SEMA4D
Semafor 4D
|
---|
|
|
Symboly
| 4Dsema doména imunoglobulinová doména (Ig)transmembránová doména (TM) a krátká cytoplazmatická doména4DA8BB18semaforin-4DGR3SEMA4DCD100 antigen |
---|
Externí ID |
GeneCards:
|
---|
Druhy |
Člověk |
Myš |
---|
Entrez |
|
|
---|
Soubor |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (mRNA) |
| |
---|
RefSeq (protein) |
| |
---|
Locus (UCSC) |
n/a
| n/a
|
---|
Vyhledávání PubMed |
| n/a |
---|
Upravit (člověk) |
|
Semaforin-4D ( angl. Semaphorin-4D; SEMA4D; CD100 ) je membránový glykoprotein , receptor třídy semaforinů . Produkt lidského genu SEMA4D [1] . Receptor pro PLXNB1 a PLXNB2 [2] .
Struktura
SEMA4D se skládá z 862 aminokyselin a má molekulovou hmotnost 96,15 kDa. Interaguje se semaforinovým receptorem PLXNB1 a PLXNB2 [2] .
Funkce
SEMA4D je molekula zapojená do procesu axonálního vedení . Vylučován oligodendrocyty a vyvolává kolaps růstového kužele v centrálním nervovém systému . Vazbou na receptor PLXNB1 funguje jako protein Ras aktivující GTPázu a inhibuje růst axonů v centrálním nervovém systému dospělých [3] .
V imunitním systému se SEMA4D/CD100 váže na CD72 a aktivuje B-lymfocyty a dendritické buňky , ačkoli tato interakce není dobře pochopena [4] [5] .
Během hojení poranění kůže SEMA4D interaguje s PLXNB2 na povrchu γδ-T lymfocytů a hraje roli v procesu hojení [6] .
Lokalizace tkání
Protein je vysoce exprimován v kosterním svalstvu , lymfocytech periferní krve , slezině a brzlíku . Je detekován ve varlatech, mozku, ledvinách, tenkém střevě, prostatě, srdci, placentě, plicích a slinivce, chybí v tlustém střevě a játrech.
Poznámky
- ↑ Entrez Gen: SEMA4D sema doména, imunoglobulinová doména (Ig), transmembránová doména (TM) a krátká cytoplazmatická doména, (semaforin) 4D . (neurčitý)
- ↑ 1 2 Janssen BJ, Robinson RA, Pérez-Brangulí F, Bell CH, Mitchell KJ, Siebold C; a kol. (2010). „Strukturální základ semaforin-plexinové signalizace“ . příroda . 467 (7319): 1118-22. DOI : 10.1038/nature09468 . PMC 3587840 . PMID20877282 . _
- ↑ Ito Y, Oinuma I, Katoh H, Kaibuchi K, Negishi M (červenec 2006). „Sema4D/plexin-B1 aktivuje GSK-3β prostřednictvím aktivity R-Ras GAP, což vyvolává kolaps růstového kužele“ . Zprávy EMBO . 7 (7): 704-9. doi : 10.1038/sj.embor.7400737 . PMC 1500830 . PMID 16799460 .
- ↑ Kumanogoh A, Watanabe C, Lee I, Wang X, Shi W, Araki H, Hirata H, Iwahori K, Uchida J, Yasui T, Matsumoto M, Yoshida K, Yakura H, Pan C, Parnes JR, Kikutani H (listopad 2000). „Identifikace CD72 jako lymfocytárního receptoru pro semaforin třídy IV CD100: nový mechanismus pro regulaci signalizace B buněk“. Imunita . 13 (5): 621-31. DOI : 10.1016/S1074-7613(00)00062-5 . PMID 11114375 .
- ↑ Ishida I, Kumanogoh A, Suzuki K, Akahani S, Noda K, Kikutani H (srpen 2003). „Zapojení CD100, lymfocytárního semaforinu, do aktivace lidského imunitního systému prostřednictvím CD72: důsledky pro regulaci imunitních a zánětlivých reakcí“. Int. Immunol . 15 (8): 1027-34. doi : 10.1093/intimm/ dxg098 . PMID 12882840 .
