DDR1

DDR1
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolDDR1  ; CAK; CD167; DDR; EDDR1; HGK2; MCK10; NEP; NTRK4; PTK3; PTK3A; RTK6; TRKE
Externí IDOMIM:  600408 MGI :  99216 HomoloGene :  68212 ChEMBL : 5319 GeneCards : DDR1 Gene
EC číslo2.7.10.1
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez78012305
SouborENSG00000137332ENSMUSG00000003534
UniProtQ08345Q03146
RefSeq (mRNA)NM_001202521NM_001198831
RefSeq (protein)NP_001189450NP_001185760
Locus (UCSC)Chr 6:
30,84 – 30,87 Mb
Chr 17:
35,68 – 35,7 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

DDR1 ( discoidin  domain receptor tyrosin kinase 1 ; CD167a , EC 2.7.10.1 ) je membránový protein , enzym z nadrodiny receptorových tyrosin kináz , produkt genu DDR1 .

DDR1 je součástí skupiny receptorů, které obsahují doménu homologní s proteinem discoidin 1 z Dictyostelium discoideum .

Funkce

Receptor DDR1 hraje roli v mezibuněčných interakcích a rozpoznávání. [1] Interakce mezi leukocytárním DDR1 a kolagenem usnadňuje adhezi, migraci, diferenciaci/zrání leukocytů a jejich produkci cytokinů a chemokinů . [2]

Struktura

DDR1 je velký protein, sestává z 895 aminokyselin , molekulová hmotnost proteinové části je 101,1 kDa . N-terminální oblast (398 aminokyselin) je extracelulární, následovaná jedním transmembránovým fragmentem a intracelulárním fragmentem (470 aminokyselin). Extracelulární fragment obsahuje 4 N-glykosylační místa . Cytosolové místo zahrnuje proteinkinázovou doménu, ATP -vazebné místo , 4 autofosforylované tyrosiny a motiv PPxY .

Receptor interaguje s WWC1 (přes WW domény), vstupuje do trimolekulárního komplexu s proteiny WWC1 a PRKCZ (obvykle ve stavu bez kolagenu).

V důsledku alternativního sestřihu se vytvoří 5 proteinových izoforem.

Katalytická aktivita

Intracelulární proteinkinázová doména fosforyluje své vlastní tyrosinové zbytky a přenáší fosfátovou skupinu z ATP na hydroxylovou skupinu aminokyseliny. Autofosforylace nastává, když DDR1 interaguje s kolageny typu I-VI.

Tkáňová specifičnost

Protein je exprimován v malé míře na epiteliálních buňkách většiny tkání, maximální exprese je pozorována v mozku , plicích, placentě a ledvinách. Vysoký stupeň exprese se nachází v mnoha buněčných liniích karcinomu, zejména v buňkách rakoviny prsu. Nepřítomný v pojivové tkáni, na endoteliálních buňkách, v tukové a svalové tkáni a na buňkách krvetvorby.

Viz také

Poznámky

  1. Záznam databáze Uniprot pro CD11a (přístupové číslo Q08345) . Získáno 17. dubna 2012. Archivováno z originálu dne 28. srpna 2017.
  2. Yoshimura T., Matsuyama W., Kamohara H. Diskoidinový doménový receptor 1: nová třída interakce regulačního receptoru leukocyt-kolagen   // Immunol . Res. : deník. - 2005. - Sv. 31 , č. 3 . - S. 219-230 . - doi : 10.1385/IR:31:3:219 . — PMID 15888913 .

Bibliografie

Odkazy