B3GAT1
B3GAT1
|
---|
|
|
|
Symboly
| B3GAT1 , CD57, GLCATP, GLCUATP, HNK1, LEU7, NK-1, NK1, beta-1,3-glukuronyltransferáza 1 |
---|
Externí ID |
OMIM: 151290 MGI: 1924148 HomoloGene: 49551 GeneCards: 27087
|
---|
|
|
Více informací
|
Druhy |
Člověk |
Myš |
---|
Entrez |
|
|
---|
Soubor |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (mRNA) |
| |
---|
RefSeq (protein) |
| |
---|
Locus (UCSC) |
Chr 11: 134,38 – 134,41 Mb
| Chr 9: 26,65 – 26,67 Mb
|
---|
Vyhledávání PubMed |
[jeden]
| [2] |
---|
Upravit (člověk) | Upravit (myš) |
Galaktosylgalaktosylxylosylprotein 3-beta-glukuronosyltransferáza typu 1 ( galaktosylgalaktosylxylosylprotein 3-beta-glukuronosyltransferáza 1 ; B3GAT1 ; CD57) je enzym z rodiny glukuronosyltransferáz , produkt lidského genu B3GAT1 . Enzymová aktivita vytváří CD57 epitopy na povrchu jiných buněk [1] . V imunologii je antigen CD57 (HNK1, LEU7) epitop obsahující sulfoglukuronyl sacharidové zbytky spojené s několika adhezními proteiny nervového systému [2] .
Funkce
Genový protein B3GAT1 je členem rodiny glukuronosyltransferáz . Enzymy této rodiny mají vysokou akceptorovou specifitu, rozpoznávají neredukovatelné koncové skupiny cukrů a jejich anomerní vazby. Produkt genu B3GAT1 je klíčovým enzymem v reakci přenosu glukuronylu během biosyntézy sacharidového epitopu HNK-1/CD57 [1] .
V imunohistochemii
V anatomické patologii se epitop CD57, stejně jako jemu podobný CD56, používá v diferenciální diagnostice neuroendokrinních nádorů od nádorů jiného původu [3] . Epitop CD57 se nachází na 10-20 % lymfocytů, stejně jako na některých epiteliálních, neuronálních chromafinních buňkách. Na lymfocytech je epitop přítomen převážně na T-lymfocytech a přirozených zabíječských buňkách a obvykle se nachází na buňkách germinálních center lymfatických uzlin , mandlí a sleziny [4] .
Zvýšené hladiny CD57+ buněk se nacházejí v krvi pacientů po transplantaci, zejména transplantaci kostní dřeně, a pacientů s HIV , revmatoidní artritidou a Feltyho autoimunitním syndromem a některými dalšími nemocemi [4] .
Struktura
Produkt genu B3GAT1 se skládá z 334 aminokyselin a má molekulovou hmotnost 38,3 kDa. Aktivní centrum obsahuje Mn2 + .
Poznámky
- ↑ 1 2 Db=gen&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=27087 Entrez Gen: B3GAT1 beta-1,3-glukuronyltransferáza 1 (glukuronosyltransferáza P) . Archivováno z originálu 29. října 2012. (neurčitý)
- ↑ Mitsumoto Y., Oka S., Sakuma H., Inazawa J., Kawasaki T. Klonování a chromozomální mapování lidské glukuronyltransferázy zapojené do biosyntézy sacharidového epitopu HNK-1 // Genomics : journal. - Academic Press , 2000. - Duben ( roč. 65 , č. 2 ). - S. 166-173 . - doi : 10.1006/geno.2000.6152 . — PMID 10783264 .
- ↑ Wick, Mark R. Kapitola 11 - Imunohistologie mediastina // Diagnostická imunohistochemie: teranostické a genomické aplikace (anglicky) / Dabbs, David J.. - 3rd. - Philadelphia, PA: Saunders/Elsevier, 2010. - S. 345-346 . — ISBN 978-1-4160-5766-6 . - doi : 10.1016/B978-1-4160-5766-6.00015-7 .
- ↑ 1 2 Leong, Anthony S.-Y.; Cooper, Kumarasen; Leong, F. Joel W.-M. Manuál diagnostických protilátek pro imunohistologii (anglicky) . — 2. - London: Greenwich Medical Media, 2003. - S. 131-134 . - ISBN 978-1-84110-100-2 .
