HAVCR1
HAVCR1
|
---|
|
|
|
Symboly
| HAVCR1 , HAVCR, HAVCR-1, KIM-1, KIM1, TIM, TIM-1, TIM1, TIMD-1, TIMD1, CD365, buněčný receptor 1 viru hepatitidy A |
---|
Externí ID |
OMIM: 606518 HomoloGene: 134424 GeneCards: 26762
|
---|
|
|
Více informací
|
Druhy |
Člověk |
Myš |
---|
Entrez |
|
|
---|
Soubor |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (mRNA) |
| |
---|
RefSeq (protein) |
| |
---|
Locus (UCSC) |
Chr 5: 157,03 – 157,06 Mb
| n/a
|
---|
Vyhledávání PubMed |
[jeden]
| n/a |
---|
Upravit (člověk) |
|
HAVCR1 neboli TIM-1 ( anglicky Hepatitis A virus cellular receptor 1 , nebo anglicky T-cell immunoglobulin and mucin domain 1 (TIM-1) ) je membránový protein , produkt genu HAVCR1 [1] [2] [3 ] . Člen rodiny proteinů TIM (T buněčná transmembrána, imunoglobulin a mucin), které hrají kritickou roli při regulaci aktivity imunitních buněk, zejména v reakci na virovou infekci. Rodina zahrnuje 8 genů (od TIM-1 po TIM-8), z nichž 3 jsou přítomny u lidí: TIM-1, TIM-3 a TIM-4 . Kromě toho se protein podílí na procesech alergické reakce, astmatu a transplantační tolerance.
Funkce
Proteiny rodiny TIM jsou glykoproteiny buněčného povrchu, které obsahují doménu podobnou imunoglobulinu , mucinovou doménu určité délky, jednu transmembránovou doménu a krátký C-koncový cytoplazmatický fragment.
TIM-1 je exprimován převážně na Th2 buňkách a působí jako stimulační molekula v procesu aktivace T-lymfocytů [4] . TIM-3 se nachází na buňkách Th1 a Tc1 a funguje jako inhibiční protein, který zprostředkovává apoptózu těchto buněk [5] . TIM-4 je přítomen na buňkách prezentujících antigen a moduluje fagocytózu apoptotických buněk interakcí s fosfatidylserinem buněčné membrány apoptotických buněk [6] .
Struktura
Protein se skládá z 364 aminokyselin, molekulová hmotnost je 39,25 kDa. Je to membránový protein obsahující jednu transmembránovou oblast. Obsahuje imunoglobulinovou doménu typu V a doménu s 12 aminokyselinovými repeticemi (VPTTTT).
Poznámky
- ↑ Feigelstock D., Thompson P., Mattoo P., Zhang Y., Kaplan GG Lidský homolog HAVcr-1 kóduje buněčný receptor viru hepatitidy A // Journal of Virology : deník. - 1998. - srpen ( roč. 72 , č. 8 ). - str. 6621-6628 . — PMID 9658108 .
- ↑ McIntire JJ, Umetsu SE, Akbari O., Potter M., Kuchroo VK, Barsh GS, Freeman GJ, Umetsu DT, DeKruyff RH Identifikace Tapr (regulační lokus hyperreaktivity dýchacích cest) a spojené genové rodiny Tim / / Nature Immunology : časopis. - 2001. - Listopad ( vol. 2 , č. 12 ). - S. 1109-1116 . doi : 10.1038 / ni739 . — PMID 11725301 .
- ↑ Entrez Gen: HAVCR1 buněčný receptor viru hepatitidy A 1 . (neurčitý)
- ↑ Umetsu SE, Lee WL, McIntire JJ, Downey L., Sanjanwala B., Akbari O., Berry GJ, Nagumo H., Freeman GJ, Umetsu DT, DeKruyff RH TIM-1 indukuje aktivaci T buněk a inhibuje vývoj periferních tolerance (anglicky) // Nature Immunology : journal. - 2005. - Květen ( roč. 6 , č. 5 ). - str. 447-454 . - doi : 10.1038/ni1186 . — PMID 15793575 .
- ↑ Zhu C., Anderson AC, Schubart A., Xiong H., Imitola J., Khoury SJ, Zheng XX, Strom TB, Kuchroo VK Ligand Tim-3 galektin-9 negativně reguluje imunitu T helper typu 1 // Nature Immunology : deník. - 2005. - prosinec ( vol. 6 , č. 12 ). - S. 1245-1252 . doi : 10.1038 / ni1271 . — PMID 16286920 .
- ↑ Kobayashi N., Karisola P., Peña-Cruz V., Dorfman DM, Jinushi M., Umetsu SE, Butte MJ, Nagumo H., Chernova I., Zhu B., Sharpe AH, Ito S., Dranoff G. , Kaplan GG, Casasnovas JM, Umetsu DT, Dekruyff RH, Freeman GJ Glykoproteiny TIM-1 a TIM-4 vážou fosfatidylserin a zprostředkovávají vychytávání apoptotických buněk (anglicky) // Immunity: journal. - Cell Press , 2007. - Prosinec ( roč. 27 , č. 6 ). - S. 927-940 . - doi : 10.1016/j.immuni.2007.11.011 . — PMID 18082433 .
Literatura
- Kumanogoh A., Kikutani H. Imunitní semaforiny: nová oblast výzkumu semaforinů // Journal of Cell Science : deník. — Společnost biologů, 2004. - Sv. 116 , č. Pá 17 . - S. 3463-3470 . - doi : 10.1242/jcs.00674 . — PMID 12893810 .
