Syndekan 1
Syndekan 1 ( anglicky syndecan 1; CD138 ) je membránový protein , proteoglykan ze syndekanové rodiny nebo transmembránové proteoglykany heparansulfátu. Celkem byly popsány 4 proteiny této rodiny. Produkt lidského genu SDC1 .
Funkce
Protein je transmembránový heparansulfátový proteoglykan, člen syndekanové rodiny. Syndekany zprostředkovávají buněčnou vazbu, buněčnou signalizaci a organizaci cytoskeletu . Jsou to receptory pro protein Tat viru HIV . Syndekan 1 se účastní buněčné proliferace, buněčné migrace a buněčné interakce s proteiny extracelulární matrix. [jeden]
Struktura
Syndekan 1 nese řetězce heparansulfátu a chondroitinsulfátu , které zajišťují komunikaci mezi cytoskeletem a extracelulární matrix. Váže se na CDCP1 .
Štěpení ektodomény vede k vytvoření rozpustné formy proteinu. Ke štěpení může dojít působením heparanázy, trombinu a epidermálního růstového faktoru, stejně jako při stresu a při hojení ran.
Protein se skládá z 288 aminokyselin, molekulová hmotnost proteinové části je 32,5 kDa. Zahrnuje N-terminální extracelulární doménu (232 aminokyselin), jeden šroubovicový transmembránový fragment a malou cytosolovou oblast. Na extracelulární doméně je 6 glykosylačních míst : 3 místa pro připojení O -chondroitin sulfátového řetězce, 2 místa pro připojení O -heparansulfátového řetězce a 1 N -glykosylační místo . Cytosolový fragment obsahuje fosforylovaný tyrosin .
Aplikace
Syndecan 1 se používá jako marker pro plazmatické buňky [2] , pokud je známo, že buňky pocházejí z krvinek. [3]
Viz také
Poznámky
- ↑ Entrez Gene: SDC1 syndekan 1 . (neurčitý)
- ↑ Rawstron AC Imunofenotypizace plazmatických buněk (neopr.) // Curr Protoc Cytom. - 2006. - Květen ( sv. Kapitola 6 ). — C. Jednotka6.23 . - ISBN 0-471-14295-6 . - doi : 10.1002/0471142956.cy0623s36 . — PMID 18770841 .
- ↑ O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS CD138 (syndekan-1), imunohistochemický profil markeru plazmatických buněk u hematopoetických a nehematopoetických novotvarů // Am . J. Clin. Pathol. : deník. - 2004. - únor ( roč. 121 , č. 2 ). - str. 254-263 . - doi : 10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L . — PMID 14983940 . Archivováno z originálu 9. června 2011. (nedostupný odkaz)
Literatura
- Teng YH, Aquino RS, Park PW Molekulární funkce syndekanu-1 při onemocnění // Matrix Biol . : deník. - 2012. - Leden ( roč. 31 , č. 1 ). - str. 3-16 . - doi : 10.1016/j.matbio.2011.10.001 . — PMID 22033227 .
- Katz BZ Adhezní molekuly--životní linie buněk mnohočetného myelomu (anglicky) // Semin. Rakovina biol. : deník. - 2010. - Červen ( roč. 20 , č. 3 ). - S. 186-195 . - doi : 10.1016/j.semcancer.2010.04.003 . — PMID 20416379 .
- Bass MD, Morgan MR, Humphries MJ Syndecans se zbavují pověsti inertních molekul // Sci Signal : deník. - 2009. - březen ( ročník 2 , č. 64 ). — P. pe18 . - doi : 10.1126/scisignal.264pe18 . — PMID 19336838 .
Odkazy
Proteiny : Shluky diferenciace |
---|
1-50 |
- CD1 ( ac , 1A , 1D , 1E )
- CD2
- CD3 ( γ , δ , ε )
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 ( a )
- CD9
- CD10
- CD11 ( a , b , c , d )
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 ( A , B )
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 ( A , B )
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 ( a , b , c , d )
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 ( a , b , c , d , e , f )
- CD50
|
---|
51-100 |
- CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 ( E , L , P )
- CD63
- CD64 ( A , B , C )
- CD66 ( a , b , c , d , e , f )
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 ( a , b )
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 ( a , d , e , h , j , k )
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 |
|
---|
151-200 |
- CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 ( a , b , c )
- CD157
- CD158 ( a , d , e , i , k )
- CD159 ( a , c )
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 ( a , b )
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 ( a , b , g )
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 ( a , b )
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 |
|
---|
251-300 |
|
---|
301-350 |
|
---|
351-400 |
|
---|