Literatura
- Andersson B., Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W., Gibbs RA Metoda „dvojitého adaptéru“ pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic // Analytical Biochemistry : deník. - 1996. - Duben ( roč. 236 , č. 1 ). - str. 107-113 . - doi : 10.1006/abio.1996.0138 . — PMID 8619474 .
- Yu W., Andersson B., Worley KC, Muzny DM, Ding Y., Liu W., Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G., Gibbs RA Velké zřetězení cDNA sekvenování // Genome Research : deník. - 1997. - Duben ( díl 7 , č. 4 ). - str. 353-358 . - doi : 10.1101/gr.7.4.353 . — PMID 9110174 .
- Tone Y., Kitagawa H., Imiya K., Oka S., Kawasaki T., Sugahara K. Charakterizace rekombinantní lidské glukuronyltransferázy I zapojené do biosyntézy glykosaminoglykan-proteinové vazebné oblasti proteoglykanů // FEBS Letters : deník. - 1999. - říjen ( roč. 459 , č. 3 ). - str. 415-420 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)01287-9 . — PMID 10526176 .
- Mitsumoto Y., Oka S., Sakuma H., Inazawa J., Kawasaki T. Klonování a chromozomální mapování lidské glukuronyltransferázy zapojené do biosyntézy sacharidového epitopu HNK-1 // Genomics : journal. - Academic Press , 2000. - Duben ( roč. 65 , č. 2 ). - S. 166-173 . - doi : 10.1006/geno.2000.6152 . — PMID 10783264 .
- Pedersen LC, Tsuchida K., Kitagawa H., Sugahara K., Darden TA, Negishi M. Biosyntéza heparanu/chondroitin sulfátu. Struktura a mechanismus lidské glukuronyltransferázy I (anglicky) // The Journal of Biological Chemistry : časopis. - 2000. - Listopad ( roč. 275 , č. 44 ). - S. 34580-34585 . - doi : 10.1074/jbc.M007399200 . — PMID 10946001 .
- Cebo C., Durier V., Lagant P., Maes E., Florea D., Lefebvre T., Strecker G., Vergoten G., Zanetta JP Funkce a molekulární modelování interakce mezi lidským interleukinem 6 a jeho HNK-1 oligosacharidové ligandy (anglicky) // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Duben ( roč. 277 , č. 14 ). - S. 12246-12252 . - doi : 10.1074/jbc.M106816200 . — PMID 11788581 .
- Ouzzine M., Gulberti S., Levoin N., Netter P., Magdalou J., Fournel-Gigleux S. Substrátová specificita donoru lidské beta 1,3-glukuronosyltransferázy I vůči UDP-glukuronové kyselině je určena dvěma klíčovými histidinem a argininové zbytky (anglicky) // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Červenec ( roč. 277 , č. 28 ). - S. 25439-25445 . - doi : 10.1074/jbc.M201912200 . — PMID 11986319 .
- Brenchley JM, Karandikar NJ, Betts MR, Ambrozak DR, Hill BJ, Crotty LE, Casazza JP, Kuruppu J., Migueles SA, Connors M., Roederer M., Douek DC, Koup RA Exprese CD57 definuje replikativní senescenci a antigen- indukovala apoptotickou smrt CD8+ T buněk // Krev : deník. — Americká hematologická společnost, 2003. - Duben ( roč. 101 , č. 7 ). - str. 2711-2720 . - doi : 10.1182/krev-2002-07-2103 . — PMID 12433688 .
- Jirásek T., Hozák P., Mandys V. Různé vzory exprese chromograninu A a Leu-7 (CD57) v gastrointestinálních karcinoidech: studie imunohistochemické a konfokální laserové skenovací mikroskopie (anglicky) // Neoplasma : journal. - 2003. - Sv. 50 , č. 1 . - str. 1-7 . — PMID 12687271 .
- Jeffries AR, Mungall AJ, Dawson E., Halls K., Langford CF, Murray RM, Dunham I., Powell JF gen beta-1,3-glukuronyltransferázy-1 implikovaný jako kandidát na psychózu podobnou schizofrenii prostřednictvím molekulární analýzy vyvážená translokace // Molekulární psychiatrie : deník. - 2003. - Červenec ( roč. 8 , č. 7 ). - str. 654-663 . - doi : 10.1038/sj.mp.4001382 . — PMID 12874601 .
