PDGFRB

PDGFRB ( Pelet -derived growth factor receptor beta; CD140b ;  EC 2.7.10.1 ) je membránový protein , receptorová tyrosinkináza , produkt lidského genu PDGFRB .

Gene

Gen PDGFRB se nachází na 5. lidském chromozomu v pozici q32 (5q32), obsahuje 25 exonů . Gen se nachází mezi geny receptoru GM-CSF a CSF1R v chromozomální oblasti, která může být ztracena v důsledku delece , což vede k rozvoji myelodysplastického 5q syndromu [1] . Mezi další genetické poruchy PDGFRB vedoucí k různým malignitám kostní dřeně patří malá delece a translokace způsobující fúzi genu PDGFRB s jedním z alespoň 30 genů, což vede k myeloproliferativní neoplazii s eozinofilií a souvisejícím poškozením orgánů s možnou progresí do agresivní leukémie [ 2] .

Struktura

PDGFRB  je protein z rodiny receptorových tyrosinkináz , patří do typu III této rodiny a je strukturně charakterizován přítomností 5 extracelulárních domén podobných imunoglobulinu, jediného membránového helikálního fragmentu a přilehlé intracelulární domény, ve které je doména tyrosinkinázy a C-konec proteinu jsou spojeny [3] . V nepřítomnosti ligandu je PDGFRβ v neaktivní konformaci, ve které aktivační smyčka uzavírá katalytické místo, zatímco místo vázané na membránu je umístěno na vrcholu smyčky, pokrývající aktivní místo, a kinázová doména je pokryta C-konec. Po navázání receptoru na ligand růstovým faktorem získaným z destiček se receptor dimerizuje, čímž se uvolní inhibovaná konformace v důsledku autofosforylace regulačního tyrosinu opačným monomerem. Tyrosiny na pozicích 857 a 751 jsou hlavními místy fosforylace během aktivace PDGFRβ [4] . Molekulová hmotnost zralého proteinu je 180 kDa.

Funkce a role v patologii

PDGFRB hraje důležitou roli ve vývoji cév. Delece genů PDGFRB nebo jeho ligandu , destičkového růstového faktoru PDGF-B, snižuje počet pericytů a buněk hladkého svalstva cév, a tím narušuje integritu a funkčnost mnoha orgánů, včetně mozku, srdce, ledvin , kůže a očí. 5] [6] [7] ] [8] .

In vitro buněčné studie ukázaly, že endoteliální buňky vylučují růstový faktor odvozený od destiček, který rekrutuje pericyty exprimující PDGFRβ, což stabilizuje vznikající krevní cévy [9] . Myši s pouze jednou alelou PDGFRBα vykazují řadu fenotypových změn, včetně snížené diferenciace buněk hladkého svalstva aorty a mozkových pericytů, stejně jako potlačenou diferenciaci adipocytů od pericytů a mezenchymálních buněk [10] . Dysregulace aktivity PDGFRβ kinázy (obvykle aktivace enzymů) hraje roli ve vývoji endemických onemocnění, jako je rakovina a kardiovaskulární onemocnění [11] [12] [13] .

Interakce

PDGFRβ interaguje s následujícími proteiny:

• CRK , [14]
• Caveolin 1 , [15]
• Grb2 , [16] [17] [18]
• NCK1 , [16] [19]
• NCK2 , [16] [20] [21]
• PDGFR-α , [22] [23]
• PTPN11 , [24] [25]
• RASA1 , [26] [27]
• SHC1 [28]
• SLC9A3R1 . [29]