- ↑ Deborah A. Witherden; Megumi Watanabe; Olivia Gario; Stephanie E Rieder; Gor Sarkisyan; Shane JF Cronin; Petra Verdino; Ian A. Wilson; Atsushi Kumanogoh; Hitoshi Kikutani; Luc Teyton; Wolfgang H. Fischer; Wendy L. Havran (srpen 2012). „Receptor CD100 interaguje se svým plexinovým B2 ligandem, aby reguloval funkci epidermálních γδ T buněk“ . Imunita . 37 (2): 314-25. DOI : 10.1016/j.immuni.2012.05.026 . PMC 3430606 . PMID22902232 . _
Literatura
- Bougeret C, Mansur IG, Dastot H a kol. (1992). "Zvýšená povrchová exprese nově identifikovaného 150-kDa dimeru brzy po aktivaci lidských T lymfocytů." J. Immunol . 148 (2): 318-23. PMID 1530858 .
- Hall KT, Boumsell L, Schultze JL a kol. (1996). "Lidský CD100, nový leukocytový semaforin, který podporuje agregaci a diferenciaci B-buněk . " Proč. Natl. Akad. sci. USA . 93 (21): 11780-5. DOI : 10.1073/pnas.93.21.11780 . PMC 38135 . PMID 8876214 .
- Herold C, Elhabazi A, Bismuth G a kol. (1997). „CD100 je spojen s CD45 na povrchu lidských T lymfocytů. Role v homotypické adhezi T buněk“. J. Immunol . 157 (12): 5262-8. PMID 8955171 .
- Furuyama T, Inagaki S, Kosugi A a kol. (1997). „Identifikace nového transmembránového semaforinu exprimovaného na lymfocytech“. J Biol. Chem . 271 (52): 33376-81. DOI : 10.1074/jbc.271.52.33376 . PMID 8969198 .
- Tamagnone L, Artigiani S, Chen H a kol. (1999). "Plexiny jsou velkou rodinou receptorů pro transmembránové, sekretované a GPI ukotvené semaforiny u obratlovců." buňka . 99 (1): 71-80. DOI : 10.1016/S0092-8674(00)80063-X . PMID 10520995 .
- Elhabazi A, Delaire S, Bensussan A, a kol. (2001). „Biologická aktivita rozpustného CD100. I. Extracelulární oblast CD100 se uvolňuje z povrchu T lymfocytů regulovanou proteolýzou“. J. Immunol . 166 (7): 4341-7. DOI : 10.4049/jimmunol.166.7.4341 . PMID 11254687 .
- Delaire S, Billard C, Tordjman R, a kol. (2001). „Biologická aktivita rozpustného CD100. II. Rozpustný CD100, podobně jako H-SemaIII, inhibuje migraci imunitních buněk. J. Immunol . 166 (7): 4348-54. DOI : 10.4049/jimmunol.166.7.4348 . PMID 11254688 .
- Vikis HG, Li W, Guan KL (2002). "Interakce Plexin-B1/Rac inhibuje aktivaci PAK a zvyšuje vazbu ligandu Sema4D . " GenesDev . 16 (7): 836-45. DOI : 10.1101/gad.966402 . PMC 186329 . PMID 11937491 .
- Granziero L, Circosta P, Scielzo C a kol. (2003). „Interakce CD100/Plexin-B1 udržují proliferaci a přežití normálních a leukemických CD5+ B lymfocytů“. Krev . 101 (5): 1962-9. DOI : 10.1182/blood-2002-05-1339 . PMID 12406905 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Vytváření a počáteční analýza více než 15 000 sekvencí lidské a myší cDNA v plné délce“ . Proč. Natl. Akad. sci. USA . 99 (26): 16899-903. DOI : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Izmailova E, Bertley FM, Huang Q a kol. (2003). "HIV-1 Tat přeprogramuje nezralé dendritické buňky tak, aby exprimovaly chemoatraktanty pro aktivované T buňky a makrofágy." Nat. Med . 9 (2): 191-7. DOI : 10,1038/nm822 . PMID 12539042 .