- Chochi K., Ichikura T., Majima T., Kawabata T., Matsumoto A., Sugasawa H., Kawarabayashi N., Takayama E., Hiraide H., Seki S., Mochizuki H. Zvýšení CD57+ T buněk v periferní krev a jejich narušené imunitní funkce u pacientů s pokročilým karcinomem žaludku // Oncology Reports : deník. - 2004. - Sv. 10 , č. 5 . - S. 1443-1448 . doi : 10.3892 / or.10.5.1443 . — PMID 12883721 .
- Kakuda S., Shiba T., Ishiguro M., Tagawa H., Oka S., Kajihara Y., Kawasaki T., Wakatsuki S., Kato R. Strukturní základ pro rozpoznání akceptorového substrátu lidské glukuronyltransferázy, GlcAT-P, enzym rozhodující pro biosyntézu sacharidového epitopu HNK-1 (anglicky) // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2004. - Květen ( roč. 279 , č. 21 ). - S. 22693-22703 . - doi : 10.1074/jbc.M400622200 . — PMID 14993226 .
- Matsubara K., Yura K., Hirata T., Nigami H., Harigaya H., Nozaki H., Fukaya T., Baba K. Akutní lymfoblastická leukémie s koexpresí CD56 a CD57: kazuistika // Dětská hematologie a onkologie : deník. - 2005. - Sv. 21 , č. 7 . - str. 677-682 . - doi : 10.1080/08880010490501105 . — PMID 15626024 .
- Ibegbu CC, Xu YX, Harris W., Maggio D., Miller JD, Kourtis AP Exprese lektinu podobného receptoru G1 zabíječských buněk na antigen-specifických lidských CD8+ T lymfocytech během aktivní, latentní a vyřešené infekce a její vztah k CD57 ( anglicky) // Journal of Immunology : deník. - 2005. - Květen ( roč. 174 , č. 10 ). - S. 6088-6094 . - doi : 10.4049/jimmunol.174.10.6088 . — PMID 15879103 .
- Assouti M., Vynios DH, Anagnostides ST, Papadopoulos G., Georgakopoulos CD, Gartaganis SP Kolagen typu IX a epitop HNK-1 v slzách pacientů se syndromem pseudoexfoliace // Biochimica et Biophysica Acta : deník. - 2006. - leden ( roč. 1762 , č. 1 ). - S. 54-8 . - doi : 10.1016/j.bbadis.2005.09.005 . — PMID 16257185 .
- Barré L., Venkatesan N., Magdalou J., Netter P., Fournel-Gigleux S., Ouzzine M. Důkaz vápníkově závislé dráhy v regulaci genové exprese lidské beta1,3-glukuronosyltransferázy-1 (GlcAT-I) : klíčový enzym v syntéze proteoglykanů // The FASEB Journal : deník. — Federace amerických společností pro experimentální biologii, 2006. - srpen ( roč. 20 , č. 10 ). - S. 1692-1694 . - doi : 10.1096/fj.05-5073fje . — PMID 16807373 .
- Sada-Ovalle I., Torre-Bouscoulet L., Valdez-Vázquez R., Martínez-Cairo S., Zenteno E., Lascurain R. Charakterizace cytotoxické podskupiny CD57+ T buněk od pacientů s plicní tuberkulózou // - 2006. - prosinec ( roč. 121 , č. 3 ). - str. 314-323 . - doi : 10.1016/j.clim.2006.08.011 . — PMID 17035093 .
Proteiny : Shluky diferenciace |
---|
1-50 |
- CD1 ( ac , 1A , 1D , 1E )
- CD2
- CD3 ( γ , δ , ε )
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 ( a )
- CD9
- CD10
- CD11 ( a , b , c , d )
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 ( A , B )
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 ( A , B )
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 ( a , b , c , d )
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 ( a , b , c , d , e , f )
- CD50
|
---|
51-100 |
- CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 ( E , L , P )
- CD63
- CD64 ( A , B , C )
- CD66 ( a , b , c , d , e , f )
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 ( a , b )
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 ( a , d , e , h , j , k )
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 |
|
---|
151-200 |
- CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 ( a , b , c )
- CD157
- CD158 ( a , d , e , i , k )
- CD159 ( a , c )
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 ( a , b )
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 ( a , b , g )
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 ( a , b )
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 |
|
---|
251-300 |
|
---|
301-350 |
|
---|
351-400 |
|
---|