Poznámky

1. ↑ PDGFRB destičkový receptor pro růstový faktor beta [Homo sapiens (člověk)] - Gen - NCBI . Získáno 10. února 2021. Archivováno z originálu dne 20. ledna 2022. (neurčitý)
2. ↑ Reiter A, Gotlib J (2017). „Myeloidní novotvary s eozinofilií“. Krev . 129 (6): 704-714. DOI : 10.1182/blood-2016-10-695973 . PMID28028030  . _
3. ↑ Heldin CH, Lennartsson J (srpen 2013). „Strukturální a funkční vlastnosti receptorů růstového faktoru pocházejícího z krevních destiček a faktoru kmenových buněk“ . Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii . 5 (8): a009100. doi : 10.1101/cshperspect.a009100 . PMC  3721287 . PMID23906712  . _
4. ↑ Kelly JD, Haldeman BA, Grant FJ, Murray MJ, Seifert RA, Bowen-Pope DF a kol. (květen 1991). „Platelet-derived growth factor (PDGF) stimuluje dimerizaci podjednotky receptoru PDGF a transfosforylaci mezi podjednotkami“. The Journal of Biological Chemistry . 266 (14): 8987-92. PMID  1709159 .
5. ↑ Soriano P (1994). „Abnormální vývoj ledvin a hematologické poruchy u myší s mutantem beta-receptoru PDGF“. Geny a vývoj . 8 (16): 1888-96. DOI : 10.1101/gad.8.16.1888 . PMID  7958864 .
6. ↑ Lindahl P, Johansson BR, Levéen P, Betsholtz C (1997). „Ztráta pericytů a tvorba mikroaneuryzmat u myší s deficitem PDGF-B“. věda . 277 (5323): 242-5. DOI : 10.1126/science.277.5323.242 . PMID  9211853 .
7. ↑ Lindahl P, Hellström M, Kalén M, Karlsson L, Pekny M, Pekna M, Soriano P, Betsholtz C (1998). „Parakrinní signalizace PDGF-B/PDGF-Rbeta řídí vývoj mezangiálních buněk v ledvinových glomerulech“. vývoj . 125 (17): 3313-22. PMID  9693135 .
8. ↑ Levéen P, Pekny M, Gebre-Medhin S, Swolin B, Larsson E, Betsholtz C (1994). "Myši s deficitem PDGF B vykazují renální, kardiovaskulární a hematologické abnormality." Geny a vývoj . 8 (16): 1875-87. DOI : 10.1101/gad.8.16.1875 . PMID  7958863 .
9. ↑ Darland DC, D'Amore PA (1999). „Zrání krevních cév: vaskulární vývoj přichází do věku“ . Journal of Clinical Investigation . 103 (2): 157-8. DOI : 10.1172/JCI6127 . PMC  407889 . PMID  9916126 .
10. ↑ Olson LE, Soriano P (2011). „Signalizace PDGFRβ reguluje plasticitu nástěnných buněk a inhibuje tvorbu tuku“ . vývojová buňka . 20 (6): 815-26. DOI : 10.1016/j.devcel.2011.04.019 . PMC  3121186 . PMID  21664579 .
11. ↑ Andrae J, Gallini R, Betsholtz C (2008). „Role růstových faktorů pocházejících z krevních destiček ve fyziologii a medicíně“ . Geny a vývoj . 22 (10): 1276-312. DOI : 10.1101/gad.1653708 . PMC2732412  . _ PMID  18483217 .
12. ↑ Heldin CH (2013). „Zacílení na signální dráhu PDGF v léčbě nádorů“ . Buněčná komunikace a signalizace . 11: 97. DOI : 10.1186/1478-811X - 11-97 . PMC  3878225 . PMID24359404  . _
13. ↑ Heldin CH (2014). „Zacílení na signální dráhu PDGF v léčbě nemaligních onemocnění“. Journal of Neuroimmune Pharmacology . 9 (2): 69-79. DOI : 10.1007/s11481-013-9484-2 . PMID  23793451 . S2CID  17343813 .
14. ↑ Matsumoto T, Yokote K, Take A, Takemoto M, Asaumi S, Hashimoto Y, Matsuda M, Saito Y, Mori S (duben 2000). "Diferenciální interakce adaptorového proteinu CrkII s alfa- a beta-receptory růstového faktoru krevních destiček je určena jeho vnitřní fosforylací tyrosinu." Biochem. Biophys. Res. komunální . 270 (1): 28-33. doi : 10.1006/bbrc.2000.2374 . PMID  10733900 .
15. ↑ Yamamoto M, Toya Y, Jensen RA, Ishikawa Y (březen 1999). "Kaveolin je inhibitorem signalizace receptoru růstového faktoru pocházejícího z krevních destiček." Exp. Cell Res . 247 (2): 380-8. DOI : 10.1006/excr.1998.4379 . PMID  10066366 .
16. ↑ 1 2 3 Braverman LE, Quilliam LA (únor 1999). "Identifikace Grb4/Nckbeta, adaptorového proteinu obsahujícího doménu homologie 2 a 3 src, který má podobné vazebné a biologické vlastnosti jako Nck." J Biol. Chem . 274 (9): 5542-9. DOI : 10.1074/jbc.274.9.5542 . PMID  10026169 .
