Syndekan 1

Syndekan 1
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolSDC1  ; CD138; SDC; SYND1; syndekan
Externí IDOMIM:  186355 MGI :  1349162 HomoloGene :  2252 GeneCards : SDC1 Gene
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez638220969
SouborENSG00000115884ENSMUSG00000020592
UniProtP18827P18828
RefSeq (mRNA)NM_001006946NM_011519
RefSeq (protein)NP_001006947NP_035649
Locus (UCSC)Chr 2:
20,4 – 20,43 Mb
Chr 12:
8,77 – 8,79 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

Syndekan 1 ( anglicky  syndecan 1; CD138 ) je membránový protein , proteoglykan ze syndekanové rodiny nebo transmembránové proteoglykany heparansulfátu. Celkem byly popsány 4 proteiny této rodiny. Produkt lidského genu SDC1 .

Funkce

Protein je transmembránový heparansulfátový proteoglykan, člen syndekanové rodiny. Syndekany zprostředkovávají buněčnou vazbu, buněčnou signalizaci a organizaci cytoskeletu . Jsou to receptory pro protein Tat viru HIV . Syndekan 1 se účastní buněčné proliferace, buněčné migrace a buněčné interakce s proteiny extracelulární matrix. [jeden]

Struktura

Syndekan 1 nese řetězce heparansulfátu a chondroitinsulfátu , které zajišťují komunikaci mezi cytoskeletem a extracelulární matrix. Váže se na CDCP1 .

Štěpení ektodomény vede k vytvoření rozpustné formy proteinu. Ke štěpení může dojít působením heparanázy, trombinu a epidermálního růstového faktoru, stejně jako při stresu a při hojení ran.

Protein se skládá z 288 aminokyselin, molekulová hmotnost proteinové části je 32,5 kDa. Zahrnuje N-terminální extracelulární doménu (232 aminokyselin), jeden šroubovicový transmembránový fragment a malou cytosolovou oblast. Na extracelulární doméně je 6 glykosylačních míst : 3 místa pro připojení O -chondroitin sulfátového řetězce, 2 místa pro připojení O -heparansulfátového řetězce a 1 N -glykosylační místo . Cytosolový fragment obsahuje fosforylovaný tyrosin .

Aplikace

Syndecan 1 se používá jako marker pro plazmatické buňky [2] , pokud je známo, že buňky pocházejí z krvinek. [3]

Viz také

Poznámky

  1. Entrez Gene: SDC1 syndekan 1 .
  2. ↑ Rawstron AC Imunofenotypizace plazmatických buněk  (neopr.)  // Curr Protoc Cytom. - 2006. - Květen ( sv. Kapitola 6 ). — C. Jednotka6.23 . - ISBN 0-471-14295-6 . - doi : 10.1002/0471142956.cy0623s36 . — PMID 18770841 .
  3. O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS CD138 (syndekan-1), imunohistochemický profil markeru plazmatických buněk u hematopoetických a nehematopoetických novotvarů   // Am . J. Clin. Pathol.  : deník. - 2004. - únor ( roč. 121 , č. 2 ). - str. 254-263 . - doi : 10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L . — PMID 14983940 . Archivováno z originálu 9. června 2011.  (nedostupný odkaz)

Literatura

Odkazy