Integrin alfa-5

Integrin alfa-5
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolITGA5  ; CD49e; FNRA; VLA5A
Externí IDOMIM:  135620 MGI :  96604 HomoloGene :  20508 ChEMBL : 3955 GeneCards : ITGA5 Gene
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez367816402
SouborENSG00000161638ENSMUSG00000000555
UniProtP08648P11688
RefSeq (mRNA)NM_002205NM_010577
RefSeq (protein)NP_002196NP_034707
Locus (UCSC)Chr 12:
54,79 – 54,81 Mb
Chr 15:
103,34 – 103,37 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]


Integrin alfa-5 (α5, CD49e ) je membránový protein , glykoprotein ze superrodiny integrinů , produkt genu ITGA5 , alfa podjednotka integrinu α5β1 ( VLA-5 ), jednoho z hlavních fibronektinových receptorů . Hraje roli v mezibuněčných interakcích.

Funkce

Integrin alfa-5/ beta-1 (α5β1, anglicky  very late antigen-5 , VLA-5 ) je receptor pro fibronektin a fibrinogen . Rozpoznává specifickou aminokyselinovou sekvenci glycin-prolin-arginin (RGD) v široké škále ligandů. Během infekce HIV interakce s virovým peptidem Tat zesiluje angiogenezi u Kaposiho sarkomu [1] .

Interaguje s intracelulárními proteiny HPS5 , NISCH , stejně jako s RAB21 a COMP. Váže se na Tat peptid viru HIV-1.

Struktura

Integrin alfa-5 je velký protein, sestává z 1008 aminokyselin , molekulová hmotnost proteinové části je 114,5 kDa . N-terminální oblast (954 aminokyselin) je extracelulární, následovaná jedním transmembránovým fragmentem a krátkým intracelulárním fragmentem (28 aminokyselin). Extracelulární fragment obsahuje 7 FG-GAP repetic, motiv SG1 zapojený do interakce s chondroitin sulfáty a 5 až 15 N-glykosylačních míst . Cytosolové místo zahrnuje motiv GFFKR a vazebné místo HPS5.

V procesu omezené proteolýzy dochází k hydrolýze intramolekulární vazby a vzniku těžkých a lehkých řetězců spojených disulfidovou vazbou [2] .

Poznámky

  1. Záznam databáze Uniprot pro CD49e (přístupové číslo P08648) . Získáno 21. února 2012. Archivováno z originálu 2. února 2017.
  2. Entrez Gen: ITGA5 integrin, alfa 5 (fibronektinový receptor, alfa polypeptid) .

Viz také

Bibliografie

Odkazy