17. ↑ Arvidsson AK, Rupp E, Nånberg E, Downward J, Rönnstrand L, Wennström S, Schlessinger J, Heldin CH, Claesson-Welsh L (říjen 1994). „Tyr-716 v inzertu kinázy beta-receptoru růstového faktoru odvozeného z krevních destiček se podílí na vazbě GRB2 a aktivaci Ras“ . Mol. buňka. biol . 14 (10): 6715-26. DOI : 10.1128/mcb.14.10.6715 . PMC  359202 . PMID  7935391 .
18. ↑ Tang J, Feng GS, Li W (říjen 1997). "Indukovaná přímá vazba adaptorového proteinu Nck na protein p62 aktivující GTPázu epidermálním růstovým faktorem." Onkogen . 15 (15): 1823-32. DOI : 10.1038/sj.onc.1201351 . PMID  9362449 .
19. ↑ Li W, Hu P, Školník EY, Ullrich A, Schlessinger J (prosinec 1992). „Protein Nck obsahující domény SH2 a SH3 je onkogenní a je společným cílem pro fosforylaci různými povrchovými receptory“ . Mol. buňka. biol . 12 (12): 5824-33. DOI : 10.1128/MCB.12.12.5824 . PMC  360522 . PMID  1333047 .
20. ↑ Chen M, She H, Davis EM, Spicer CM, Kim L, Ren R, Le Beau MM, Li W (září 1998). „Identifikace genů rodiny Nck, chromozomální lokalizace, exprese a signalizační specificita“. J Biol. Chem . 273 (39): 25171-8. DOI : 10.1074/jbc.273.39.25171 . PMID  9737977 .
21. ↑ Chen M, She H, Kim A, Woodley DT, Li W (listopad 2000). „Adaptér Nckbeta reguluje polymeraci aktinu ve fibroblastech NIH 3T3 v reakci na růstový faktor bb odvozený od krevních destiček“ . Mol. buňka. biol . 20 (21): 7867-80. DOI : 10.1128/mcb.20.21.7867-7880.2000 . PMC  86398 . PMID  11027258 .
22. ↑ Rupp E, Siegbahn A, Rönnstrand L, Wernstedt C, Claesson-Welsh L, Heldin CH (říjen 1994). "Unikátní místo autofosforylace v receptoru pro růstový faktor alfa z krevních destiček z heterodimerního receptorového komplexu." Eur. J Biochem . 225 (1): 29-41. DOI : 10.1111/j.1432-1033.1994.00029.x . PMID  7523122 .
23. ↑ Seifert RA, Hart CE, Phillips PE, Forstrom JW, Ross R, Murray MJ, Bowen-Pope DF (květen 1989). "Dvě různé podjednotky se spojují, aby vytvořily izoformně specifické receptory růstového faktoru odvozené od krevních destiček." J Biol. Chem . 264 (15): 8771-8. PMID  2542288 .
24. ↑ Keilhack H, Müller M, Böhmer SA, Frank C, Weidner KM, Birchmeier W, Ligensa T, Berndt A, Kosmehl H, Günther B, Müller T, Birchmeier C, Böhmer FD (leden 2001). "Negativní regulace signalizace tyrosinkinázy receptoru Ros." Epiteliální funkce proteinové tyrosinfosfatázy SHP-1 v doméně SH2 . J. Cell Biol . 152 (2): 325-34. DOI : 10.1083/jcb.152.2.325 . PMC2199605  . _ PMID  11266449 .
25. ↑ Lechleider RJ, Sugimoto S, Bennett AM, Kashishian AS, Cooper JA, Shoelson SE, Walsh CT, Neel BG (říjen 1993). „Aktivace fosfotyrosinfosfatázy SH-PTP2 obsahující SH2 jejím vazebným místem, fosfotyrosinem 1009, na receptoru růstového faktoru pocházejícího z lidských krevních destiček. J Biol. Chem . 268 (29): 21478-81. PMID  7691811 .
26. ↑ Farooqui T, Kelley T, Coggeshall KM, Rampersaud AA, Yates AJ (1999). „GM1 inhibuje časné signalizační události zprostředkované receptorem PDGF v kultivovaných lidských gliomových buňkách“. Anticancer Res . 19 (6B): 5007-13. PMID  10697503 .
27. ↑ Ekman S, Kallin A, Engström U, Heldin CH, Rönnstrand L (březen 2002). "SHP-2 se podílí na heterodimerní specifické ztrátě fosforylace Tyr771 v PDGF beta-receptoru." Onkogen . 21 (12): 1870-5. DOI : 10.1038/sj.onc.1205210 . PMID  11896619 .
28. ↑ Yokote K, Mori S, Hansen K, McGlade J, Pawson T, Heldin CH, Claesson-Welsh L (květen 1994). "Přímá interakce mezi Shc a beta-receptorem růstového faktoru krevních destiček." J Biol. Chem . 269 ​​(21): 15337-43. PMID  8195171 .
29. ↑ Maudsley S, Zamah AM, Rahman N, Blitzer JT, Luttrell LM, Lefkowitz RJ, Hall RA (listopad 2000). „Asociace receptoru růstového faktoru odvozeného z krevních destiček s regulačním faktorem výměníku Na(+)/H(+) potencuje aktivitu receptoru“ . Mol. buňka. biol . 20 (22): 8352-63. DOI : 10.1128/mcb.20.22.8352-8363.2000 . PMC  102142 . PMID  11046132 .

