CCR5

CCR5
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolCCR5  ; CC-CKR-5; CCCKR5; CCR-5; CD195; CKR-5; CKR5; CMKBR5; IDDM22
Externí IDOMIM:  601373 MGI :  88338 HomoloGene :  37325 GeneCards : CCR5 Gene
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez123412774
SouborENSG00000160791ENSMUSG00000079227
UniProtP51681P51682
RefSeq (mRNA)NM_000579NM_009917
RefSeq (protein)NP_000570NP_034047
Locus (UCSC)Chr 3:
46,41 – 46,42 Mb
Chr 9:
124,12 - 124,15 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]
CCR5

CCR5 receptor v membráně
Notový zápis
Symboly CCR5; ; CC-CKR-5; CCCKR5; CD195; CKR-5; CKR5; CMKBR5
Entrez Gene 1234
OMIM 601373
RefSeq NP_000570
UniProt P51681
Jiné údaje
Místo 3. hřeben , 3p
Informace ve Wikidatech  ?

CCR5 ( CC chemokinový receptor typu 5 ) je lidský  protein kódovaný genem CCR5 . CCR5 je členem podtřídy beta-chemokinových receptorů třídy integrálních membránových proteinů [1] .

Gen CCR5 se nachází na krátkém raménku 3. chromozomu .

CCR5 je adhezní protein a je to receptor spojený s G-proteinem . Protein CCR5 je syntetizován převážně T buňkami , makrofágy , dendritickými buňkami a mikrogliovými buňkami . CCR5 se zjevně účastní procesu zánětlivé reakce . Úloha tohoto proteinu v imunitní odpovědi však není zcela jasná.

Mutace CCR5-A32 , což je delece části genu CCR5 , je široce známá . Jednotlivci homozygotní pro tuto mutaci jsou imunní vůči HIV - 1 [2] .

CCR5-A32 mutace

CCR5-A32 (existují také varianty názvu CCR5-D32 a CCR5 delta 32 ) je genetická varianta CCR5, delece 32 párů bází , což vede k narušení adhezivních vlastností proteinu T-buněk CCR5, který je jím kódován. . Předpokládá se, že tato mutace vznikla asi před dvěma a půl tisíci lety a nakonec se rozšířila v Evropě [3] .

Delece části genu CCR5 vede k neschopnosti viru lidské imunodeficience (HIV) připojit se k T buňce . V heterozygotním stavu tato mutace výrazně snižuje možnost infekce buňky HIV, v homozygotním stavu zřejmě vede k úplné nemožnosti takové infekce [2] . Rozšíření mutace v Evropě, zejména v severní Evropě, může být spojeno se středověkými pandemiemi černé smrti , protože tato mutace zvyšuje odolnost těla vůči morovému bacilu [4] .

Přítomnost mutace CCR5-Δ32 v genotypu značně zvyšuje vnímavost organismu k západonilské horečce [5] . Navíc podle některých studií může mutace CCR5-Δ32 zvyšovat riziko rozvoje roztroušené sklerózy [6] .

Mutace CCR5-Δ32 v heterozygotním stavu se v Evropě vyskytuje s frekvencí 5–14 % [7] . Častější je v severní Evropě [7] . Studie ochranných genů HIV prokázala zvýšenou frekvenci CCR5-Δ32 u Rusů a Ukrajinců (asi 10-15 % má mutaci v jednom z chromozomů) [8] [9] . Nejvyšší frekvence CCR5-Δ32 na světě jsou pozorovány u Pomorů (až 33 %, z toho 3 % v homozygotním stavu) [8] . U Rusů obecně a Ukrajinců je frekvence této mutace v průměru 21 % [8] . Výskyt CCR5-Δ32 mimo Evropu je téměř nemožný, u všech mimoevropských etnik zcela chybí [7] (s výjimkou Shorů ).

Editace lidského genomu

V lednu 2019 čínské úřady potvrdily, že se v Shenzhenu narodili první geneticky modifikovaní lidé na světě, kteří měli gen CCR5 zodpovědný za interakci s HIV, a že biolog He Jiankui byl vyšetřován. Předpokládá se, že geneticky modifikované děti nebudou moci dostat HIV.

Poznámky

  1. Samson M, Labbe O, Mollereau C, Vassart G, Parmentier M. Molekulární klonování a funkční exprese nového genu lidského CC-chemokinového receptoru   // Biochemie . - 1996. - Sv. 35 , č. 11 . - S. 3362-3367 . - doi : 10.1021/bi952950g . — PMID 8639485 .
  2. 1 2 Samson M, Libert F, Doranz BJ, Rucker J, Liesnard C, et al. Odolnost vůči infekci HIV-1 u kavkazských jedinců nesoucích mutantní alely genu chemokinového receptoru CCR-5  (anglicky)  // Nature. - 1996. - Ne. 382 . - str. 722-725 . - doi : 10.1038/382722a0 . — PMID 8751444 .
  3. Stephens J a kol. Datování původu alely CCR5-Delta32 AIDS-rezistence koalescencí haplotypů  //  Am J Hum Genet. - 1998. - Sv. 62 , č. 6 . - S. 1507-1515 . Archivováno z originálu 25. června 2008.
  4. Philip W. Hedrick, Brian C. Verrelli. 'Ground pravda' pro výběr na CCR5-Δ32  //  Trendy v genetice. - 2006. - Sv. 22 , č. 6 . - str. 293-296 . - doi : 10.1016/j.tig.2006.04.007 . — PMID 16678299 .
  5. Glass WG, McDermott DH, Lim JK, Lekhong S, Yu SF, Frank WA, Pape J, Cheshier RC, Murphy PM. Deficit CCR5 zvyšuje riziko symptomatické infekce virem West Nile  //  J. Exp. Med.. - 2006. - Sv. 203 , č. 1 . - str. 35-40 . - doi : 10.1084/jem.20051970 . — PMID 16418398 .
  6. Irina Averyevna Nikolaeva et al. Polymorfismus delece genu receptoru pro chemokin 5 a riziko rozvoje roztroušené sklerózy v Jakutsku  // Yakut Medical Journal. - 2007. - č. 2 . - S. 10-12 .
  7. 1 2 3 Pardis C. Sabeti, Emily Walsh, Steve F. Schaffner, Patrick Varilly, Ben Fry, Holli B. Hutcheson, Mike Cullen, Tarjei S. Mikkelsen, Jessica Roy, Nick Patterson, Richard Cooper, David Reich, David Altshuler , Stephen O'Brien, Eric S. Lander. Případ pro výběr na CCR5-Delta32  //  PLoS Biology. - 2005. - Sv. 3 , ne. 11 . —P.e378 . _ - doi : 10.1371/journal.pbio.0030378 . — PMID 16248677 .
  8. 1 2 3 Kofiadi I. A. Genetická odolnost vůči infekci HIV a rozvoj AIDS v populacích Ruska a sousedních zemí  : Abstrakt. - Moskva, 2008. Archivováno 23. listopadu 2011.
  9. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9703433 Archivováno 22. května 2016 na Wayback Machine Hum Genet. červen 1998;102(6):695-8. Distribuce delece genu CCR5-delta 32 v ruské části Eurasie.

Odkazy