026058-4 .
  • Houseman K., Hülsman N., Radek R. . Protistologie / Per. z angličtiny. S. A. Karpová. Ed. S. A. Korsuna. - M . : Sdružení vědeckých publikací KMK, 2010. - 495 s. - ISBN 978-5-87317-662-5 .
  • Shukanov A. S., Stefanovich A. I., Poliksenova V. D., Khramtsov A. K. . Algologie a mykologie. - Minsk: BGU , 2009. - 423 s. - ISBN 978-985-518-040-2 .

V angličtině

  • Carty S., Parrow M.W. Dinoflagelláty // Sladkovodní řasy Severní Ameriky: Ekologie a klasifikace. 2. vydání / Ed. autor: J. D. Wehr, R. G. Sheath, J. P. Kociolek. - San Diego: Elsevier , 2015. - xvi + 1050 s. — (Vodní ekologie). — ISBN 978-0-12-385876-4 .  - S. 773-807.
  • Lee R.E. Fyziologie. - New York: Cambridge University Press, 2008. - 561 s. - ISBN 978-0-521-68277-0 .
  • Margulis L. , Chapman M.J. Kingdoms & Domains: Ilustrovaný průvodce Phyla života na Zemi. 4. vydání . - W. H. Freeman and Company, 2009. - lxxii + 659 s. — ISBN 978-0-12-373621-5 .
  • Raven P. H., Evert R. F., Eichhorn S. E. . Biologie rostlin. 7. vydání. - New York: W. H. Freeman and Company Publishers, 2005. - 816 s. — ISBN 0-7167-1007-2 .
  • Steidinger K. A., Tangen K. . Dinoflagelláty // Identifikace mořského fytoplanktonu / Ed. od C. R. Thomase. - San Diego: Academic Press , 1997. - xv + 858 s. - ISBN 978-0-12-693018-4 .  - S. 387-584.

Odkazy