Literatura

• Harrod TR, Justement LB (2003). „Hodnocení funkce transmembránové protein tyrosin fosfatázy CD148 v biologii lymfocytů“. Immunol. Res . 26 (1-3): 153-66. DOI : 10.1385/IR:26:1-3:153 . PMID  12403354 . S2CID  26502472 .
• Jallal B, Mossie K, Vasiloudis G, Knyazev P, Zachwieja J, Clairvoyant F, Schilling J, Ullrich A (1997). "Receptoru podobná protein-tyrosin fosfatáza DEP-1 je konstitutivně spojena s 64-kDa protein serin/threonin kinázou." J Biol. Chem . 272 (18): 12158-63. DOI : 10.1074/jbc.272.18.12158 . PMID  9115287 .
• de la Fuente-García MA, Nicolás JM, Freed JH, Palou E, Thomas AP, Vilella R, Vives J, Gayá A (1998). "CD148 je membránová proteinová tyrozinfosfatáza přítomná ve všech hematopoetických liniích a podílí se na přenosu signálu na lymfocytech." Krev . 91 (8): 2800-9. DOI : 10.1182/krev.V91.8.2800.2800_2800_2809 . PMID  9531590 .
• Tangye SG, Phillips JH, Lanier LL, de Vries JE, Aversa G (1998). „CD148: protein tyrosin fosfatáza receptorového typu zapojená do regulace aktivace lidských T buněk“. J. Immunol . 161 (7): 3249-55. PMID  9759839 .
• Gross S, Knebel A, Tenev T, Neininger A, Gaestel M, Herrlich P, Böhmer FD (1999). „Inaktivace protein-tyrosin fosfatáz jako mechanismus přenosu signálu indukovaného UV zářením“. J Biol. Chem . 274 (37): 26378-86. DOI : 10.1074/jbc.274.37.26378 . PMID  10473595 .
• Autschbach F, Palou E, Mechtersheimer G, Rohr C, Pirotto F, Gassler N, Otto HF, Schraven B, Gaya A (2000). „Exprese membránového proteinu tyrosin fosfatázy CD148 v lidských tkáních“. tkáňové antigeny . 54 (5): 485-98. DOI : 10.1034/j.1399-0039.1999.540506.x . PMID  10599888 .
• Billard C, Delaire S, Raffoux E, Bensussan A, Boumsell L (2000). "Zapojte protein tyrosin fosfatázu spojenou s lidským CD100 semaforinem ve fázi terminální diferenciace B-buněk." Krev . 95 (3): 965-72. DOI : 10.1182/krev.V95.3.965.003k39_965_972 . PMID  10648410 .
• Kovalenko M, Denner K, Sandström J, Persson C, Gross S, Jandt E, Vilella R, Böhmer F, Ostman A (2000). "Místně selektivní defosforylace beta-receptoru růstového faktoru krevních destiček receptoru podobnou protein-tyrosin fosfatázou DEP-1." J Biol. Chem . 275 (21): 16219-26. DOI : 10.1074/jbc.275.21.16219 . PMID  10821867 .
• del Pozo V, Pirotto F, Cardaba B, Cortegano I, Gallardo S, Rojo M, Arrieta I, Aceituno E, Palomino P, Gaya A, Lahoz C (2000). Exprese CD148 na lidských eozinofilech: membránová tyrosin fosfatáza. Důsledky v efektorové funkci eozinofilů“. J. Leukoc. biol . 68 (1): 31-7. PMID  10914487 .