- Love CA, Harlos K, Mavaddat N a kol. (2003). "Ligand vázající tvář semaforinů odhalená krystalovou strukturou SEMA4D s vysokým rozlišením." Nat. Struktura. biol . 10 (10): 843-8. doi : 10.1038/ nsb977 . PMID 12958590 .
- Giraudon P, Vincent P, Vuaillat C, a kol. (2004). "Semaforin CD100 z aktivovaných T lymfocytů indukuje kolaps prodloužení procesu v oligodendrocytech a smrt nezralých nervových buněk." J. Immunol . 172 (2): 1246-55. DOI : 10.4049/jimmunol.172.2.1246 . PMID 14707103 .
- Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu NIH Full-Length cDNA: Sbírka savčích genů (MGC)“ . Genome Res . 14 (10B): 2121-7. DOI : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Deaglio S, Vaisitti T, Bergui L a kol. (2005). "CD38 a CD100 vedou síť povrchových receptorů přenášejících pozitivní signály pro růst a přežití B-CLL." Krev . 105 (8): 3042-50. doi : 10.1182/krev-2004-10-3873 . PMID 15613544 .
- Conrotto P, Valdembri D, Corso S, a kol. (2005). "Sema4D indukuje angiogenezi prostřednictvím náboru Met Plexinem B1." Krev . 105 (11): 4321-9. doi : 10.1182/blood-2004-07-2885 . PMID 15632204 .
- Basile JR, Afkhami T, Gutkind JS (2005). „Semaforin 4D/Plexin-B1 indukuje migraci endoteliálních buněk prostřednictvím aktivace PYK2, Src a dráhy fosfatidylinositol 3-kinázy-Akt“ . Mol. buňka. biol . 25 (16): 6889-98. DOI : 10.1128/MCB.25.16.6889-6898.2005 . PMC 1190270 . PMID 16055703 .
- Lewandrowski U, Moebius J, Walter U, Sickmann A (2006). „Objasnění míst N-glykosylace na proteinech lidských krevních destiček: glykoproteomický přístup“. Mol. buňka. Proteomika . 5 (2): 226-33. DOI : 10.1074/mcp.M500324-MCP200 . PMID 16263699 .
- Nkyimbeng-Takwi EH, Chapoval SP (2011). „Biologie a funkce neuroimunitních semaforinů 4A a 4D“ . Immunol. Res . 50 (1): 10-21. DOI : 10.1007/s12026-010-8201-y . PMC 3366695 . PMID 21203905 .
- Smith EP, Shanks K, Lipsky MM, DeTolla LJ, Keegan AD, Chapoval SP (2011). "Exprese neuroimunitních semaforinů 4A a 4D a jejich receptorů v plicích je zesílena alergenem a vaskulárním endoteliálním růstovým faktorem . " BMC Immunol . 12:30 DOI : 10.1186/ 1471-2172-12-30 . PMC 3118960 . PMID21595947 . _
- Shanks K, Nkyimbeng-Takwi EH, Smith EP, Lipsky MM, DeTolla LJ, Keegan AD, Chapoval SP (2013). „Neuroimunitní semaforin 4D je nezbytný pro optimální plicní alergický zánět“ . Mol. Immunol . 56 (4): 480-7. DOI : 10.1016/j.molimm.2013.05.228 . PMC 3783523 . PMID 23911404 .
Proteiny : Shluky diferenciace |
---|
1-50 |
- CD1 ( ac , 1A , 1D , 1E )
- CD2
- CD3 ( γ , δ , ε )
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 ( a )
- CD9
- CD10
- CD11 ( a , b , c , d )
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 ( A , B )
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 ( A , B )
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 ( a , b , c , d )
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 ( a , b , c , d , e , f )
- CD50
|
---|
51-100 |
- CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 ( E , L , P )
- CD63
- CD64 ( A , B , C )
- CD66 ( a , b , c , d , e , f )
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 ( a , b )
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 ( a , d , e , h , j , k )
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 |
|
---|
151-200 |
- CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 ( a , b , c )
- CD157
- CD158 ( a , d , e , i , k )
- CD159 ( a , c )
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 ( a , b )
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 ( a , b , g )
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 ( a , b )
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 |
|
---|
251-300 |
|
---|
301-350 |
|
---|
351-400 |
|
---|