- McIntire JJ, Umetsu DT, DeKruyff RH TIM-1, nový gen pro náchylnost k alergii a astmatu (anglicky) // Springer Seminars in Immunopathology: journal. - 2004. - Sv. 25 , č. 3-4 . - str. 335-348 . - doi : 10.1007/s00281-003-0141-3 . — PMID 15007635 .
- Thompson P., Lu J., Kaplan GG Oblast bohatá na Cys buněčného receptoru 1 viru hepatitidy A je nutná pro vazbu viru hepatitidy A a ochranné monoklonální protilátky 190/4 // Journal of Virology : deník. - 1998. - Sv. 72 , č. 5 . - str. 3751-3761 . — PMID 9557657 .
- Bailly V., Zhang Z., Meier W., Cate R., Sanicola M., Bonventre JV Vylučování molekuly poškození ledvin-1, domnělý adhezivní protein zapojený do regenerace ledvin // Journal of Biological Chemistry : journal . - 2002. - Sv. 277 , č.p. 42 . - str. 39739-39748 . - doi : 10.1074/jbc.M200562200 . — PMID 12138159 .
- Noguchi E., Nakayama J., Kamioka M., Ichikawa K., Shibasaki M., Arinami T. Polymorfismy kódující inzerci/deleci u hHAVcr-1 nejsou spojeny s atopickým astmatem v japonské populaci (anglicky) // Geny a imunita : deník. - 2003. - Sv. 4 , ne. 2 . - S. 170-173 . - doi : 10.1038/sj.gene.6363935 . — PMID 12618867 .
- McIntire JJ, Umetsu SE, Macaubas C., Hoyte EG, Cinnioglu C., Cavalli-Sforza LL, Barsh GS, Hallmayer JF, Underhill PA, Risch NJ, Freeman GJ, DeKruyff RH, Umetsu DT Immunology: virus hepatitidy A odkaz na nemoc (anglicky) // Nature: journal. - 2003. - Sv. 425 , č.p. 6958 . — S. 576 . - doi : 10.1038/425576a . - . — PMID 14534576 .
- Chae SC, Song JH, Heo JC, Lee YC, Kim JW, Chung HT Molekulární variace v promotorových a kódujících oblastech lidského genu Tim-1 a jejich asociace u Korejců s astmatem // Human Immunology : deník. - 2004. - Sv. 64 , č. 12 . - S. 1177-1182 . - doi : 10.1016/j.humimm.2003.09.011 . — PMID 14630400 .
- Chae SC, Song JH, Lee YC, Kim JW, Chung HT Asociace variací exonu 4 genu Tim-1 s alergickými onemocněními v korejské populaci // Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - 2004. - Sv. 312 , č.p. 2 . - S. 346-350 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2003.10.125 . — PMID 14637143 .
- Vilà MR, Kaplan GG, Feigelstock D., Nadal M., Morote J., Porta R., Bellmunt J., Meseguer A. Receptor viru hepatitidy A blokuje buněčnou diferenciaci a je nadměrně exprimován u jasného buněčného renálního karcinomu / Kidney International : deník. - 2004. - Sv. 65 , č. 5 . - S. 1761-1773 . - doi : 10.1111/j.1523-1755.2004.00601.x . — PMID 15086915 .
- Mesri M., Smithson G., Ghatpande A., Chapoval A., Shenoy S., Boldog F., Hackett C., Pena CE, Burgess C., Bendele A., Shimkets RA, Starling GC Inhibice in vitro a in vivo reakce T buněk rekombinantními lidskými proteiny extracelulární domény Tim-1 (anglicky) // International Immunology : deník. - 2006. - Sv. 18 , č. 3 . - str. 473-484 . - doi : 10.1093/intimm/dxh388 . — PMID 16481347 .
- Lim J., Hao T., Shaw C., Patel AJ, Szabó G., Rual JF, Fisk CJ, Li N., Smolyar A., Hill DE, Barabási AL, Vidal M., Zoghbi HY A protein- proteinová interakční síť pro dědičné humanizované ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 2006. - Vol. 125 , č. 4 . - S. 801-814 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . — PMID 16713569 .
- Kotsis F., Nitschke R., Boehlke C., Bashkurov M., Walz G., Kuehn EW Signalizace ciliárního vápníku je modulována molekulou poškození ledvin-1 (Kim1 ) // Pflügers Archiv : deník. - 2007. - Sv. 453 , č.p. 6 . - S. 819-829 . - doi : 10.1007/s00424-006-0168-0 . — PMID 17205356 .
Proteiny : Shluky diferenciace |
---|
1-50 |
- CD1 ( ac , 1A , 1D , 1E )
- CD2
- CD3 ( γ , δ , ε )
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 ( a )
- CD9
- CD10
- CD11 ( a , b , c , d )
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 ( A , B )
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 ( A , B )
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 ( a , b , c , d )
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 ( a , b , c , d , e , f )
- CD50
|
---|
51-100 |
- CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 ( E , L , P )
- CD63
- CD64 ( A , B , C )
- CD66 ( a , b , c , d , e , f )
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 ( a , b )
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 ( a , d , e , h , j , k )
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 |
|
---|
151-200 |
- CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 ( a , b , c )
- CD157
- CD158 ( a , d , e , i , k )
- CD159 ( a , c )
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 ( a , b )
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 ( a , b , g )
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 ( a , b )
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 |
|
---|
251-300 |
|
---|
301-350 |
|
---|
351-400 |
|
---|