• Baker JE, Majeti R, Tangye SG, Weiss A (2001). „Proteinová tyrosinfosfatáza CD148-zprostředkovaná inhibice přenosu signálu receptorem T-buněk je spojena se sníženou fosforylací LAT a fosfolipázou Cy1“ . Mol. buňka. biol . 21 (7): 2393-403. DOI : 10.1128/MCB.21.7.2393-2403.2001 . PMC  86872 . PMID  11259588 .
• Persson C, Engström U, Mowbray SL, Ostman A (2002). "Primární sekvenční determinanty odpovědné za místně selektivní defosforylaci PDGF beta-receptoru proteinovou tyrosin fosfatázou DEP-1 podobnou receptoru." FEBS Lett . 517 (1-3): 27-31. DOI : 10.1016/S0014-5793(02)02570-X . PMID  12062403 . S2CID  13481032 .
• Ruivenenkamp CA, van Wezel T, Zanon C, Stassen AP, Vlček C, Csikos T, Klous AM, Tripodis N, Perrakis A, Boerrigter L, Groot PC, Lindeman J, Mooi WJ, Meijjer GA, Scholten G, Dauwerse H, Paces V, van Zandwijk N, van Ommen GJ, Demant P (2002). "Ptprj je kandidátem na myší lokus Scc1 náchylnosti na rakovinu tlustého střeva a je často vymazán u lidských rakovin." Nat. Genet . 31 (3): 295-300. DOI : 10.1038/ng903 . PMID  12089527 . S2CID  12338558 .
• Holsinger LJ, Ward K, Duffield B, Zachwieja J, Jallal B (2002). „Transmembránový receptor protein tyrosin fosfatázy DEP1 interaguje s p120(ctn)“. Onkogen . 21 (46): 7067-76. doi : 10.1038/sj.onc.1205858 . PMID  12370829 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (2003 ). „Vytváření a počáteční analýza více než 15 000 sekvencí lidské a myší cDNA v plné délce“ . Proč. Natl. Akad. sci. USA . 99 (26): 16899-903. DOI : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
• Dong HY, Shahsafaei A, Dorfman DM (2003). "CD148 a CD27 jsou exprimovány v B buněčných lymfomech odvozených z paměťových i naivních B lymfocytů." Leuk. Lymfom . 43 (9): 1855-8. DOI : 10.1080/1042819021000006385 . PMID  12685844 . S2CID  37520677 .
• Kellie S, Craggs G, Bird IN, Jones GE (2004). „Tyrosinfosfatáza DEP-1 indukuje cytoskeletální přestavby, aberantní interakce buňka-substrát a snížení buněčné proliferace“ (PDF) . J. Cell Science . 117 (Pt 4): 609-18. DOI : 10.1242/jcs.00879 . PMID  14709717 . S2CID  12250178 .
• Massa A, Barbieri F, Aiello C, Arena S, Pattarozzi A, Pirani P, Corsaro A, Iuliano R, Fusco A, Zona G, Spaziante R, Florio T, Schettini G (2004). "Exprese fosfotyrosinfosfatázy DEP-1/PTPeta určuje citlivost gliomových buněk na somatostatinovou inhibici buněčné proliferace." J Biol. Chem . 279 (28): 29004-12. DOI : 10.1074/jbc.M403573200 . PMID  15123617 .